劇情簡介
國家機密2 一陣刺耳的電話鈴聲將林雲飛從睡夢中驚醒，電話中傳出副科長董智超急促的聲音：“八所秦工程師在火車站丟失了裝有重要科研項目的機密檔案包，此事引起上層的高度重視，你速趕到鐵路公安局。”林雲飛與偵察員曹陽驅車趕到鐵路公安局時，董智超告訴林雲飛，公安已經破案了，是一起普通的盜竊案，讓林雲飛與公安做好收尾工作。林雲飛在觀看對小偷的審問錄像時，發現了破綻，並迅速報告了處長洪子城。有著豐富偵破經驗的洪處長敏銳意識到這很可能是一件間諜案，決定接手此案，並迅速採取了措施。在對八所的有關人員進行甄別排查時，發現張銓有重大嫌疑，就在將要對其進行詢問時，張銓突然被殺。在對現場進行勘查和對目擊證人詢問後，拘留了三個可能殺害張銓的嫌疑人，並對其進行了審問，但三人的表現都似乎符合邏輯，也沒有殺害張銓的理由。此時上級通報，失竊情報可能在48小時內通過衛星自動發射。時間一分一秒地過去，案件毫無進展。林雲飛提出了一個大膽的想法。
就在失竊情報即將自動發射的關鍵時刻，林雲飛運用特殊的偵察手段，使代號“無面人”的境外間諜分子不得不低頭認罪，外線偵察員也成功地截獲了失竊情報。正當大家慶賀勝利時，傳來一個意想不到的訊息：本市的另一個國家航天重點科研機構——動力所的重要科研計畫已經被泄露到了境外。
在案情分析會上，關廳長帶來了年輕的女偵察員石慧，並宣布她為偵察科新科長，具體負責特偵組的偵破工作。這讓兩個鉚著勁的副科長林雲飛和董智超很不解。為了便於偵破此案，處里決定派林雲飛以動力所辦公室副主任的身份進入動力所，進行跟蹤偵察。林雲飛利用辦公室副主任的身份對全所的重要部門、重點部位以及重要人員進行了細緻的檢查，沒有發現任何可疑情況。此時石慧提出對全所進行一次全面的安全檢查，不想發現火箭燃料K1樣品少了，而且毫無線索。林雲飛非常自責在自己眼皮底下K1樣品丟失，回想在動力所的每個細節，一個重要人物也出現在自己的眼前，林雲飛提出了一個讓人不敢想像的大膽構想——可能是動力所工程師袁知方監守自盜。經過嚴密的偵察、分析，證實了林雲飛的想法，袁知方為了兒子，不得不違心地做出了危害國家的行為，其背後一個代號為“黛安娜”的境外間諜小組浮出水面。特偵組果斷出擊，抓獲了間諜嫌疑人，並在機場截獲了K1樣品。在對樣品進行檢驗時，發現K1樣品少了一半。
“黛安娜”背後一定還有更危險的人物，這個人是誰成了破案的關鍵。隨著偵察的進一步深入，一個神秘女人出現在偵察員的視線內。此人就是與林雲飛有過交往的TTC公司董事長金夢。據查金夢在國外加入了A國間諜組織，利用我國改革開放之機，在本市成立了TTC公司，其目的就是竊取我國的高科技情報，這個TTC公司很可能就是境外間諜組織設立的重要場所。而金夢對林雲飛有“副省長”親戚的特殊背景很感興趣，正力請林雲飛到TTC公司工作。針對這一情況，石慧建議派林打入TTC公司，近敵偵察。
境外間諜組織指示金夢對林雲飛進行了嚴密的考察，甚至採用進行刺殺石慧來考驗林雲飛。在石慧等偵察員的密切配合下，林雲飛逐個化解了一次又一次的危機，也逐漸取得了金夢對自己的信任，只是負責組織安全的王躍龍對林雲飛仍不放心。正當林雲飛在TTC公司逐漸順利展開工作時，動力所的火箭燃料樣品K2配方又被竊取了。
種種跡象表明，在八所和動力所發生的一系列案件，只是境外間諜組織此次行動的序曲，更大的陰謀正悄悄地展開。
分集劇情
第1集
《國家機密2》 第2集
這個“無面人”就隱藏在八所內部，此次行動的代號叫“影子行動”，其目的是通過境外的間諜衛星將失竊的檔案傳送到境外。國安廳關廳長指示成立特偵組，務必在48小時之內偵破此案，整個行動由偵察處洪子城處長負責指揮。根據“無面人”就在八所內部的情報，特偵組對八所的人員進行了評估，發現工程師張銓有重大嫌疑。然而就當要對其採取行動時，突報張銓死了。經現場勘查，張銓的死是因為吃了有毒的蘋果，而蘋果是工程師李玉所送。但就在國安將對其進行訊問時，李玉又突然中風，生命垂危。根據調查，李玉在案發時間內不在現場，他不可能是殺害張銓的兇手。據目擊者反映，在張銓死亡前後時間內還有其他三個人到過張銓家。特偵組對這三人進行了訊問。三個人在張銓致死的毒素有效時間內都去過張銓家，而且都接觸過蘋果。但三個人對自己去張銓家都做了合理的解釋，而且三個人的心理反應都是正常的。案件一度陷入了僵局……
第3集
林雲飛判斷“無面人”的心理上一定會有所反應，但三個人當前的表現，讓林雲飛甚是不解。此時技術部門報告，蘋果中的毒素只能保持一個小時。而這三個人在此期間都不在犯案現場，難道還有第四個人？通過對目擊者的再次詢問，確認此間只有這三個人去過張銓家，絕沒有第四個。林雲飛分析可能是這三個人中的其中一人中途返回來過，洪處長從外線的調查中也證明，“無面人”就在這三個人當中。這時接到上級情況通報：所失機密檔案可以通過衛星自動發射，而不用人工操作。這使林雲飛想通過時間的迫近，觀察三人心理變化來判定嫌疑人的構想失敗。正當林雲飛一籌莫展之時，小曹報告工程師李玉甦醒了，董智超無奈的表示，如果張銓也被救活就好了，這句無意的話提醒了林雲飛，他決定假稱張銓已被救醒，以此來測試三人的心理變化。此舉很奏效，吳成在心理上產生了重大的變化。這時又傳來訊息，注射毒素的針管被找到了，在強大的心理壓力下，加上林雲飛絲絲入扣的推理，吳成不得不承認了自己就是“無面人”。案件的成功告破使林雲飛有些驕傲，洪處長卻批評他在破案中違反紀律，並宣布接下來的工作由董智超負責。林雲飛失落的回到父母家休息。與此同時，境外間諜頭目吉米不甘失敗，決定激活長期潛伏的間諜“黛安娜”，執行下一個更加陰險的間諜行動。
第4集
父母天天催促林雲飛找對象，讓林雲飛很煩，不能參加破案行動讓他更加煩躁，他決定提前結束休假。此時關廳長向洪處長通報吉米沒有被解職，可能後面有更大的陰謀。為了保護我偵察員的安全，決定撤回成功打入“馬蜂”間諜小組的“樂手”同志，讓林雲飛負責接應。不料，林雲飛與小曹卻親眼目睹了“樂手”被敵人開車撞死的全過程，臨終前，“樂手”告訴林雲飛要注意“一顆痣”。“樂手”的犧牲證明了吉米正在策劃一項重大的陰謀，從“樂手”留下的二胡中，也找到了敵人下一步的行動計畫叫“終極目標”行動。樂手的犧牲激起了廣大偵察員的憤怒，他們迅速採取行動，一舉破獲了“馬蜂”間諜小組。“樂手”臨終遺言讓林雲飛像著了魔，他著手調查“一顆痣”，洪處長批評林雲飛捕風捉影，責令他停止這種無用的調查。林雲飛很是不滿，認為洪處長故意跟自己過不去。
林雲飛接到了同學聚會的請帖，在聚會上，他遇見了多年不見，目前在國外發展很好的同學王躍龍。聽到林雲飛對自己現狀不滿，王躍龍主動邀請林雲飛出國跟自己乾，而且態度非常的誠懇和急切。這引起了林雲飛的懷疑，他讓小曹私下幫助調查王躍龍的情況。
第5集
抱孫子心切的父母，瞞著林雲飛在省城給他買了新房子，林雲飛急忙趕到新居，埋怨父母不和自己商量，話未說完就接到洪處長的電話，讓他趕快趕回處里。洪處長批評林雲飛沒有吸取上次的教訓，再次違反紀律，私自調查王躍龍，讓他寫出深刻的檢查。林雲飛心情不悅的回到新居，不想遇上父母為自己介紹的女朋友?—宋小菲，意外的發現她的臉上有一顆痣，頓時一愣。為了向父母掩蓋自己的真實身份，林雲飛假裝與宋小菲相處。父母看到此景，放心地走了。林雲飛剛送走父母，洪處長又單獨地召見了林雲飛，告訴他吉米的行動目標是針對我國的火箭計畫，讓林雲飛負責動力所的安全保衛行動。在對動力所有關人員進行排查中發現，負責火箭燃料樣品測試的袁知方總工身邊最近有個女人對他特別關心，似乎像是在談戀愛。因為動力所是國家的重點科研單位，而袁工從事重要的科研工作，密級很高，間諜多次想打動力所的主意，所以鍾所長向洪處長反映了這一情況。果然不出所料，此女正是間諜分子，她利用自己的色相接近袁工，罪惡之手已伸向袁工存有重要科研資料的電腦。
第6集
當神秘女人用藥迷倒袁工，把手伸向袁工的電腦時，偵察員突然出現，當場將其抓獲。經審訊，她交代了自己從事間諜活動，代號“黛安娜”。根據實際情況分析，特偵組認為此人不可能是吉米的王牌，這可能又是吉米耍的花招。案情分析會上，關廳長領來一個年輕的女偵察員石慧，並宣布她為新科長，負責這次偵破行動。這引起了林雲飛和董智超的不滿，並對其冷嘲熱諷。石慧不為所動，對偵察計畫提出了自己的想法：對動力所這樣的重點單位，應派偵察員用掩護身份進入，進行貼近偵查，並推薦林雲飛執行此任務，讓林雲飛很感意外。為了全身心地完成這次任務，林雲飛向宋小菲提出斷絕來往，這讓宋小菲很傷心。 林雲飛以所辦副主任的身份進入了動力所，他的身份只有李書記一人知曉。鍾所長要出差，臨行前叮囑林雲飛照顧好負責測試工作的袁知方。林雲飛利用副主任的身份，對動力所的重要人員和重點部位進行了嚴密的排查，沒有發現任何可疑之處，動力所的安全保衛措施也沒有明顯的疏漏。但特偵組從特殊的渠道得知，動力所的一份機密的研究計畫已泄露到境外，洪處長非常的生氣，林雲飛也感到很自責。為查清此案，石慧等人來到動力所，向袁知方了解情況，不想袁工非常激動，突然病倒了。林雲飛陪袁工回家休息，意外遇到了TTC公司董事長金夢前來探望。
第7集
林雲飛重多突發事件使他很敏感，並向小曹布置了對金夢的調查。經了解，金夢是袁工的學生，與袁工是私交，案發時她在國外。她接觸袁工很可能是想利用袁工的兒子科技局長袁宇，發展自己的事業。由於袁工的關係林雲飛與金夢有了接觸，一次陪袁工打網球時，林雲飛意外地發現金夢手臂上也有一顆痣，引起他的注意。金夢很看重林雲飛有“副省長親戚”的特殊背景，想請林雲飛去TTC公司工作。石慧對金夢的背景身份也有疑慮，讓林雲飛繼續接觸金夢。一個星期過去了，案件卻毫無進展。石慧提議對動力所進行一次全面的安全檢查，來打亂敵方的步驟。檢查結果讓所有人大吃一驚：由袁工保存的K1樣品被人動過了，袁工心急如焚，突發心臟病，住進了醫院。通過技術檢測，作案現場沒有外來人員作案的跡象。林雲飛分析，袁工說過在新樣品和舊樣品對沖的時候會有損耗，而三天后要有新樣品送到，所以，有可能是懂技術的內部人作案，而且把目標鎖定在了陸工身上。經多方調查和特殊的技術探測，證實陸工不可能出現在作案現場，作案者另有其人。
經排查和技術鑑定，排除了所內所有能夠接觸此重要科研資料人員作案的可能，除袁工已被助手證明案發當時他一直在測試室以外，沒有任何所內人員進入案發現場的跡象，特偵組都很著急。在案情分析會上林雲飛提出了一個非常大膽的構想，很有可能是袁工監守自盜，並說明自己發現最近袁工的一些異常舉動。
第8集
林雲飛的推論一出遭到大多數人的反對，特別是洪處長。林雲飛趕回醫院繼續看護袁工，他無意中發現袁工對兒子很反感，兩人還在病房裡吵了起來。聯想到袁工一些異常的行為，林雲飛又開始了對袁工進行私下調查。據可靠情報，失竊檔案可能從機場流出。為了防止樣品外流，洪處長命令對機場進行檢查，全力防範樣品出境。此時技術部門報告，案發現場有兩隻貓的貓毛，而林雲飛清楚記得案發前後，袁工家除了自養的貓以外，還收留了一隻流浪貓。這證明在案發時袁工去過現場，而不是他說的這兩天根本沒有進過案發現場。林雲飛再一次向洪處長匯報了這一特殊情況，並報告發現袁工有過分遷就兒子的弱點。但洪處長不聽林雲飛的建議，嚴令按計畫行動。林雲飛認為這是一個重要的情況，對此案很可能時一個重大突破。他直接向關廳長作了匯報，關廳長聽取了林雲飛的建議，決定對袁氏父子進行調查。果然在袁宇身邊發現有一些神秘的女人，袁宇的秘密情人—模特於莉娜十分可疑。通過對於莉娜的電話跟蹤，又有兩個神秘女人露出水面，一個是袁宇的保姆李小曼，另一個就是美容院老闆謝韻。經查，此三人都有國外的經歷，存在重大間諜嫌疑，而謝韻開設的美容院很可能是他們的秘密聯絡點。特偵組決定進入美容院進行偵察。林雲飛與石慧化裝成某時尚雜誌的專業人員，假借要為謝韻做一個專訪，來到了美容院。
第9集
根據事先的計畫安排，趁林雲飛等為謝韻拍照之際，偵察員小曹進入美容院的貴賓室安裝了監控設備。狡猾的謝韻幾次藉機對貴賓室進行了反偵察，在董智超的技術配合下，幾次化險為夷，但情急之下，小曹放錯了貴賓室的風沙物。石慧急中生智假裝頭疼要借用謝韻的貴賓室，謝韻無奈地答應了，林雲飛趁機放回了風沙物。經過監控和多渠道收集的情況分析，吉米的王牌“黛安娜”，實際上可能是一個由美女組成的間諜小組，謝韻是這個小組的領導者。他們掌握了袁工愛子心切的弱點，利用袁宇出國考察之際，拉他下水，讓袁宇逼迫袁工成功地竊取了K1樣品。根據所掌握的情況分析，他們很有可能利用袁工再次作案，竊取K2樣品，通過特殊渠道將雙K樣品偷運出境。此時袁工也強烈提出要出院，而新樣品兩天后也要送到動力所。特偵組決定將計就計，讓袁工出院參加新樣品的測試。
自覺得有愧於兒子的袁工，為了保住兒子的前程，在袁宇的苦苦央求之下，答應了兒子的要求，準備對K2樣品下手。他藉口對K1樣品室有心理障礙，要求與楊工調換測試場地，進入了K2樣品室。當他伸手竊取K2樣品時，一下子愣住了。
第10集
袁知方告訴袁宇K2樣品是假的，國家安全部門已經發現了他們的活動，讓袁宇好自為之，併吞服了毒藥。臨終前向袁宇說出了他之所以這樣做，一是為了兒子，另外還受到一個人的威脅，並告訴袁宇那個人的名字，這一幕都被監控器前的林雲飛看在眼裡。特偵組果斷採取行動，抓捕了袁宇，在對其審問中得知K1樣品已交給了謝韻，此致“黛安娜”小組的情況已基本清楚，特偵組迅速對“黛安娜”小組採取抓捕行動，但他們似乎得到了告警，謝韻服毒自殺，並毀了自己的電腦；於莉娜和K1樣品不知所蹤；只抓住了保姆李小曼。特偵組對於莉娜全力追蹤，並在她即將上飛機之時，將其抓獲，在於莉娜的假髮里搜出了藏匿的K1樣品。經過檢測，卻發現搜獲的K1樣品只是失竊的一半。於莉娜交代他們背後還有一個神秘的男人在指揮，那一半樣品在他手裡。這個男人會不會是袁工死前對袁宇說的那個人，林雲飛與石慧再次提審了袁宇，讓他說出那個人是誰。不想，袁宇卻百般否認知道謝韻的上級是誰，也沒有聽清袁工對自己說過的那個人的名字。林雲飛與石慧都認為這個人可能是偵破此案的關鍵，他們反覆觀看監控錄像後，仍無法知曉這個人是誰，只是根據錄像認為這個人應該是袁工和袁宇相識之人。他們找來了唇語專家對錄像進行分析，結果專家寫出了一個讓他們無法相信的名字。他們又請專業錄音師對聲音進行分析，結果與唇語專家的結論一致。為了慎重，他們又一次提審袁宇。在他們的耐心說服並保證其安全的前提下，袁宇說出了這個人就是偵察處長—洪子城。
第11集
事關重大，他們立即直接向關廳長匯報。關廳長也得到了特殊報告，洪處長小姨子與謝韻是好朋友，而洪子城在國外的妻子和岳母等人最近得了一筆不小的收入。關廳長和石慧、林雲飛和董智超宣布對洪子城啟動內部調查程式，並要求對外絕對保密。董智超不相信洪處長會是間諜，與林雲飛發生了衝突。
董智超再一次對案發當天謝韻的行蹤進行了仔細地調查，並有了重大發現。謝韻當天去過附近的書報亭，翻看了平常從不關心的體育新聞，而這本雜誌隨即就被一個神秘男人買走，監控人員拍下了那個神秘男人的照片。董智超分析很可能謝韻將壓成薄片的K1樣品放在雜誌中讓神秘男子買走。當董智超說出雜誌的封面是某著名的網球女星時，林雲飛突然想起了金夢曾經提過自己的偶像就是這個網球明星。他當即對監控照片進行技術處理、放大，終於發現這個神秘的男人是女扮男裝，此人正是TTC公司董事長—金夢。這是一個重大突破，當石慧等滿懷信心將對金夢的調查報告交到關廳長手中時，關廳長卻讓他們停止對金夢的調查。原來關廳長已經知道金夢有重大的間諜嫌疑，但金夢不是最後的終結，要利用金夢挖出整個間諜組織。為了加強破案的力量，關廳長調來了具有豐富經驗的馮大姐作為特偵組的顧問，並決定派林雲飛利用與金夢有過接觸的關係，打入敵人內部，代號“夜眼”。為順利打入敵人內部，應付各種突發情況，在馮大姐的指導下林雲飛進行了近乎殘酷的各種訓練，同時特偵組也為林雲飛進入TTC公司做了大量的鋪墊工作：利用“林副省長”的特殊關係，為TTC公司解決了幾件非常棘手的問題，介紹了幾個重要的合作項目等，特別是替金夢與她一直想合作的環亞公司接上了關係。金夢非常吃驚林雲飛有如此能量，將來對自己的公司和今後的行動一定有用，再三邀請林雲飛到TTC公司。水到渠成，林雲飛答應了金夢的邀請。
第12集
臨行前，關廳長親自為林雲飛送行，告訴他第一次執行特殊任務，可能感到很孤獨，但他永遠都不是一個人在戰鬥。關廳長的話讓林雲飛充滿信心，堅定地連夜驅車趕往TTC公司。在一條新開的偏僻公路上，林雲飛巧遇宋小菲被流氓非禮，林雲飛進退維谷。救人很可能會被宋小菲認出，暴露自己的這次特殊使命；不救更不是他應該做的事。救，還是不救，讓林雲飛陷入了兩難境地。
林雲飛最終還是蒙面解救了宋小菲，看到警車到來，林雲飛放心離去。與此同時，石慧和董智超等人已提前來到臨海市，配合林雲飛的行動。林雲飛按時趕到位於臨海市的TTC公司，受到金夢和公司經理蓋鳴的親自迎接。金夢告訴林雲飛明天就要和環亞公司簽約，希望林能參加，金夢前夫的二叔杜金鷹從國外急忙趕來，極力阻止TTC公司與環亞合作，並反對林雲飛進入TTC公司。林雲飛來到聯絡點茶餐廳，將此情況報告了裝扮成老闆娘的石慧。為配合林雲飛的行動，上級及時叫停了環亞與TTC公司的簽約，這讓金夢很著急。在TTC公司總部董事會的視頻會上，金夢與杜金鷹相持不下，林雲飛及時趕到，力陳與環亞合作的有利之處，並告訴TTC總部環亞在這次合作中又讓利20%，使董事會暫時支持了金夢的意見。為此金夢對林雲飛心懷感激，破格聘請林雲飛為TTC公司的行政副總裁。金夢也趁機送給林雲飛一個有特殊裝置的新手機，以此來監聽林雲飛所有的電話。儘管不很順利，但林雲飛還是成功地進入了TTC公司，邁出了第一步。
第13集
與此同時，董智超接到技術部門的電話，說謝韻被毀電腦被部分拼接出來，董智超興奮異常。
林雲飛來到了另一個秘密聯絡點與石慧聯絡，幾天的孤獨讓林雲飛感到像是到了家，見到了久別的親人。石慧向林雲飛通報了情況，杜金鷹與東南亞黑社會頭目項哥有合作關係，而吉米從不和黑社會合作，證明杜金鷹不可能是吉米組織中的成員。林雲飛也向石慧報告了TTC公司的情況，C區可能是金夢的秘密實驗區，必須想方設法進入C區，查出真相。董智超在謝韻殘存的電腦中發現了與他以前在網上遇到的網路高手“藍蜘蛛”相同的編碼，破解了謝韻電腦中部分數據，獲悉了吉米“雙K樂章連奏三個月”間諜行動計畫，並確認“藍蜘蛛”有重大的間諜嫌疑，可能是吉米計畫中的另一條線。在董智超的技術支持下，林雲飛進入了金夢的辦公室，並成功下載了金夢電腦中的信息。當林雲飛撤出經過人力資料一室時，臨時決定進入人力資料室，從人力資料中找出蛛絲馬跡。不料出門時與從對面資料二室走出的杜金鷹撞了個正著。杜金鷹搶先向金夢告發了林雲飛。面對金夢的質疑，林雲飛說自己知道有人搶先告狀，他解釋自己到金夢辦公室所在的樓層的原因，並提醒注意杜金鷹。多疑的金夢表面表示相信林雲飛，暗地裡命令公司保全核對林雲飛所說的事。
第14集
保全證實了林雲飛的說法，並說曾看到杜金鷹在樓里鬼鬼祟祟，好像在找什麼東西。金夢覺得杜金鷹的行為危害到了自己，為了公司的利益和計畫的實施，她趕走了杜金鷹。但對林雲飛也心存戒心，她故意將電腦包落在車上來考察林雲飛，林雲飛看穿了金夢的伎倆，將包及時還給了金夢。林雲飛的行為讓金夢對他建立了初步的信任。在林雲飛的努力下，TTC與環亞順利簽約。簽約酒會當晚，林雲飛提前離開酒店。當他正要開車離去時，無意間發現杜金鷹企圖對金夢圖謀不軌。林雲飛及時報告了石慧，石慧指示交由她來處理，讓林雲飛回去休息。林雲飛覺得情況緊急，猶豫片刻，還是掉轉了車頭。就在杜金鷹所雇兇手對金夢下手時，林雲飛及時出現，救了金夢，自己卻被刺受傷。儘管林雲飛又違反了紀律，但卻消除了金夢的懷疑，取得了金夢的好感，同時也得到了進入C區的通行證。杜金鷹的行為激怒了吉米，不久就傳出杜金鷹被殺的訊息，也證明了金夢在吉米此次行動中的重要地位。林雲飛順利進入了C區，就在他想全面了解C區的情況時，卻被告知他不能進入實驗區。林雲飛說服公司總經理蓋鳴對公司進行裝修，並更新安保系統，想藉此次更新安保系統對c區進行偵查。但金夢卻通知公司的安保系統由新來的副總負責，並向林雲飛和蓋鳴介紹新來的副總，當林雲飛與新來的副總相見時，兩人不禁都愣住了……
第15集
讓林雲飛意想不到的是，新來的副總正是自己的同學王躍龍，主要負責公司的安保工作。林雲飛馬上將這一重要情況報告了石慧。王躍龍對林雲飛有副省長親戚表示了懷疑，假借請林雲飛吃飯對林雲飛進行試探，金夢暗中進行了監聽，但沒有發現有什麼破綻。王躍龍並不死心，任命自己帶來的親信何強與劉標負責公司的保全工作，要求對林雲飛進行嚴密地監視，並叫停正在施工的裝修工程。林雲飛發現自己的房間被人動過了，這說明王躍龍可能是間諜組織成員,他的到來一定是為了這次行動，對自己也造成極大的威脅，必須加倍小心，儘快弄清C區情況。他告訴金夢林副省長要來本市視察。但因為目前公司的裝修工作的停滯，環境很亂，無法讓林副省長到公司視察。金夢意識到這是難得的機會，既可以擴大公司的影響，更可以為自己找到很好的保護傘。她勸說王躍龍同意加緊公司的裝修，不想一直反對的王躍龍卻痛快的答應了。王躍龍認定林雲飛一定會利用這次機會，在裝修時做手腳，這正是他揭穿林雲飛的最好時機。他叫來金夢等著看一場好戲，在監控畫面上，裝修工人進入了C區，林雲飛也正向C區走去，王躍龍得意地告訴金夢林雲飛一定會採取行動，不想林雲飛卻阻止了裝修工人的行動，讓王躍龍始料未及，金夢取笑王躍龍以後不要再疑神疑鬼。進入C區準備工作順利進行時，董智超發現，謝韻出事後一直毫無蹤影的“藍蜘蛛”突然出現，他命令孟歌迅速搜尋他的IP位址。
第16集
孟歌試圖鎖定“藍蜘蛛”，董智超的電腦突然被“藍蜘蛛”給黑了。原來吉米的此次行動由“國王”指揮，除金夢外，他還另闢蹊徑，讓 “藍蜘蛛” 利用電腦侵入我火箭科研系統，竊取情報，企圖雙管齊下，目標所指很可能是動力所的K2樣品。特偵組迅速對動力所進行了徹底的檢查，發現陸總的電腦被人入侵，K2樣品配方已被盜。同時得到公安通報，受僱行動的慣犯六指已經被殺。雖然陸總電腦的技術數據已經加密，但像“藍蜘蛛”那樣的電腦高手完全可以解開密碼。時間異常緊迫，必須馬上行動。林雲飛在小曹、董智超等人的掩護下進入C區，發現秘密實驗室兩個外國專家對K2樣品進行成分分析。當林雲飛準備進入C區金夢辦公室時，不想金夢修改了密碼，警報突響。林雲飛機智地引發了所有的警報器，整個大樓一片警報聲。林雲飛趁機從窗戶安全撤出。林雲飛、石慧等人奉關廳長之命來到秘密療養院，出乎所有人的意料，接待他們的卻是處長洪子城。原來吉米為了阻止老對手指揮偵破工作，做局陷害老洪，而關廳長與洪處長將計就計，為吉米做了個局中局，迷惑敵人。表面上接受審查，實際上他一直在指揮偵破行動。洪處長指示一定要在敵人破解K1、K2之前收網。林雲飛適時地向金夢透露屢次幫助自己的劉大秘書，馬上要當外辦的副主任。金夢對此非常重視，認為這是一條很好的運送途徑，因此加緊了對林雲飛的拉攏。
第17集
面對金夢的拉攏，林雲飛也順水推舟，常常陪金夢遊泳、吃飯。金夢也適時地向林雲飛表露了自己的孤獨，試圖引起林雲飛的同情。“國王”同意了金夢建立新通道的想法，但對林雲飛要進一步考查。得到“國王”指令後，王躍龍積極著手對林雲飛再次考查。無巧不成書，機會很快出現。蓋鳴給林雲飛推薦了一個專職秘書，此人又正巧是剛畢業的宋小菲。宋小菲當面指責林雲飛是騙子，這引起了金夢與王躍龍的懷疑。林雲飛告訴宋小菲自己離開她是因為遇到了另一個女人，這讓躲在暗中的金夢誤認為林雲飛所指之人就是自己。而宋小菲無意中透露的林雲飛父母的信息，讓王躍龍找到了查明林雲飛身份的突破口。他一邊派何強與劉標去林雲飛父母家調查其背景，一邊又和金夢一起以開會為名拖住林雲飛。林雲飛利用叫外賣的機會，及時將情報通知了裝扮成服務員的孟歌。石慧接到情報後，果斷地安排偵察員化妝成服務員，巧妙地對付了劉標的詢問，化解了危機。但王躍龍不死心，說服金夢留下宋小菲，安排在林雲飛身邊工作，利用宋小菲與林雲飛的特殊關係，找出林雲飛的破綻。
第18集
宋小菲工作非常認真負責，常常加班加點，並常陪林雲飛外出公幹。宋小菲在一次見義勇為時被小偷盯上，林雲飛出手收拾了一夥小偷。林雲飛的身影讓宋小菲想起了不久前自己路遇歹徒被救的情景，她說林雲飛很像解救自己的那個人，這讓林雲飛感到不安。宋小菲的單純讓王躍龍覺得有機可乘，他向宋小菲表示自己很了解林雲飛，他與宋小菲非常般配。勸說宋小菲應該對林雲飛採取主動，慫恿宋小菲跟蹤林雲飛。宋小菲的處處跟隨，給林雲飛的行動帶來諸多不便，石慧等也認為這樣下去會影響到整個行動計畫，應該想辦法阻止宋小菲。林雲飛委婉地將王躍龍故意指使宋小菲跟蹤之事告訴了金夢，金夢也因為宋小菲經常與林雲飛外出，心生嫉妒，正想趕走宋小菲。她故意重用宋小菲單獨接待貴賓，並給宋提供錯誤資料，使宋小菲在接待中出了錯誤，金夢藉機辭退了她。宋小菲臨行前找林雲飛告別，為了任務，林雲飛狠心地趕走了宋小菲。金夢與王躍龍在暗中監聽了林雲飛與宋小菲的對話，金夢認為對林雲飛應該完全放心，而王躍龍則不同意金夢的說法，與金夢產生了爭執。種種跡象表明；金夢等人可能很快向林雲飛攤牌，吸收他加入他們的組織。說明林雲飛已經接近目標了，但也更接近了危險。石慧、董智超等生死戰友都為林雲飛的安全感到擔心。
第19集 事情果然如特偵組分析那樣，“國王”指示可以對林雲飛試探性攤牌，一但事情不順必須幹掉林雲飛，並要做得乾淨、徹底。金夢開始了對林雲飛的感情攻勢，表示自前夫死後林雲飛是唯一一個讓她動過心的男人，希望能和林雲飛一起出國，白頭偕老。林雲飛察覺這既是拉攏，也是試探，過分熱情會引起金夢的懷疑。他沒有接受金夢拋來的愛意，但恰到好處地表示自己可以為心愛的人做任何事，讓金夢更加放心。金夢認為沒有林雲飛可能無法完成任務，決定向林雲飛攤牌，但由王躍龍監督進行。得到情報後，特偵組也採取了相應的措施。當天深夜，林雲飛接到了金夢的電話，兩人開車來到漆黑的山路。根據石慧的布置，小曹和孟歌跟蹤金夢汽車，但在一個多岔路口丟失了目標。石慧接到報告後，急忙趕往事發地點。車中金夢假稱自己被走私集團脅迫，參加了走私團伙，讓林雲飛幫助自己走私物品，否則自己的母親將會被走私集團傷害。林雲飛表示沒想到自己要付出這樣的代價，猶豫不決。而躲在暗中的王躍龍和何強，時刻注視著車中的金夢與林雲飛，一旦看到金夢發出信號，立即幹掉林雲飛。
第20集
林雲飛的回答讓金夢極度失望，她發出了行動失敗的信號。王躍龍看到信號，發動了泥頭車，隨時準備幹掉林雲飛，只等金夢藉故下車。就當金夢將要下車的一剎那，林雲飛答應了她的要求。金夢交給林雲飛一個景泰藍，讓他托外辦劉主任帶出國。為了防止他們藉機將K1樣品運送出國，董智超用特殊的檢測手段對景泰藍進行了檢測，認定只是普通的景泰藍，景泰藍順利運送出境。金夢告訴林雲飛他已經通過了“國王”的考查，決定吸收他加入他們的組織，代號“伯爵”。林雲飛表示不能接受“國王”的安排，只為金夢做事。在金夢拿出十萬美金時，林雲飛假裝無可奈何地接受了，但表示這是最後一次。金夢答應了他的要求。金夢對林雲飛的表現十分滿意，留林雲飛在家吃飯。林雲飛借著金夢洗澡之際複製了金夢的C區識別卡。正當金夢想進一步勾引林雲飛時，窗外出現了王躍龍的黑影，林雲飛推脫自己不能理解金夢為何對王躍龍如此寬容，藉機離開了金夢家。在TTC公司，林雲飛發現蓋鳴的司機最近行動有些反常，決定跟蹤老莫。
第21集
老莫的詭異行為讓林雲飛想起曾看到自稱不懂電腦的他竟是個電腦高手，被林雲飛發現後又極力掩飾；另外，動力所K2被盜那天，老莫整天不在公司。針對老莫這些反常的舉動，林雲飛要求重新對老莫進行調查，但調查結果仍未發現可疑之處。林雲飛通過多方了解，證明老莫只是因為私自用車，出了車禍，又害怕公司的人知道，才有如此的詭異行為。林雲飛這邊的工作進展順利，排除了老莫的嫌疑，但董智超那邊的工作卻遇到了困難，未能破解金夢的識別卡，無法讀取金夢識別卡中的技術數據。他告訴林雲飛識別卡中設定了許多問題，這些問題的答案可能就在金夢的習慣、愛好等資料中。林雲飛借陪金夢購物之機，取得了金夢的相關資料。此時的“藍蜘蛛”也破解了K2樣品配方密碼，這讓吉米興奮不已，他命令“國王”加快分析K1樣品化學成分的步伐，與已破解的K2一起運送出境。多疑的“國王”行動之前準備進行清理工作，對可能威脅行動安全的人堅決除掉。王躍龍拿出石慧的照片給林雲飛，說石慧是國安偵察員，何強正採取行動，幹掉石慧。林雲飛想起了自己目睹樂手被害的情景，為石慧的安危擔心，同時懷疑會不會又是他們的一次考察。他借不滿自己的計畫方案，極力地掩飾住了自己的情緒。躲在暗處的金夢仔細觀察林雲飛的表現，沒有發現什麼可疑之處，她告訴林雲飛可以回去休息了。林雲飛一路狂奔，來到與石慧聯絡的密室。結果只看到空曠的房間和桌子上已經凋落的百合花，林雲飛淚如泉湧……
第22集
林雲飛找到金夢，責問為什麼石慧仍然活著，金夢告訴他又一次通過了“國王”的考查，如果昨天林雲飛有一絲的破綻，那么現在，他和茶餐廳女老闆都已經不在人世了。隨著行動時間的迫近，“國王”指示金夢加快雙K樂章中她負責的那部分工作，金夢和王躍龍加快了行動的步伐，經常一起離開公司，不知去向。此時，董智超利用林雲飛所提供的資料，也成功地破解了金夢C區識別卡的密碼。進入C區的各項準備工作已經全部完成，可以對C區的秘密實驗室和金夢辦公室採取行動。利用王躍龍與金夢外出機會，特偵組採取了行動。董智超用間斷的音頻通訊信號指揮林雲飛，成功進入了C區金夢的辦公室。但卻不知金夢的電腦安裝了特殊的裝置，在規定的時間內不輸入正確的密碼就會自動報警。林雲飛幾次嘗試未果，影視器上出現了報警的倒計時，情況十分危急，如果不能在規定的時間內輸入正確信息，所有的準備工作將付諸東流，而且還會驚動金夢，永遠失去再次進入金夢電腦的機會。就在時間所剩無幾時，在董智超提示下，林雲飛輸入了正確密碼，進入金夢的電腦。狡猾的王躍龍感覺到TTC公司附近有可疑的音頻信號，立即趕回公司。面對突發情況，石慧動用了特殊力量以市政維修之名，阻止了金夢與王躍龍，為林雲飛成功下載金夢電腦中的資料爭取了時間。經過對金夢電腦的資料分析得知，金夢的行動是K1樂章，具體計畫是在七日內分析出K1樣品成分，或直接將K1樣品運送出國。在臨時破案指揮部，關廳長提醒全體參戰人員，除金夢利用林雲飛這一運輸通道之外，吉米很可能還有另外其他的運送通道。大家意識到形勢緊迫，留給破案的時間只有短短的七天。
第23集
遠距離探測裝置發現，C區大樓內有五處已經安裝了爆破裝置，證明敵人將要開始最後的行動，時間就在7日之內。金夢告訴林雲飛“國王”已親自考察了他，很滿意，讓林雲飛做好隨時行動的準備。此時金夢收到了“國王”的緊急信號，讓她停止電腦聯絡，啟用特殊通訊手段。根據“國王”的指示，金夢在一塊特殊的石頭上找到“國王”留下的晶片。“國王”通知金夢，她的電腦被一種高端技術侵入，而能夠侵入她電腦的人只有一個人，就是林雲飛。指示金夢沉住氣，不要驚動林雲飛，為完成任務爭取時間。同時“國王”又布置“藍蜘蛛”攻擊我國火箭發射燃料控制系統，破壞我火箭發射計畫。得到“國王”的指令後，金夢心情矛盾，面對林雲飛她強裝自然。但林雲飛還是察覺出金夢的變化。林雲飛冷靜地分析了目前的情況，金夢之所以沒有對自己採取行動，是因為還不知道我國安部門已經發現了林雲飛已經暴露，大家可以將計就計，而自己裝作毫不知情，回到TTC公司，裡應外合，徹底查清“國王”的全部情況，將他們一網打盡。在徵得關廳長同意後，洪處長決定採納林雲飛的建議。
第24集
隨著林雲飛重新回到TTC公司，圍繞著配合林雲飛行動的各項準備工作全面展開。董智超請來電腦專家繼續破譯“藍蜘蛛”的密碼；石慧與孟歌趕回茶餐廳堅守崗位；關廳長也親自布置對林雲飛的安全保衛工作，向馮大姐布置了一項特殊任務。與此同時，金夢與王躍龍也密切注視著林雲飛的動向。整個TTC公司一片忙碌，蓋鳴、老莫和王躍龍、何強、劉標等都顯得匆匆忙忙，只有金夢顯得格外平靜，她請林雲飛回家吃飯，向他布置了具體任務。是夜，金夢突然通知林雲飛“國王”要見他，林雲飛跟隨金夢來到地下停車場，等候他的卻是王躍龍和何強。金夢讓林雲飛換車，王躍龍也給林雲飛帶上了裝有強幹擾裝置的手錶，監控信號突然消失。守在監控設備前的石慧等人完全失去了林雲飛一行的行蹤。洪處長緊急請求交警支援，在交警部門的幫助下，小曹和孟歌也跟蹤來到汽車修理廠，盯住了修理廠的兩個出口。金夢打開了一個秘密通道，何強推搡林雲飛進入通道，林雲飛趁勢為戰友留下了信號。小曹和孟歌久久不見汽車修理廠有任何動靜，恐情況有變，進入修理廠檢查，只發現了金夢留下的車輛，而進去的四人杳無影蹤。石慧接報告後，果斷行動。在特警的配合下包圍了修理廠，並進行了全面細緻的搜尋，找到了林雲飛留下的打火機。根據林雲飛留下的信號，發現了秘密通道。石慧命令分路搜尋追擊。金夢等人脅持林雲飛來到海邊，金夢等人露出了猙獰面目，何強在林雲飛的心臟處安裝了微型炸彈。金夢逼問林雲飛為何欺騙自己的感情，林雲飛平靜地回答，從她背叛國家的那一天起，她已經沒有資格談論感情。金夢氣急敗壞，王躍龍按下了微型炸彈的控制器，但炸彈卻沒響。這時何強突然調轉槍口，指向金夢與王躍龍
第25集
金夢與王躍龍奪路而逃，何強跟蹤追去。石慧帶領大隊人馬及時趕到，海面上我武裝快艇也從海上包圍了金夢與王躍龍，他們束手就擒。與此同時，洪處長親自帶隊抓獲了劉標及兩名外國化學分析專家，緝獲了安裝在大樓里的炸彈。金夢雖然抓住了，破獲了第一樂章行動，但“國王”第二樂章的內容是什麼，執行第二樂章的“藍蜘蛛”是誰、在哪，仍無從知曉。關廳長命令立即抓捕“國王”，以此為突破口，解開第二樂章之謎。行動分兩組同時進行，林雲飛率領小曹等人抓捕“國王”；董智超繼續破解“藍蜘蛛”。林雲飛在“國王”逃跑途中將其抓獲，他竟是蓋鳴與林雲飛經常光顧的某酒店經理—李總。為了打掉“國王”的僥倖心理，林雲飛告訴“國王”，安全部門早已掌握了他的所有情況，他的本名叫“易克智”。易家菜的第五代傳人，是這次“終極目標”行動的國內總指揮，代號“國王”，責令他交代自己的犯罪事實。頑固的“國王”拒不交代任何情況，企圖拖延時間，使林雲飛的審訊工作很不順利。而董智超行動卻有了重大突破，查清了並搗毀了“藍蜘蛛”的秘密工作地點，雖然未抓住“藍蜘蛛”，但弄清了第二樂章計畫的具體內容，就是利用“藍蜘蛛”的電腦天才，攻擊我火箭發射的燃料控制系統，使火箭燃料倉無法脫落，造成火箭爆炸。關廳長通報當日下午3點15分我國將發射由雙K作為燃料添加劑的運載火箭，看來“國王”正是等待這一時刻的到來。時針指向3點15分，“國王”得意地表示現在可以交代“藍蜘蛛”的下落了，讓他沒想到的是，林雲飛笑著告訴他演出結束。原來“國王”命令“藍蜘蛛”攻擊的只是我們專為他們準備的模擬系統。與此同時，石慧也鎖定了“藍蜘蛛”的方位，將其抓獲。這起由境外吉米間諜組織精心策劃的“終極目標”計畫徹底破產。
案件成功告破，參與偵破的人員受到上級的嘉獎和授勳。年輕的偵察員在實踐中迅速成長，林雲飛被任命為偵察處副處長，主持偵察處工作；洪處長、馮大姐和小曹又接到了新的特殊任務，奔赴新的戰場……
演職員表
演員表
| 角色 | 演員 | 備註 |
|---|---|---|
| 林雲飛 | 谷智鑫 | 國安廳偵察科副科長 |
| 董智超 | 於恆 | 國安廳偵察科副科長 |
| 金夢 | 溫崢嶸 | TTC公司董事長 |
| 石慧 | 李悅溪 | 國安廳偵察科科長 |
| 洪子城 | 丁勇岱 | 國安廳偵查處處長 |
| 關廳長 | 鮑國安 | 國安廳廳長 |
| 曹陽 | 呂清超 | 國安廳偵察科偵察員 |
| 孟歌 | 周子涵 | 國安廳偵察科偵察員 |
| 袁知方 | 張先衡 | 動力所工程師 |
| 何強 | 崔鍾 | 臥底 |
職員表
角色介紹
 林雲飛 | 谷智鑫飾演林雲飛 偵察科副科長，思維敏捷，年輕氣盛。以所辦副主任的身份進入動力所，負責安全保衛行動。送動力所袁工回家時，意外遇到了前來探望的金夢。調查之後發現金夢有重大間諜身份的嫌疑，經過組織的一系列安排，深入虎穴做反間諜工作。 |
 金夢 | 溫崢嶸飾演金夢 表面是TTC公司董事長，實為境外間諜組織成員。主要目的是竊取中國重要的火箭微量元素公式，卻在行動過程中愛上了國家安全局偵察科副科長林雲飛，假戲真做。但最終為了所謂的信仰，還是決定謀殺林雲飛。 |
 董智超 | 於恆飾演董智超 偵察科副科長，電腦達人，熟練掌握各種高科技刑偵技術。在後方支援中，多次幫前線人員化險為夷。與石慧搭檔，配合林雲飛的反間諜工作。 |
 石慧 | 李悅溪飾演石慧 新上任的偵查科長，心理素質極高，平日冷漠幹練，私底下被同事稱為“冷美人”。因為任務的需要，經常變換身份來麻痹敵人。與董智超搭檔，配合林雲飛的反間諜工作。 |
音樂原聲
| 歌曲名稱 | 演唱者 | 作詞 | 作曲 | 備註 |
|---|---|---|---|---|
| 《永遠還有多遠》 | 姚貝娜 | 撈仔 | 撈仔 | 片尾曲 |
播出信息
播出平台| 播出日期 | 播出平台 |
|---|---|
| 2008年6月20日 | 央視電視劇頻道 |
| 2008年10月16日 | 廣州影視頻道 |
幕後花絮
國家機密2 2005年，《國家機密》熱播，曾掀起反間諜題材電視劇的熱潮。2008年6月，央視影視部、江蘇中天龍文化傳媒等單位拍攝的《國家機密2》完成製作，並且收到央視“訂單”，將於20日起在央視8套晚間黃金檔播出。
沒開機就接到央視“訂單”
《國家機密》2005年在央視播出，曾創下收視熱潮，此後3年時間裡，在央視各頻道滾動播出達11次。該劇總製片人隆曉輝表示，“該劇揭秘發生在國家隱蔽戰線的故事，不僅內容新鮮，而且塑造的人物傳神可信，劇情曲折，具備了吸引觀眾的眾多因素。”正因如此，《國家機密》拍攝第二部，由谷智鑫、溫崢嶸、丁勇岱、鮑國安等人主演，繼續講述國安幹警與境外間諜智斗的故事。據悉，《國家機密2》還在劇本醞釀階段，就收到了央視的“訂單”。
谷智鑫演偵察員嘗試轉型
《國家機密2》邀請年輕英俊的谷智鑫挑大樑，接班吳若甫。憑藉電視劇《恰同學少年》走紅，谷智鑫表演穩健、外型陽光，為其增色不少。參演《國家機密2》，他飾演偵察科副科長林雲飛，是個深入虎穴做反間諜工作的人物。
谷智鑫說，“這次出演林雲飛這個角色，是對我自己的一次挑戰。在劇組中，鮑國安等前輩拍戲時那份敬業，是我學習的榜樣。我還年輕，在藝術道路上剛剛起步，希望嘗試各種戲路，塑造各種不同的人物。”
溫崢嶸演“電視版”王佳芝
作為一部反間諜劇，《國家機密2》中也少不了女性的角色，導演組幾經挑選，鎖定溫崢嶸，她出演了一位年輕貌美卻心狠手辣的A國女間諜金夢。溫崢嶸畢業於北京電影學院，她是黃磊的得意門生。
溫崢嶸告訴記者，“金夢這個角色是間諜中的重要人物，她有意竊取中國重要的火箭微量元素公式，卻不知不覺愛上了國家安全局偵察科副科長林雲飛。”談起角色，溫崢嶸說，“與《色戒》中的王佳芝有幾分相似，只是金夢最後選擇去謀殺林雲飛。”
幕後製作
國家機密2 為了超越第一部，《國家機密2》劇組煞費苦心，借鑑匯集了國內外很多反間諜工作的先進 偵察 手段。
該劇最後一個鏡頭要拍攝溫崢嶸在地下車庫和敵人打鬥，被谷智鑫飾演的國安人員救起。為了拍攝效果逼真，溫崢嶸不用替身親自上場。試拍沒有問題，但實拍時，剎車卻失靈了，還好武行演員把方向盤猛地轉向左邊，車子撞到旁邊的柱子上停了下來，沒有發生危險。
劇集評價
《國家機密2》的時代特徵明顯，故事情節沒有拔高劇中 主人公 的境界，而是於細膩處刻畫出人物的性格，讓觀眾感受到真實，感覺到藝術形象與生活形象貼得很近。劇中人物栩栩如生，情節似章回小說，引人入勝。《國家機密2》中的“國家”主流意識形態強化了導向功能，在精品意識、導向意識和客群意識方面努力探索，成為一部精神緯度上能夠直指人心的作品，同時，該劇也從另一個側面證明了有生命力的電視劇必定是具有獨特藝術魅力的作品。（ 新浪娛樂 評）《國家機密2》客觀地反映了國家堅決打擊他國間諜非法竊取國家機密的決心和勇氣，捍衛祖國的權益不受外來侵犯。一定程度上也喚起國人對間諜危害性的認識，增強國人的愛國意識，對國家機密的保護意識。在故事的講述上也有很強觀賞性，真實性。它設定了許多富於懸念性的，曲折性的情節，使故事變得更真實，更引人入勝。（ 新浪娛樂 評）
