但是,MS-06R-2型的表現證明自護尼克公司的工程師們曾作出過相當大的努力。MS-06R-2的總體性能要高於MS-06R-1A。這種型號的MS在自護的Granada基地進行生產,一共生產了4台,並且參加了確定它是否適合量產的測試。如它被選中的話將成為自護公國的過渡型的宇宙用量產型MS。
在UC0079年的十月,自護的高層開始了對ZIONIC公司的MS-06R-2和ZIMMAD公司的MS-09R的比較,測試結果證明,雖然MS-06R-2在某些性能上較MS-09R更好,但它太過昂貴,結構太複雜不利於大量生產。因此,MS-06R-2的量產計畫取消,四台已經生產了的MS-06R-2中,有三台分配給王牌駕駛員(Johnny ridden,Gabby Hazzard以及Robert Gilliam)。至於最後的那一台則留在了Granada,進行進一步的測試。