版塊劃分
萌百·屬性區
萌物百科屬性用戶組專享的福利♂集中營。
萌百·CP區
萌友CP、婚禮、果照自爆版塊。
萌百·綜合區
論壇最大的分區，包含各類ACG版塊，萌物百科字幕社作品發布專區亦設於此。
萌百·圖控區
圖包、壁紙、表情、頭像、畫師畫集、COS等各種高清動漫圖片的天下。
萌百·資源區
動畫、漫畫、輕小說、音樂、鈴聲、MAD、MV等各類高質量資源的海洋。
萌百·動漫區
此為交流版塊，隨新番開版，並同時設有長篇連載專區。萌百·文學區各類書籍分享、小說素材以及萌友原創漫文的發布地。
萌百·萌化區
囊括電腦、手機兩大平台，整理分享各種動漫主題、圖示、指針、皮膚、小工具等萌化資源，萌物百科萌化組作品亦在此發布。
萌百·自學區
下設Photoshop、視頻製作、繪圖交流和日語學習4大版塊，其中PS版塊以原創首發教程為主。
萌百·設計區
萌友勳章、頭銜、帖子背景、論壇背景、公簽設計投稿，以及美工組辦事處所在地，PS觸手出沒區。
萌百·外組區
獨立工作組入駐萌物百科的工作站。
萌百·站務區
論壇公告發布、操作教程以及各個工作組的辦公場所。
目標
為萌友們提供更多的優質原創作品、更豐富的資源分享、更舒適的交流環境，讓論壇一天比一天變的更加熱鬧，讓萌物百科成為所有動漫愛好者心中的二次元歸屬。
特色
字幕社
論壇字幕社由一群對日語、對動漫、對字幕製作感興趣的同學組成，雖然很辛苦，但是每季度都會為大家奉獻5~10部高質量的翻譯作品。
字幕社海報萌化組
萌化組是擅長PS、喜歡設計的同學自由發揮的舞台，作品包含系統主題、動漫圖示、滑鼠指針、萌化小工具以及各類軟體皮膚，其中以動態輸入法皮膚作品尤為受歡迎。
萌化組作品預覽圖外組
外組即入駐萌物百科，但非論壇自身的工作組。任何萌友只要註冊時間>3個月、主題數>20，均可申請，一旦申請成功後，論壇將完全不參與管理，給予最大的自由發揮空間，並提供勳章、版圖等一切和論壇自身小組完全一樣的待遇。同時外組也為論壇帶來了很多的原創作品，包括各種新番頭像、表情等等，還有一些原創的教程以及新聞資訊。
管理團隊
| 部分管理介紹 | ||
| ID | 管理的版塊和職務 | 介紹 |
| 萌百娘 | 創始人 | 負責制定論壇整體發展計畫，協調各分區版塊之間的關係，是論壇的總負責人。性格平易近人，處事穩重，考慮事情全面，會儘可能的站在萌友的角度上以大家的便利為出發點思考問題，同時也儘自己最大的努力去關心在萌物百科付出的管理以及組員。 |
| 陌上ぅ相思燼 | 超級版主 | 萌物百科現任超版，乃妹紙一枚，做事追求完美，認真負責，資源大戶，強迫症患者+神谷病晚期無救，喜歡腦洞大開，本命是兩儀式。雖然看起來嚴肅，實際上是個很軟， 喜歡調戲大家的偽娘控。 |
| 小時光 | 超級版主 | 萌物百科現任超版，機智的蘿莉少女，辦事認真負責，經常被人認為是炸毛蠢受，其實是很內向害羞的蘿莉，喜歡看耽♂美小說、聽音樂、喜歡黑洞【霧】，男神是銀時。 |
| 咖啡少年不加糖 | 萌百·文學區—分區版主 | 負責文學區，愛挖坑愛吐槽，loli控，擅長輕小說，偶爾會掉點節操，但實際是個人妻無誤。 |
| ___♣神秘佳賓° | 萌百·動漫區—分區版主 | 負責動漫區，野生櫻桃一隻，做事勤勤懇懇，認真負責。容易害羞，擅長打擊樂，是位很軟可調戲的萌妹子。 |
| 布卡木木 | 萌百·圖控區—分區版主 | 負責圖控區，是美圖資源帝，自截頭像做的都很漂亮。做事認真，並會非常熱心的幫助別人。從性格上來說：可攻可受可腹黑可呆萌，是一位熱心爽朗的少年。 |
| 竹內野司 | 萌百·文學區—分區版主 | 負責文學區，喜歡收集詭異小說，有典型的版面美觀強迫症。對寫小說情有獨鍾，據本人坦白：希望能做一位安靜的美男子←←（吐槽一下.明明是妹紙，這么說真的好嘛？） |
| 博麗夭夢 | 萌百·資源區—分區版主 | 負責資源區，善於挖掘新人，活躍氣氛，組織活動，同時又是個資源大戶，東方一生推，技能是在東方Project版塊刷版。 |
| 七月初華 | 美工組—組長 | 主要負責萌百勳章、版圖的上架和維護工作，為論壇的萌友提供漂亮的勳章、背景等，中二病晚期患者，腐女一枚，雖然披著妹紙的外表但其實內心是妥妥的漢子，在論壇盡其所能的付出自身的努力。 |
| 萌動 | 美工組—組長 | 主要負責萌百勳章、版圖的上架和維護工作，為論壇的萌友提供漂亮的勳章、背景等，和初華一起管理美工組，是一位非常盡責的組長。 |
| 赤司征十郎 | 動漫鈴聲—版主 | 負責動漫鈴聲版塊，曾經優秀的帶領過宣傳組，做事認真。無節操的賣萌星人一枚，性別♀，據本人坦白，自己是一個生活在萌物百科的小透明。 |
| 朝比奈日和 | 動漫遊戲新聞—版主 | 負責動漫遊戲新聞版塊，喜歡看動漫和聽歌，蘿莉控和抖M屬性。 |
| 羽翼之兔 | 資源組—組長 | 資源組的組長，一位來自寶島台灣的♀妹紙，做事認真負責，善於管理組員，同時也是個資源大戶。 |
| 尼特 | 動漫MAD/MV—版主 | 負責動漫MAD版塊，做事勤懇，認真負責。是個非常強大的資源大戶，同時也是位非常優秀的資源組組員。 |
| 舞月i | 百合花園、畫師畫集—版主 | 負責百合花園和畫師版塊，病嬌x傲嬌屬性，喜歡收圖秀恩愛，據說頭髮特長√，是只萌萌噠蘿莉。 |
| 〃夏時.Lock | 入萌留爪區—版主、迎新組—組長 | 負責入萌留爪區，略略無點節操&逗比，平時經常吐槽與被吐槽，自帶略多槽點的銀銀。 |
| 低調の麵包 | V家&初音—版主 | 負責V家版塊，同時也是資源組組員，在論壇內分享了很多高質量的動漫音樂資源，另外這個麵包具有食用性，可調戲√。 |
| 檸檬酸^ | 檸檬頭像外組—組長 | 檸檬頭像（外）組的組長，工作非常認真，善於管理組員。而且易摟，易抱，易推倒。自稱是御姐，實際上是個會賣萌又全能的小蘿莉。 |
| 繁華落盡、傾城 | 冰花表情外組—組長 | 冰花表情（外）組的組長，非常努力。很溫暖，很細心，是個勤勤懇懇的好騷年。 |
大事記
論壇自成立以來經歷了太多的風風雨雨，有了萌友們的陪伴和支持，才是我們堅持的力量，無論前方有多么艱難，相信我們一定會攜手跨過！謹記我們的目標，讓萌物百科成為所有動漫愛好者心中的二次元歸屬。
2013年大事記
2013-06-21
萌物百科動漫論壇成立
2014年大事記
2014-02-24
萌物百科字幕社正式成立
2014-06-21
萌物百科成立一周年，慶典活動成功舉辦。
2014-07-24
萌物百科資源索引計畫正式啟動
2014-09-20
向日葵日輕組正式入駐萌物百科
2014-09-26
檸檬頭像組正式入駐萌物百科
2014-10-02
冰花表情組正式入駐萌物百科
2014-11-29
某不科學のMMD組正式入駐萌物百科
2015年大事記
2015-03-09
萌物百科經歷了有史以來最嚴重的黑客攻擊，導致站點近乎關閉了3天。
2015-04-04
紫凜手辦部正式入駐萌物百科
