表觀遺傳學前沿
作者:蔡祿
ISBN:9787302308171
定價:49.8元
印次:1-1
裝幀:平裝
印刷日期:2012-12-7
內容簡介
本書可供從事生命科學研究的人員參考,也可作為高等院校遺傳學等相關專業研究生的教材。
目錄
第1章染色質的結構與功能
1?1細胞核的結構與功能
1?1?1細胞核的結構
1?1?2細胞核的功能
1?2染色質結構
1?2?1染色質纖維
1?2?2染色質分為常染色質和
異染色質
1?3核小體
1?3?1發現歷史
1?3?2核小體的結構
1?3?3相位
1?4染色體
1?4?1染色體的化學組成
1?4?2染色體的DNA
1?4?3染色體的特徵性結構
1?5核仁結構與功能
1?5?1核仁的化學組成
1?5?2核仁的結構
1?5?3核仁的形成
1?5?4核仁的功能
參考文獻
第2章核小體定位
2?1基因組上核小體定位的實驗
圖譜
2?1?1基因組尺度核小體定位
作圖的基本策略
2?1?2基因組尺度核小體定位
圖譜
2?2基因組上核小體分布的一般
模式
2?2?1DNA轉錄相關位點鄰近
核小體分布
2?2?2DNA複製起始位點鄰近區
核小體分布
2?2?3核小體定位的“統計
定位”模型
2?3核小體定位的理論研究
2?3?1從DNA序列到核小體
定位
2?3?2基於DNA結構的物理性質
預測核小體定位
2?3?3核小體定位的反式因子
2?4鄰近核小體和染色質高級結構
影響核小體定位
2?4?1核小體串珠
2?4?2高級染色質結構的影響
2?5核小體定位與基因表達調控
2?6總結與展望
參考文獻
第3章染色質重塑
3?1染色質重塑概述
3?2SWI/SNF複合物
3?2?1SWI/SNF複合物的組成
3?2?2SWI/SNF複合物的結構域
和功能
3?2?3SWI/SNF複合物與癌症
3?3ISWI複合物
3?3?1ISWI複合物的組成
3?3?2ISWI複合物的功能
3?4CHD複合物
3?4?1CHD複合物的組成
3?4?2Chd蛋白的位置和組織表達
模式
3?4?3Chd蛋白在染色質組裝和
重塑過程的作用
3?4?4CHD家族成員的多亞基
複合物
3?4?5Chd蛋白和轉錄延伸
3?4?6發育和分化階段的
Chd蛋白
3?4?7Chd蛋白與人類疾病
3?4?8總結與展望
3?5INO80複合物
3?5?1INO80複合物的組成
3?5?2INO80複合物的功能
3?5?3SWR1複合物的組成
3?5?4SWR1複合物的功能
3?5?5總結與展望
3?6染色質重塑模式和機制
3?6?1染色質重塑模式
3?6?2染色質重塑機制
3?7總結與展望
參考文獻
第4章組蛋白修飾
4?1組蛋白修飾概述
4?1?1組蛋白的分類和性質
4?1?2組蛋白修飾的種類
4?2組蛋白修飾酶及其相關複合物
4?2?1乙醯化酶及其複合物
4?2?2組蛋白甲基化酶
4?3組蛋白變體及其修飾
4?3?1組蛋白變體概述
4?3?2組蛋白變體修飾
4?4組蛋白密碼
參考文獻
第5章DNA甲基化
5?1DNA甲基化概況
5?2真核生物DNA甲基化分布
模式
5?3真核生物DNA甲基化修飾
系統
5?3?1DNA甲基轉移酶
5?3?2甲基化結合蛋白
5?4DNA甲基化與遺傳物質的
穩定性
5?4?1DNA甲基化與DNA複製
起始
5?4?2DNA甲基化與錯配
修復
5?4?3DNA甲基化與轉座子
失活
5?5DNA甲基化與基因表達調控
5?5?1DNA甲基化直接影響一些
轉錄因子的結合活性
5?5?2DNA甲基化結合蛋白與轉
錄抑制
5?6DNA甲基化與其他表觀遺傳修飾
的關係
5?6?1DNA甲基化與核小體
定位
5?6?2DNA甲基化與組蛋白
修飾
5?6?3DNA甲基化與非編碼
RNA
參考文獻
Ⅵ
第6章RNA可變剪接的表觀遺傳學
機制
6?1引言
6?2可變剪接的基本機制
6?2?1可變剪接的基本概念
6?2?2可變剪接的基本類型
6?2?3可變剪接的基本機制
6?3轉錄與剪接同時進行的機制
6?4可變剪接受RNA聚合酶Ⅱ延伸
速率的控制
6?5可變剪接的表觀遺傳學機制
6?5?1可變剪接與核小體定位
6?5?2組蛋白修飾誘導可變
剪接
6?5?3可變剪接與DNA
甲基化
6?5?4可變剪接與組蛋白
變體
6?5?5RNA與可變剪接
6?5?6可變剪接的新模型
6?5?7可變剪接相關生物大分子
(蛋白質、DNA和RNA)
相互作用網路
6?6總結與展望
參考文獻
第7章非編碼RNA研究進展
7?1RNA干擾
7?2siRNA的研究進展
7?2?1siRNA的簡介
7?2?2siRNA的作用機制
7?2?3siRNA的特點
7?2?4RNAi的套用
7?3miRNA的研究進展
7?3?1miRNA的簡介
7?3?2miRNA的產生機制
7?3?3miRNA的作用機制
7?3?4miRNA的功能
7?3?5總結與展望
7?4piRNA的研究進展
7?4?1piRNA的發現
7?4?2piRNA的結構特徵
7?4?3piRNA的分布
7?4?4piRNA的產生機制
7?4?5piRNA的功能
7?4?6piRNA的總結與展望
7?4?7小RNA的總結與展望
7?5長鏈非編碼RNA的研究進展
7?5?1lncRNA的產生機制
7?5?2lncRNA的功能
7?5?3lncRNA與疾病
7?5?4總結與展望
參考文獻
Ⅶ
目錄
第8章假基因研究進展
8?1假基因
8?1?1假基因的發現
8?1?2假基因的結構特徵
8?2探討假基因的生物學意義
8?2?1假基因是Junk DNA?
8?2?2假基因的生物學意義
8?3假基因的識別
8?4假基因的進化
8?5假基因的分布
8?6假基因的功能
8?6?1一氧化氮合酶 (NOS)
假基因的功能
8?6?2Makorin1?p1假基因的
功能及
作用機制
8?6?3假基因干預細胞的基因沉默
機制
8?6?4假基因產生siRNAs
8?6?5假基因保護snoRNA的
作用
8?6?6假基因的轉錄與
保守性
8?6?7假基因產生基因
多樣性
8?6?8假基因的命運
8?6?9假基因的弊端
8?7總結與展望
參考文獻
第9章表觀遺傳學研究實驗技術
簡介
9?1染色質免疫共沉澱技術
9?1?1ChIP技術的原理
9?1?2ChIP on chip
9?1?3ChIP?Seq
9?2全基因組定位技術
9?2?1基因表達系列分析的原理和
實驗路線
9?2?2全基因組定位技術原理與
步驟
9?2?3套用
9?3體外組裝核小體技術
9?3?1鹽透析法體外組裝
核小體
9?3?2依賴於ATP的體外組裝
核小體方法
9?3?3體外組裝單個核小體的檢測
方法
9?3?4長片段DNA序列體外組裝
染色質的檢測方法
9?4核小體相位分析
9?4?1基本原理
9?4?2主要步驟
9?4?3注意事項
9?4?4套用
9?5DNA甲基化分析技術
9?5?1基因組整體水平甲基化
分析
9?5?2特異性位點的DNA
甲基化的檢測
9?5?3甲基化新位點的尋找
9?6染色質DNA酶Ⅰ高敏感位點的
檢測
9?6?1基本原理
9?6?2基本步驟
9?6?3注意事項
9?6?4套用
9?7體內DNA足跡法
9?7?1基本原理
9?7?2操作步驟
9?7?3注意事項
9?7?4套用
參考文獻
第10章表觀遺傳學相關資料庫
簡介
10?1核小體定位相關資料庫簡介
10?1?1傳統實驗技術條件下的
核小體定位數據
10?1?2高通量實驗技術條件下的
核小體數據
10?2可變剪接資料庫
10?2?1可變剪接資料庫概述
10?2?2ASD資料庫簡介
10?2?3ASAP資料庫簡介
10?3組蛋白修飾資料庫
10?3?1人組蛋白修飾資料庫
10?3?2酵母組蛋白修飾
資料庫
10?4DNA 甲基化的相關資料庫
10?5非編碼RNA相關資料庫簡介
10?5?1siRNA資料庫介紹
10?5?2miRNA資料庫介紹
10?5?3piRNA資料庫介紹
10?5?4lncRNA相關資料庫
介紹
10?5?5非編碼RNA組資料庫
NONCODE
參考文獻
第11章表觀遺傳學的功能
11?1幹細胞的分化
11?1?1胚胎幹細胞的分化
11?1?2成體幹細胞的分化
11?2X染色體失活
11?2?1X染色體隨機失活的
起始
11?2?2Xist RNA介導的X染色體
沉默以及失活X染色體的
異染色質化
11?3基因組印記
11?3?1哺乳動物的印記基因
11?3?2基因組印記的周期及
機制
11?3?3基因組印記的進化
11?4衰老的表觀遺傳學
11?4?1衰老過程中的表觀
遺傳學
11?4?2衰老相關疾病的表觀
遺傳學
11?5記憶過程中的表觀遺傳學
11?5?1組蛋白的乙醯化修飾與依賴
於腦海馬的記憶行為
11?5?2組蛋白的乙醯化修飾與不依
賴腦海馬的記憶行為
11?5?3其他形式的組蛋白修飾與
記憶行為
11?5?4DNA甲基化與記憶的
形成及儲存
參考文獻