三里國小興辦於1952年，最初寄居在東來庵里，1958年遷至鄉公所。1964年分散辦學時，學校遷到元南組村民李志傑家中。1968並校擴為18個班，在二里乾渠南邊建校，至此三里國小才有了正式的校舍。1996年縣政府決定建設貿易城，時任村委會主任李志傑一班人抓住時機，克服困難，在現址建成規模三軌的新學校。
辦學以來，學校從最早的初級國小，歷經“分散辦學——合併辦學——戴帽國中——完全國小——縣屬國小”系列過程，先後合併了葫蘆橋、金灣、七里等三所國小，升格為葉挺橋國小東校區、實驗國小東校區，獲得了寶應縣體育運動傳統校、寶應縣綠色學校、寶應縣德育工作先進校、寶應縣體藝工作先進校、揚州市合格國小、揚州市素質教育先進校、揚州市少先隊紅旗大隊等光榮稱號，為當地文化建設和經濟發展作出了卓越的貢獻。
