然而﹐RNA樹有可能將進化太快的類群放錯位置(比如微孢子蟲)。有人認為生物的根應該在真細菌之內﹐很多真細菌的類群在古細菌之前分支出來﹐很晚古細菌和真核生物才彼此分開。
三域特徵比較
特徵細菌(Bacteria)古菌(Archaea)真核生物(Eukarya)
形態和遺傳
原核細胞結構 是 是 否
共價閉合環狀DNA 是 是 否
組蛋白 無 有 有
被膜包圍的核 無 無 有
細胞壁含胞壁酸 不含胞壁酸不含胞壁酸
膜脂質酯鍵連線醚鍵連線酯鍵連線
核糖體大小70S70S80S
起始tRNA甲醯蛋氨酸蛋氨酸蛋氨酸
多數基因中有內含子 否 否 是
操縱子 有 有 無
mRNA加帽和聚A尾 無 無 有
質粒 有 有 稀少
核糖體對白喉毒素敏感 否 是 是
RNA聚合酶1個(4亞基)幾個(各8~12亞基)3個(各12~14亞基)
需要轉錄因子 否 是 是
啟動子結構-10和-35序列TATA框TATA框
生理
產甲烷作用 無 有 無
硝化 有 無 無
脫氮 有 有 無
固氮 有 有 無
基於葉綠素的光合作用 有 無 有(在葉綠體中)
基於視紫紅質的能量代謝 有 有 無
化能無機營養(Fe,S,H2) 有 有 無
氣泡 有 有 無
聚-β-羥基脂肪酸作為碳儲存顆粒 有 有 無
在80℃以上生長 有 有 無
參考資料:
1.http://www.wiki.cn/wiki/%E4%B8%89%E5%9F%9F%E7%B3%BB%E7%B5%B1