陝西中醫藥大學藥學院前身中藥系始建於1973年，1989年更名為藥學系，2008年更名為藥學院。開設有中藥學、製藥工程、市場行銷、藥物製劑、藥學、中藥資源與開發、中藥製藥7個本科專業。中藥學專業2003年被陝西省人民政府命名為陝西省名牌專業，2009年被評定為省級特色專業， 2010年被國家教育部確定為國家級特色專業建設點，2012年被教育廳評定為“省級專業綜合改革試點”；製藥工程專業2011年被省教育廳評定為省級特色專業建設點。現有省級中藥人才培養模式創新實驗區1個，省級大學生校外實踐教育基地2個，省級教學團隊2個（中藥學、中藥製藥），省級示範實驗中心1個（製藥工程中心）。
藥學院學科門類齊全，現設有中藥學1個一級學科碩士點，涵蓋中藥學、中藥藥理、中藥藥劑、中藥鑑定、中藥炮製、中藥化學等6個二級學科20多個碩士研究生招生方向。具有“中藥藥理學”、“臨床中藥學” 、 “中藥化學”3個國家中醫藥管理局重點學科，“中藥製藥學” 1個省級重點學科，“生藥學”、“中藥炮製學”2個校級重點學科。有“中藥學”、“中藥藥理學”、“中藥化學”3門省級精品資源共享課程。擁有陝西中醫學院藥物研究所、陝西省中藥飲片技術工程研究中心、陝西省中藥基礎與新藥研究重點實驗室、陝西省秦嶺中草藥套用開發工程技術研究中心、中藥藥理、中藥製劑國家中管局三級實驗室等省部級以上科研平台8個。近年來，先後承擔國家科技支撐計畫、科技部重大新藥創製、國家自然科學基金等省部級以上課題70餘項。
陝西中醫藥大學藥學院師資力量雄厚，現有教工139人，其中高級職稱教師53人，具有博士學位教師49人，研究生導師53人。下設17個二級機構，包括中藥教研室、藥理教研室、生藥教研室、中藥化學教研室、中藥藥劑教研室、中藥炮製教研室、化學教研室、製藥工程教研室、藥品經營與管理教研室、分析測試實驗中心、生藥實驗中心、藥理實驗中心、製藥工程實驗中心、中心儀器室、中藥標本館、國家藥品臨床研究基地Ⅱ期實驗中心、藥學院黨政辦公室。
陝西中醫藥大學藥學院始終堅持知識、能力、素質綜合培養和全面發展的教育理念。近年來，曾榮獲教育部及陝西省“大學生創業創新訓練計畫項目”20餘項，連續7年被省委宣傳部、團省委、教育廳聯合授予“陝西省大學生暑期 ‘三下鄉’社會實踐先進團體”，多次榮獲全國大學生數學建模比賽陝西賽區一等獎、二等獎。
