中心管委會內設綜合科、行政審批業務科、效能督查科、績效評估科、效能投訴科、政務公開科、公共資源管理科和網路技術科;設立市重大項目協調督查辦。三明市公共資源交易中心內設建設工程交易部、政府採購部、土地礦產交易部、產權交易部、綜合交易部、綜合信息部和專家庫。辦事大廳、交易場所和辦公場所面積 4200平方米,市、區(梅列區)共入駐部門單位47個,設立辦事服務視窗40個,掛網行政審批和服務項目1028項,各部門授權視窗使用審批服務印章67枚,市政府授權使用 “急件速辦”和“業務督辦”專用章。
2004年9月建成中心網上辦事大廳,開展網上審批服務,研製開發並使用電子簽名、電子公章系統, 項目審批服務實現從方便自己、方便管理到方便企業、方便民眾;從一般受理、簡單受理、分散受理到集中受理、聯合受理、統一受理;從部分項目聯審到項目全程跟蹤督辦;從視窗集中聯辦到市、區部門聯辦的轉變。
中心管委會的管理與運行模式以市行政服務中心辦事大廳集中便民服務為基礎, 堅持“以人為本、執政為民”的服務宗旨,堅持“文明熱情、優質服務、高效運轉、廉政勤政”的審批原則,堅持內容求真、工作求快、管理求嚴、技術求精、方法求活、服務求全、態度求誠、形象求美的工作要求, 綜合運用現代網路技術和手段,拓展網上審批服務平台,推進網上審批與傳統審批相結合,建設集審批與服務、管理與協調、交易與公開、投訴與監督、信息與諮詢於一體,市、縣、鄉三級網路聯動的新型行政服務體系。