職責
一、主要任務
(一)根據國家、省有關部門下達、委託的重點項目和攻關研究課題，針對我區農、牧業生產中的關鍵科學技術問題，組織所屬單位開展科學研究。
(二)積極開展農業科技的引進、篩選、組裝配套，搞好農業產前、產中、產後科技服務；促進科研成果迅速轉化為生產力，使之產生較好的經濟效益、社會效益和生態效益。
(三)加強農業科技隊伍建設，通過科學研究和技術開發，培養出一支結構合理、功能最佳化、精幹高效的農業科技人才隊伍。
(四)深化科技體制改革，逐步建立適應社會主義市場經濟體制和科技自身發展規律的農業科研運行機制。
(五)承辦市政府交辦的其他事項。
內設機構
根據上述主要任務，市農業科學研究所內設4個科、室。
(一)辦公室
協助所領導處理日常工作，負責文秘、機要、保密、檔案、信息、計畫生育、安全保衛、接待、後勤服務等工作。
(二)人事教育科
負責人事、機構編制、勞動工資、幹部職工教育和退休離休人員服務管理工作；負責黨委日常工作。
(三)科研開發科
負責全所科研開發規劃、計畫、規章制度的制訂和實施；負責科研課題的論證、立項、實施、檢查、驗收，科研成果的申報和科研條件的管理工作；負責組織實施基地建設、區域開發工作。
(四)計畫財務科
編制本所年度財務預算並組織實施；負責制定全所各項財務會計管理制度並監督執行；負責國有資產管理；負責所屬單位的財務管理、審計工作。
三、科研機構
市農業科學研究所設6個科研機構。
(一)駐馬店市農業科學研究所糧食作物研究中心。主要從事小麥、大麥、玉米、水稻、大豆、紅薯等糧食作物品種資源的蒐集利用；新品種(系)新組合的選育、引進及高產栽培技術研究與示範推廣。
(二)駐馬店市農業科學研究所油料作物研究中心。主要從事芝麻、油菜、花生等油料作物品種資源的蒐集利用；新品種(系)選育、引進及高產栽培技術研究與示範推廣。
(三)駐馬店市農業科學研究所園藝研究中心。主要從事果、瓜、菜、花及特種作物的品種選育引進和栽培技術、加工利用技術研究。
(四)駐馬店市農業科學研究所植物保護研究中心。主要從事在我市生態條件下的病、蟲、草、鼠害的發生、發展危害規律及其防治技術研究；農藥新品種的引進和使用技術研究。
(五)駐馬店市農業科學研究所土壤肥料研究中心。主要研究不同土壤的理化性質及其現狀的利用與改良；研究不同作物的配方施肥、科學用肥技術；開展土壤、肥料及作物產品品質的化驗分析。
(六)駐馬店市農業科學研究所農業科技示範推廣中心。主要從事新品種(系)的原原種、原良種繁殖，“一優雙高”開發，新品種、新技術的引進試驗、示範推廣及原良種基地建設。
