簡介
生產企業在進行進料加工登記手冊上計畫進口和計畫出口的貨物全部進口、出口完畢後，在向海關申請核銷前，應將進料加工登記手冊上的全部進口、出口明細記錄進行複印，在海關將手冊核銷後，持下列資料到主管退稅機關辦理手冊核銷手續。
1、向海關辦理核銷的、記有全部記錄的《進料加工登記手冊》複印件；
2、《生產企業進料加工海關登記手冊核銷申請表》；
3、間接出口貨物的報關單複印件及發票複印件；
4、間接進口貨物的報關單複印件及發票複印件（指開具增值稅發票或普通發票，未作為進口料件申報的部分）；
5、向海關補稅的稅收繳款書複印件（增值稅、關稅）；
6、海關簽發的《加工貿易手冊結案通知書》原件；
7、電子數據；
注意：在申報手冊核銷前，需將此本手冊上所有的進口報關單和出口報關單向主管稅務機關申報完畢並經稅務機關審核結束。
審核須知
企業在《生產企業進料加工登記手冊核銷申請》後，應按以下要求進行審核：
1、 海關簽發的《進料加工登記手冊核銷通知書》所核銷的手冊號是否與企業申請核銷的手冊號一致；
2、 “結轉至其他手冊成品”指生產的產品未直接出口，而是在海關保稅監管下結轉至其他手冊或銷售給其他企業產品銷售額；結轉至其他手冊成品金額與間接出口報關單上的出口金額合計數及間接出口貨物總值是否一致。
3、 “剩余殘次成品”是指手冊契約履行完後，剩餘的殘次成品、半成品折人民幣金額；“剩餘邊角余料”手冊契約履行完後，剩餘的邊角余料折人民幣金額；剩餘殘次成品金額換算（根據手冊上的單耗計算）為所耗用的免稅進口料件金額與剩餘邊角余料金額之和與海關補征關稅的計稅依據（扣除應補消費稅）是否一致。
4、 “其他減少出口成品”指生產的產品發生內銷、損失等沒有出口，或雖已出口但未經稅務機關審核通過的產品銷售額或核定銷售額；
5、 “結轉至其他手冊料件”指手冊契約履行完後，未使用完的並結轉至其他手冊的進口料件金額；是否有已申報的進口料件結轉到其他手冊上再復出口的情況，如果有，應將結轉到其他手冊上的進口料件金額在“結轉至其他手冊料件”欄目反映，並應與提供的相關海關結轉材料上的金額一致。
6、 “其它減少進口料件”指進口料件發生內銷、退貨、損失等沒有參與產品生產的情況時，其料件進口金額。若業務發生時已調減了料件進口額，並向稅務機關申報過，則不參與本欄目的計算。
7、 屬海關補稅、進口退貨情況的，應在“其它減少進口料件”欄目中反映，金額應與海關補稅的計稅依據、進口退貨金額一致。
申請流程
1、 與客戶簽訂進、出口契約正本和進料耗料清單，商務局需1進1出正本，海關需要進出口契約、“進料耗料清單”正本數量與手冊數量相同用於貼上在手冊上，並按手冊數量提供契約（至少其中一份是正本，其餘的可以是複印件，但要加蓋公章）、“進料耗料清單”供其存底。
2、 辦理手續時，需向海關提交企業委託其辦理海關業務的委託書和其個人身份證複印件（加蓋單位公章）。
3、 將契約錄入電腦，上網傳輸到商務局交其審批。
4、 商務局審批後，工廠在網上列印《加工貿易業務批准申請表》、《進口料件申請備案清單》、《出口成品申請備案清單》、《出口製成品及對應進口料件消耗備案清單（1）》各1份交商務局。(僅需一份)
5、 到商務局貿管科領取蓋有“商務局加工貿易業務審批專用章”的《加工貿易業務批准證》、《進口料件申請備案清單》、《出口成品申請備案清單》、《出口製成品及對應進口料件消耗備案清單（1）》，辦幾本手冊就一式幾份。
6、 按照契約及《加工貿易業務批准證》的內容填寫進料加工登記手冊，並在相應位置加蓋單位公章，交商務局審批並蓋“商務局加工貿易業務審批專用章”。
7、 向商務局遞交《加工貿易加工企業生產能力證明》，蓋“商務局加工貿易業務審批專用章”後，商務局存1份，工廠取若干份（數量與辦手冊數量相同）憑以向海關辦理手續。
8、 將商務局審批後的手冊交國家稅務局簽署“同意辦理”字樣並加蓋稅務局公章。(此步驟好象現在不用了)
9、 交報關行進行手冊辦理預錄入。
10、 往海關加工貿易管理科辦理手冊。遞交《加工契約備案申請表》（每本手冊一份表，要填預錄入號）、契約等。
11、 如果一個契約要辦理若干本手冊，還要遞交辦理多本手冊的說明報告。
12、 向海關遞交加蓋公司公章的“生產排料圖”和“生產工藝流程”或者類似海關要求的檔案，辦幾本手冊就一式幾份。另外，又按手冊本數每手冊提交各一份供海關存檔。
13、 海關經過3級審批後，開具《銀行保證金台帳開設聯繫單》交經辦人前往中國銀行國際結算部辦理設立加工貿易進口料件保證金台帳，取回《銀行保證金台帳登記通知單》，將白色海關聯交回海關。
(如果需要辦理分冊,還將繼續下列程式)
14、 交報關行進行出口分冊辦理預錄入。
15、 向海關遞交辦理分冊的報告，填寫《加工貿易（異地報關、深加工結轉）分冊申請表》遞交海關辦理出口分冊及契約。
