WinNonlin有兩個版本：專業版、企業版。專業版中包含了藥動學及藥效學分析的各種工具，企業版比標準版增加了幾個模組，主要用於商業用途。由Pharsight公司生產的WinNonlin的配套產品還包括：WinNonmix軟體(用於群體藥動學分析)和PharsithtTrialSimulator軟體(用於臨床試驗設計的模擬)。
(1)計算分析功能
包括：①房室模型分析(compartmentalModelling)：處理各種非線性回歸問題;參數估計問題;各種微分方程系統(包括微分方程和一般方程的混合系統);模擬功能使用戶可看到不同用藥方案或參數調整後的藥效變化;提供了廣泛的模型庫，能解決絕大多數的模型擬合問題，包括藥代模型、藥效模型、間接回響模型、藥代藥效聯合模型等;用戶可用內置的程式語言來自定義模型;使用了動態記憶體管理技術，可處理大型數據和複雜模型。
②非房室模型分析(NoncompartmentalAnalysis)：可由血或尿數據計算AUC0-n、AUC0-∞、Cmax等參數;可計算穩態數據的參數;可在半對數圖中選擇終末消除相或由程式自動選擇;三種方法計算AUC;計算任意終點的AUC等。
(2)輸入輸出管理功能
包括：①通過了和EXCEL兼容的工作表和工作薄檔案來管理輸入輸出的數據。②數據編輯能力很強大，如：可用公式和函式建立和修改數據、導入導出ASCII和EXCEL檔案數據檔案、分類合併數據檔案、剪下和貼上等。③使用基於模板的結果輸出嚮導，很容易產生結果報告，這些報告將輸入的數據和計算結果用不同的方式顯示，並可在WORD或EXCEL中使用。④圖表功能形象化地顯示數據，可進行編輯修改。⑤單位定義和轉換能力，包括指定輸出單位、指定給藥方案、在數據集內部處理劑量換算問題等。⑥可從基於ODBC(OpenDatabaseconnectivity，開放式資料庫互連)的資料庫中讀取或存儲數據。
(3)統計功能
包括：①描述性統計：可對輸入輸出的數據產生一般的概要性的統計，除了常規的描述性統計量外，還包括幾何均數、調和均數、對數的均數和標準差、百分數、可信區間等;另外加權的描述性統計，如均數、標準差及標準誤的加權統計量。②ANOVA/GLM模組(專業版和企業版)提供更專業的統計功能：可統計分析來自交叉設計、平行設計甚至非均衡設計的數據;用戶可自定義誤差條件;生物等效性統計，包括Anderson-Hauck法、Westlake可信限法、經典可信限法、雙向單側t檢驗等。
(4)"工具箱"(toolbox)功能及幫助功能
"工具箱"功能提供一些便於藥動學研究的工具：①非參數重疊法(NonparametricSuperpositon)，用來預測多劑量用藥後達到穩態的血藥濃度。②半房室模型法(Semi-compartmentalModeling)，用來估算給定時間和血漿濃度的效應地點濃度。③交叉試驗設計(CrossoverDesign)等。④Winnonlin提供了廣泛的線上幫助(On-LineHelp)和指導課(TutorialLesson)，為用戶節省大量的學習和使用軟體的時間。
WinNonlin是國外最常用的PK和BA/BE軟體
最新版為phoenix 6.1.0.173
