發展歷史
1961年（昭和36年）2月8日－丸之內線站區開業。
1980年（昭和55年）3月16日－新宿線站區開業。
2004年（平成16年）4月1日－營團地下鐵民營化，丸之內線站區由東京地下鐵接手經營。
2008年（平成20年）6月14日－副都心線站區開業。
停站路線
東京地下鐵 丸之內線－車站編號為M-09。
副都心線－車站編號為F-13。
東京都交通局（都營地下鐵） 新宿線－車站編號為S-02。
車站構造
地下街連線範圍廣泛，可步行至新宿站。丸之內線新宿三丁目站與都營新宿線新宿三丁目站有一段距離。經由新宿站、都廳前站、可通往西新宿站。
車站周邊
另可參照新宿站與新宿。
A1 三菱丸江大樓、JTB、新宿御苑
A2、A3 我街新宿
A4 喜多大樓
A5 三越新宿店本館
A6 中村屋
A7 タカノ
B1、B2 三和東洋大樓、映畫街、新宿三丁目交差點（東京都道4號東京所澤線、東京都道5號新宿青梅線起點）
B3 伊勢丹新宿店、新宿文化中心
B4 伊勢丹新宿店
B5 三井住友銀行、伊勢丹新宿店
B6 川瀬大樓
B7 紀伊國屋大樓、新宿區役所
B8 三峰館
B9 丸井ヤング新宿
B10 サブナード、西武新宿線西武新宿站
B11 歌舞伎町、瑞穂銀行
C1 JTB、京王新宿三丁目大樓
C2 三和東洋大樓、新宿區役所
C3 東新宿大樓、瑞穂銀行
C4 京王新宿三丁目第二大樓
C5 新宿御苑、要通
C6 新宿區役所、花園神社
C7 公園街伊勢丹、厚生年金會館、東京醫科大學、八千代銀行本店
C8 ビッグス新宿大樓、八洲學園高等學校
末廣亭（演藝場）
