Gold[軟體]

GOLD是一款由英國劍橋大學晶體數據中心開發的一款分子對接程式。GOLD是一個計算大分子與小分子結合模式的分子對接程式,是Sheffield大學,laxoSmithKline公司和CCDC協作的產物。

軟體

GOLD是一款由英國劍橋大學晶體數據中心開發的一款分子對接程式。GOLD是一個計算大分子與小分子結合模式的分子對接程式,是Sheffield大學,laxoSmithKline公司和CCDC協作的產物。因其準確性和可靠性在分子模擬圈內評價很高。

GOLD的遺傳算法最適合虛擬篩選和並行計算。
發布的版本可在商業的PCGRID系統上使用。它採用遺傳算法(GA)進行蛋白-配體對接;對接時配體完全柔性和蛋白部分柔性;能量函式部分依賴於來自CSD資料庫的構象和非鍵接觸;打分函式有GoldScore、ChemScore和用戶自己定義的打分函式;多種限制選項;對接結果後處理工具:SILVER;自動考慮活性口袋內結合的水分子;改進的處理金屬配位結構方法;對特別的配體自動衍生GA設定。

清華大學、中科院上海藥物研究所等大型科研單位都已引進該軟體,與LigandScout配套使用。國內大多生物藥物企業生產藥品是將國外過期專利廉價打包購買回來宣稱填補國內空白,很少有能力在藥物方面進行尖端科研。Gold是進行尖端科研必備軟體之一。

光學軟體包

GOLD-自主開發的複雜光學系統分析最佳化軟體包

GOLD是我校在國家自然科學基金委員會的長期支持下研製成功的大型光學設計軟體包。它可以對各種光學系統進行像質分析和結構最佳化,其適用範圍囊括了目前國內外用於光學成像系統設計製造的各種技術。

在GOLD軟體研製發展的不同階段,先後通過了由中國光學學會名譽理事長王大市院士和理事長母國光院士主持的部級鑑定,被評為“理論新穎、計算可靠、功能齊全、使用方便,為我國光學設計的發展作出了重要貢獻,達到國際先進水平並處於國際前列地位”。有關的獲獎項目包括:《非常規複雜光學系統計算機輔助設計的研究》成果獲1991年度中國科學院科技進步二等獎,《軍用光電光學系統的像質評價和結構最佳化》獲1996年度部級科技進步H等獎,《近代複雜光學系統的最佳化設計及在光電工程中的套用》獲1998年度國家科技進步王等獎。

1992年以來,GOSA—GOLD軟體已在國內大範圍推廣使用,用戶單位包括中國科學院、中國工程物理研究院、國防科工委、教育部所屬的絕大多數光學研究單位,也有許多工廠企業,已套用本程式成功地設計研製了多種光學系統。在國防領域中,其套用範圍涵蓋了衛星、飛機、飛彈、坦克、艦船、防空系統各個方面,許多屬於國家重點項目;有關生產企業也用其設計了照相器材、醫療儀器、體視顯微鏡、投影電視等許多產品。廣大用戶單位一致給予GOSA—GOLD軟體高度評價,認為它“功能齊全,性能優良”,“計算可靠,使用方便”,是“不可多得的優秀光學設計軟體”,“工作中不可缺少的工具”,用其“解決了許多以往未能解決的問題”,“為項目的順利完成奠定了基礎”。充分說明本研究成果正在為我國國防科研和光學工業的發展發揮著重要的作用。

GOLD軟體分析最佳化的複雜光學系統,可以含有各種複雜曲面、複雜稜鏡和複雜光欄;可以含有菲涅爾透鏡、光柵、全息、二無光學、漸變折射率等特殊元件;可以含有們心、傾斜元件和各種掃描機構相成非共輸光路;可以帶有曲面物、像面;也可以是各種多重結構系統,即包括可變焦鏡頭、多光路系統、在不同光波段上使用的系統、用附加鏡頭改變放大率的系統,等等。當然,程式同樣可以處理最普通的共軸球面系統。同時,本程式對光學系統的總面數沒有限制,只要求所有(獨立)系統參數的總和不超過1000個。

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