台灣大學史語所助理研究員(1977.1-1984.7)，副研究員(1984.8-1993.5)，研究員(1993.5-2003.7)，兼任研究員（2003.9-）
學位論文"The Recruitment and Assessment of Civil Officials under the T'ang Dynasty" (PhD diss., Princeton University, 1986).
專書《元代戶計制度研究》（國立台灣大學文史叢刊45，台北：國立台灣大學，1977）。
《酒與中國文化》（文化資產叢書，台北：文建會，1991，1999增訂一版）。
《黑金與黃金：基隆河上中游地區礦業的發展與聚落的變遷》（台北：台北縣立文化中心，1995）。
〈遼史「射鬼箭」初探──從宗教和法律觀點所作的分析〉，《史原》4 (1973)：55-78。
〈元代戶計的劃分及其政治社會地位〉，《台灣大學歷史學報》2 (1974)：113-137。
〈元代諸色戶計的經濟地位〉，《食貨月刊》6.3 (1976)：1-24。
〈元初江南的叛亂 (1276-1294)〉，《中央研究院歷史語言研究所集刊》49.1 (1978)：37-76。後收入中華文化復興運動推行委員會編，《中國史學論文選集》（台北：幼獅文化事業公司，1981），第4輯，頁285-347。
〈唐代的僱傭勞動〉，《中央研究院歷史語言研究所集刊》49.3 (1978)：393-438。
"The Li-chia System in Ming Times and Its Operation in Ying-t'ien Prefecture,"The Bulletin of the Institute of History and philology 54.4 (1983): 103-156.
〈唐代的文官考課制度〉，《中央研究院歷史語言研究所集刊》55.1 (1984)：139-200。本文經節錄後，收入中國唐代學會編，《唐代研究論集》（台北：新文豐出版公司，1992），第1輯，頁381-476。原稿「附錄」部分未收入。
〈唐代散官試論〉，《中央研究院歷史語言研究所集刊》58.1 (19870：133-208。
〈高駢縱巢渡淮──唐代藩鎮對黃巢叛亂的態度研究之一〉，《大陸雜誌》80.1 (1990)：3-22。本文初稿經朴根七譯成韓文，發表於《東亞文化》26 (1988)：123-173。
〈宋威與王、黃之亂──唐代藩鎮對黃巢叛亂的態度研究之二〉，《中國近世社會文化史論文集》（台北：中央研究院歷史語言研究所，1992），頁1-37。
〈楊復光《收復京城奏捷露布》考〉，《中國史學》2（東京：中國史學會，1992），頁59-78。
〈從《扶餘隆墓誌》看唐代中韓關係〉，《大陸雜誌》85.6 (1992)：9-27。本文經金善昱譯成韓文，發表於百濟研究叢書第三輯，《百濟史比較研究》（韓國：忠南大學校百濟研究所，1993），頁273-321。
〈王鐸與晚唐政局──以討伐黃巢之亂為中心〉，《中央研究院歷史語言研究所集刊》63.2 (1993)：207-267。
〈忠武軍：唐代藩鎮個案研究〉，《中央研究院歷史語言研究所集刊》64.1 (1993)：89-134。
〈說「保辜」──唐代法制史料試釋〉，《第二屆國際唐代學術會議論文集》（台北：中國唐代學會，1993），頁971-1005。
〈兩唐書酷吏傳析論〉，《輔仁大學歷史學報》5 (1993)：119-166。
〈圓仁與唐代巡檢〉，《中央研究院歷史語言研究所集刊》68.4 (1997)：899-942。
〈杜牧論藩與軍事〉，收入氏編，《結網編》（台北：東大圖書公司，1998），頁351-405。
〈唐末五代的黥卒〉，收入黃克武主編，《軍事組織與戰爭──第三屆國際漢學會議論文集‧歷史組》（台北：中央研究院近代史研究所，2002）頁79-157。
〈和而不同──逯耀東教授的史學和文化關懷〉，收入周梁楷編，《結網二編》（台北：東大圖書公司，2003），頁1-39。
〈享鬼與祀神〉，收入蒲慕州編，《鬼魅神魔──中國通俗文化側寫》（台北：麥田出版社，2005），頁175-220。
〈不古不今之學與陳寅恪的中古史研究〉，收入黃清連編，《結網三編》（板橋：稻鄉出版社，2007），頁151-221。
〈評介陶晉生教授著《十二世紀華北女真漢化研究》〉，《中華文化復興月刊》10.7 (1977)：124-130。
〈評介蕭著《元代軍事制度》〉，《食貨月刊》9.5/6 (1979)：225-227。
"Review of State and Scholars in T'ang China by David McMullen,"Chinese Literature, Essays, Articles and Reviews 12 (1990): 143-144.
〈唐末的黃頭軍〉，發表於中央研究院歷史語言研究所主辦，「中國歷史上的軍事與社會」國際研討會，台北：中央研究院歷史語言研究所，2000年12月22-24日。
〈唐末五代淮南地方武力試論〉，發表於中國歷史學會、國立政治大學、新史學社等主辦，第三屆中國史學會──「基調與變奏：7-20世紀的中國」國際學術研討會，台北：國立政治大學，2007年9月3-5日。
黃清連主編，《北縣鄉土與社會大系》（台北：台北縣立文化中心，1995），全6冊）。
黃清連主編，《結網編》（台北：東大圖書公司，1998）。
黃清連編，《制度與國家》（北京：大百科全書出版社，2005）。本書為《台灣學者中國史論叢》第二分冊。
黃清連編，《結網三編》（板橋：稻香出版社，2007）。
〈中國中世時期的商業與商人〉，《歷史月刊》創刊號 (1988)：122-130。
〈為「唐人書黃巢之亂記事墨跡」定位〉，《歷史月刊》4 (1988)：130-131。
〈「負心門生天子」與「定策國老」：論唐昭宗初期的宮廷政治〉，《歷史月刊》14 (1989)：45-52。
〈「廿五史全文資料庫」與中國歷史的研究〉，《新史學》2.2 (1989)：123-127。
〈意氣驕滿路、鞍馬光照塵──唐代宦官雜談〉，《歷史月刊》65 (1993)：47-52。
〈貢寮的滄桑──鄉土札記之一〉，《北縣文化》43 (1995)：4-8。
〈烏衣巷口夕陽斜：從礦業聚落性格看九份發展〉，《北縣文化》45 (1995)：6-14。
〈萬國衣冠拜冕旒：多元族群與唐代文化〉，《歷史月刊》94 (1995)：37-41。
〈誰知雲朔外，更睹史詩歸──晉北考察有感〉，《大同考察匯報：唐宋時期的社會流動與社會秩序項目考察》（北京：北京大學中國古代史研究中心，2004.11）。
