人物經歷
1994年西安交通大學高分子材料系學士，1997年四川大學化學纖維碩士，2003年法國巴黎第七大學計算化學博士。2005年至2006年在美國加州大學爾灣分校進行博士後研究。2007年1月回國, 現為上海交通大學生命科學技術學院副教授，碩士生導師。上海生物信息技術研究中心課題組長。
研究方向
1）利用分子動力學模擬研究天然無規生物大分子在配體耦合下的摺疊機理。
2）與老年痴呆相關的澱粉纖維蛋白錯誤摺疊的分子機理。
3）利用生物信息學的方法研究microRNA上調蛋白翻譯的分子機制。
4）計算機輔助創新藥物設計
主要貢獻
在天然無規的生物大分子摺疊機理和抗愛滋病藥物設計等方面進行了比較深入的研究，並在JACS，Nucleic Acids Research, RNA等國際著名學術期刊發表了50多篇SCI論文，其中本人為第一作者或通信作者的SCI文章37篇，SCI影響因子累計超過130。申請四項專利，八項軟體著作權。
發表論文
1. Fang Qin, Wei Ye, Yue Chen, Xiaodong Chen, Yixue Li, Jian Zhang, H. F. Chen*. Specific Recognition between Intrinsically Disordered LEF and DNA. Phys. Chem. Chem. Phys. 14: 538-545, 2012. (IF=3.45)。
2. Z. Huang, L. Zhu, Y. Cao, G. Wu, X. Liu, Y. Chen, Q. Wang, T. Shi, Y. Zhao, Y. Wang, W. Li, Y. Li, H.F. Chen*, G. Chen, Jian Zhang. ASD: a comprehensive database of allosteric proteins and modulators. Nucleic Acids Research. 39: D663–D669, 2011 (Database issue). (IF=7.84)。
3. J. Xiong, H. Wang, G. Guo, S. Wang, L. He, H. F. Chen*, J. Wu. Male Germ Cell Apoptosis and Epigenetic Histone Modification Induced by Tripterygium wilfordii Hook F. PLoS ONE 6: e20751, 2011. (IF=4.41)。
4. F. Qin, Y. Jiang, Y. Chen, M. Wu, G. Yan, W. Ye, Y. X. Li, J. Zhang, H. F. Chen*. Conformational Selection or Induced Fit for Brinker and DNA Recognition. Phys. Chem. Chem. Phys. 13，1407-1412, 2011. (IF=3.45)。
5. H. Zhang, F. Qin, W. Ye, Z. Li,S. Ma, Y. Xia, Y. Jiang, J. Zhu, Y. Li, J. Zhang, H. F. Chen*. Revealing the Drug-Resistant Mechanism for Diarylpyrimidine Analogue Inhibitors of HIV-1 Reverse Transcriptase. Chem Biol Drug Des 78:427-437, 2011. (IF=2.53)。
6. Z. Li, H. Zhang, Y. Li, J. Zhang, H. F. Chen*. Drug Resistant Mechanism of Diaryltriazine Analog Inhibitors of HIV-1 Reverse Transcriptase Using Molecular Dynamics Simulation and 3D-QSAR. Chem Biol Drug Des 77:63-74, 2011. (IF=2.53)。
7. F. Qin, Y. Chen, M. Wu, Y. X. Li, J. Zhang, H. F. Chen*. Induced Fit or Conformational Selection for RNA/U1A folding. RNA 16:1053-1061,2010. (IF=6.05)。
8. Y. Chen, Y.J. He, M. Wu, G. Yan, Y.X. Li, J. Zhang, H. F. Chen*. Insight into the Stability of Cross-β Amyloid Fibril from Molecular Dynamics Simulation. Biopolymers 93: 578-586, 2010. (IF=2.61)。
9. Y. Chen, Z. Li , H. F. Chen*. Computational Study of CCR5 Antagonist with Support Vector Machines and Three Dimensional Quantitative Structure Activity Relationship Methods. Chem Biol Drug Des 75: 295-309, 2010. (IF=2.53)。
10. H. F. Chen*. Post-translational Modification of Phosphorylated KID from Molecular Dynamics Simulation. PLoS ONE 4: e6516, 2009. (IF=4.41)。
11. F. Qin, Y. Chen, Y. X. Li, H. F. Chen*. Induced Fit of mRNA/TIS11d Complex. J. Chem. Phys. 131: 115103, 2009. (IF=3.05)。
12. H. F. Chen*. Aggregation Mechanism Investigation of the GIFQINS cross- Amyloid Fibril. Comput. Bio. Chem. 33: 41–45, 2009. (IF=2.19)。
13. H. F. Chen*. Mechanism of Coupled Folding and Binding in the siRNA-PAZ Complex. J. Chem. Theory Comput. 4: 1360-1368, 2008. (IF=5.14)。
14. H. F. Chen*. Quantitative predictions of gas chromatography retention indexes with support vector machines, radial basis neural networks and multiple linear regression. Analytica Chimica Acta 609:24-36, 2008. (IF=4.35)。
15. H. F. Chen*. Computational study of histamine H3-receptor antagonist with support vector machines and three dimension quantitative structure activity relationship methods. Analytica Chimica Acta 624:203-209, 2008. (IF=4.35)。
16. J. Wang, C. Tan, H. F. Chen, Ray Luo. All-Atom Computer Simulations of Amyloid Fibrils Disaggregation. Biophysics Journal. 95:5037-5047, 2008. (IF=4.39)。
17. H. F. Chen.* In Silico logP Prediction for a Large Data Set with Support Vector Machines, Radial Basis Neural Networks and Multiple Linear Regression. Chem Biol Drug Des 74: 142–147, 2009. (IF=2.53)。
18. H. F. Chen*. Computational Study of the Binding Mode of Epidermal Growth Factor Receptor Kinase Inhibitors. Chem. Biol. Drug Des. 71:434-446, 2008. (IF=2.53)。
19. Z. Li, J. Han, H. F. Chen*. Revealing Interaction Mode between HIV-1 Reverse Transcriptase and Diaryltriazine Analog Inhibitor. Chem. Biol. Drug Des. 72:350-359, 2008. (IF=2.53)。
20. H. F. Chen*, M.Y. Wu, Z. Wang, D.Q. Wei. Insight into the Metabolism Rate of Quinone Analogues from Molecular Dynamics Simulation and 3D-QSMR Methods. Chem Biol Drug Des. 70:290–301, 2007. (IF=2.53)。
21. H. F. Chen, R. Luo. Binding induced folding in p53-MDM2 complex. J. Am. Chem. Soc. 129:2930-2937, 2007. (IF=9.02)。
研究成果
最近主持的科研項目：
1）主持國家自然科學基金一項（項目編號30770502）。
2）主持上海市浦江人才計畫 （項目編號10PJD010）。
3）主持上海市自然科學基金一項（項目編號10ZR1414500）。
4）主持上海市教委創新重點項目一項（項目編號12ZZ023）。
5）主持973項目子課題一項（項目編號2012CB721003） 。
獲獎記錄
獲上海市科技進步一等獎一項。
