萬亞紅擅長：
先天性心臟病的手術治療，包括簡單先心病和複雜先心病，如房間隔缺損、室間隔缺損、肺動脈狹窄、卵圓孔未閉、動脈導管未閉、法洛氏四聯症等。常見多發病的診斷和治療，如普胸肺葉切除、食管癌切除、縱隔腫瘤切除、房室間隔缺損修補、二尖瓣置換術等，在搶救心臟刺傷、急性心包壓塞、創傷性膈疝、等重危病人方面經驗豐富，對急診胸部手術、疑難重症病情的診治經驗豐富。
萬亞紅著有以下論文：
·保留瓣下結構對二尖瓣置換術後機械瓣血流動力學的影響
·保留瓣下結構對二尖瓣置換術後室壁運動的影響
·都卜勒超聲與同步心電圖測定正常人左室收縮期時相的方法學研究
·雙瓣膜置換術中人工瓣膜的匹配
·胸部穿透性損傷解剖評分重傷值的探討
·修正胸部穿透傷生理評分的初步探討
著作文獻：
1、李小波；陳宇翔；萬亞紅；鄔雲龍；肖明第；低齡低體重患兒經胸小切口封堵房、室間隔缺損的個性化治療及療效 2011-11-10
2、李小波；萬亞紅；鄔雲龍；肖明第；低齡低體重患兒經胸小切口封堵膜周部室間隔缺損的策略及早期療效2012-11-20
3、萬亞紅；心臟瓣膜退行性改變或(和)原發性粘液變性1994-02-15
4、沈學東；萬亞紅；蔣振斌；洪濤；黃士通；施純敏；施月芳；朱慧君；陳灝珠；原發性心臟瓣膜粘液變性的診斷:超聲心動圖與手術和病理的對照1997-01-05
5、程可洛；陳安清；張光休；萬亞紅；雙腔右心室的診斷及外科治療1997-07-20；
6、萬亞紅；張光休；程可洛；蘇庭寶；李傑；何悅慨；雙瓣膜置換術中人工瓣膜的匹配2000-02-28
7、萬亞紅；石應康；唐紅；武忠；方強；保留瓣下結構對二尖瓣置換術後機械瓣血流動力學的影響2001-03-15
8、唐紅；黃承孝；萬亞紅；石應康；二尖瓣置換術後左室構型、室壁運動和左室血流動力學的研究2003-04-06
9、萬亞紅；石應康；唐紅；武忠；方強；保留瓣下結構對二尖瓣置換術後室壁運動的影響2004-01-15
10、萬亞紅；唐紅；石應康；都卜勒超聲與同步心電圖測定正常人左室收縮期時相的方法學研究2004-08-30
11、萬亞紅；肖明第；張建卿；馮曉東；賈寶成；保留瓣下結構的二尖瓣置換術綜述2007-11-01
12、馮曉東；張勇；王學斌；萬亞紅；賈寶成；肖明第；腋下直切口在體外循環心臟直視手術中的套用:附612例報告2009-07-20
13、萬亞紅；肖明第；張建卿；馮曉東；賈寶成；保留瓣下結構對二尖瓣置換術後左心功能的影響2007-11-01
