上海南方基因科技有限公司

FLX、Illumin hiseq、Illumin iScan

基本信息

• 中文名稱：上海南方基因科技有限公司

公司簡介

上海南方基因科技有限公司成立於2003年9月，公司由上海生物晶片有限公司、國家人類基因組南方研究中心、上海創業投資有限公司共同出資組建而成。
公司位於上海浦東張江高科技園區生物醫藥產業基地，總投資3900萬元人民幣。公司管理團隊由具有豐富經驗的海外歸國人員和國內技術骨幹組成。

公司自成立以來，以基因表達分析，基因分型，抗體篩選為核心的分子生物學研究綜合技術服務體系，逐步建成基因組學部、細胞工程和蛋白藥物研發部、生物信息學部等核心的技術服務和產品研發部門。與國內外工業界、科研機構和醫院建立了協作網路和良好的合作關係。

技術平台

公司早在2003年10月就引進全世界第六套Illumina Beadlab System，建立了基因表達 / 甲基化和中國最大的大規模SNP基因分型檢測平台，並在之後的幾年間，完善了全通量基因組學分析平台和蛋白抗體研發平台，包括ABI SOLID、454 GS FLX、Illumina hiseq、Illumina iScan、ABI 7900HT SDS (Taqman) 、ABI 3730xl DNA Analyzer (sequencing) 等，以及實驗室自動化液體加樣系統、高通量生物信息學分析系統、中國人群基因組 SNP 及其單倍型資料庫等，為進行重大疾病相關基因的SNP 篩查和功能研究提供了堅實的保證和基礎。

公共服務

公司已加入上海研發公共服務平台共享網路，為國內外的生物醫藥行業科研單位、醫學院校和醫藥企業以及歐美的大型製藥公司提供了基因組測序、STR全掃、SNP發掘、SNP分型和關聯分析、mRNA表達譜、甲基化水平檢測等技術服務。公司承接國家863計畫、973項目和全國各高校研究院所的大量科技攻關項目的技術服務，建立了GLP（Good Laboratory Practice）管理規範。

重大項目

2003年至2005年，公司承接了“HapMap”國際合作項目，完成了中國HAPMAP協作組參與的21號、3號和8號染色體上SNPs的分型任務。作為中國課題組的主要工作平台之一，我們承擔的21號染色體SNP分型的質量——染色體覆蓋率、SNP密度、均勻分布程度等指標名列全球各參加單位的前列，為國家在世界上贏得了榮譽。
2008年與安徽醫科大學再度攜手完成了中國第一例4千人份規模的全基因組疾病關聯研究——銀屑病、白癜風和系統性紅斑狼瘡在中國人群的遺傳易感性研究，取得突破性發現，一系列成果已發表在國際權威學術雜誌《自然遺傳》（Nat Genet.）上。該項目是國內首個取得成功的重大疾病易感基因GWAS 研究，對我國重要疾病遺傳機制研究來說是一個令人鼓舞的重要開端，同時也為國內開展其他重大疾病易感基因的GWAS 提供了成功經驗。
2009-2010年與山東皮膚病性病防治研究所合作開展了麻風病的全基因組關聯研究以及家系連鎖分析，取得的轟動性發現發表在國際頂級醫學雜誌《新英格蘭醫學雜誌》（NEJM， 2009）上。目前公司每年的累計服務量在1200機時以上，用戶數在20家以上。