電影劇情
水龍捲沖天而起
阿爾宙斯迎擊隕石小智、小光和小剛與他們的神奇寶貝們來到了米季納。一行人在前往小鎮中的神殿的路上路過了一座湖泊。一條條水龍捲突然自湖中捲起，但一對兄妹希娜和克賓召喚出帝牙盧卡，後者平息了龍捲風。騎拉帝納這時出現，但希娜憑藉自己與神奇寶貝心靈相通的能力，平息了二者的爭端，將騎拉帝納送回了自己的維度。帕路奇犽隨後來到，將帝牙盧卡和希娜自另一突然出現的水龍捲中救出。希娜和克賓後將小智一行領到了神廟，並解釋說他們一直在調查時空的相互擾亂，並擔心創造出世界並使騎拉帝納、帝牙盧卡和帕路奇犽相遇的阿爾宙斯的即將到來的甦醒。
阿爾宙斯在米季納上空全力一擊希娜解釋說，數個世紀前，阿爾宙斯曾保護地球免受流星雨風暴的襲擊，並在其間失去了自己的十六個石板而奄奄一息，但被一個名叫達摩斯的人救起。心存感激的阿爾宙斯融合了自己的五個石板，融合成了生命寶玉，後者將原本荒蕪的米季納變成了富饒的土地。阿爾宙斯要求達摩斯歸還生命寶玉，但達莫斯背叛並偷襲了阿爾宙斯。阿爾宙斯負傷而被迫長眠，但許下“當我下一次醒來後將對人類進行制裁”的誓言。希娜稱達摩斯是自己的祖先，自己現在保管著真正的生命寶玉，並打算將其歸還以使人類躲過一劫。阿爾宙斯如期而至，希娜將自己保管的生命寶玉交還給了阿爾宙斯，但發現生命寶玉是贗品。震怒的阿爾宙斯被其創造的騎拉帝納、帝牙盧卡和帕路奇犽。希娜要求帝牙盧卡將小智、小光、小剛和希娜送回了達摩斯背叛阿爾宙斯的那一天，但帝牙盧卡將一行人送往了更早一些的時間，一行人被達摩斯的部下奇辛和他的席多藍恩逮捕。
即將被銀水吞沒的阿爾宙斯
石刻上的小智一行人小智一行、皮卡丘和圓企鵝被投入牢房，但後二者被鋸齒耳皮丘救出。一行人見到了同被奇辛——真正的背叛者，通過青銅鐘的催眠術使達摩斯成為自己的傀儡——囚禁的達摩斯。在對奇辛的真實面目一無所知的情況下，希娜告訴了奇辛未來發生的一切。皮卡丘、圓企鵝和鋸齒耳皮丘救出了小智一行和達摩斯。阿爾宙斯這時到來，以取回生命寶玉。手持奇辛的權杖，被騙的希娜成為了背叛阿爾宙斯的人。阿爾宙斯被銀水和電磁波攻擊，陷入了深井中。奇辛的意圖不言而喻：殺死阿爾宙斯以改變未來。希娜和達摩斯利用自己的能力解除了奇辛對發動攻擊的包括席多藍恩和青銅鐘在內的神奇寶貝們的控制。與此同時，小智自奇辛手中奪回了生命寶玉。
小智來到阿爾宙斯身旁，卻發現阿爾宙斯瀕臨死亡。未來的改變導致了小智一行人開始逐漸消逝。達摩斯藉助自己的力量來到了阿爾宙斯憤怒的心旁，懇求阿爾宙斯拯救未來。阿爾宙斯吸收了生命寶玉，恢復了自己和來自未來的人們的生命力，並將自己的救命恩人們帶出了即將坍塌的神廟。小智、小光、小剛和希娜回到了未來，但發現阿爾宙斯依舊憤怒，並已經擊垮了帝牙盧卡、帕路奇犽和騎拉帝納。由於歷史的改變，阿爾宙斯認出了小智，因而復原了自己所破壞的事物並治癒了帝牙盧卡、帕路奇犽和騎拉帝納。小智一行注意到，達摩斯為感謝他們拯救了世界，將他們刻在了壁畫上。意識到自己原來也是自己所創造的世界的一部分的阿爾宙斯，同其追隨者們回到了各自的維度。
我祝願著，希望你們的未來是個更好的地方演職員表
演員表
| 角色 | 演員 | 備註 |
| 松本梨香 | 小智 | 配音 Sarah Natochenny |
| 大谷育江 | 皮卡丘 | 配音 大谷育江 |
| 上田佑司 | 小剛 | 配音 Bill Rogers |
| 豐口惠美 | 小光 | 配音 Emily Jenness |
| 高島政宏 | 達摩斯 | 配音 Dan Green |
| 北乃紀伊 | 希娜 | 配音 Rebecca Soler |
| 美輪明宏 | 阿爾宙斯 | 配音 Tom Wayland |
| 中川翔子 | 鋸齒耳皮丘 | 配音 Kayzie Rogers |
職員表
| 製作人 | 伊藤憲二郎、久保雅一 |
| 監製 | 石原恆和 |
| 原著 | 田尻智 |
| 導演 | 湯山邦彥 |
| 編劇 | 園田英樹 |
| 配樂 | 宮崎慎二 |
| 視覺特效 | 太田憲之 |
角色介紹
| 小智 小智是以世界第一的神奇寶貝大師為目標持續旅行的少年，和皮卡丘是最佳搭檔。與小光、小剛一起來到米季納。 |  小智 |
| 小光 小光受到身為優秀的神奇寶貝訓練家的母親影響，以參加華麗大賽為目標而旅行，性格活潑。 |  小光 |
| 小剛 小剛曾是尼比市的道館訓練家。現以神奇寶貝飼育家為目標持續修行，跟小智一起旅行的同伴。 |  小剛 |
| 希娜 希娜是遺蹟的守護者，達摩斯的後代。她的家族成員代代守護著“生命寶玉”。能夠跟神奇寶貝心靈相通。 |  希娜 |
| 阿爾宙斯 阿爾宙斯被稱為創造世界的幻之神奇寶貝。曾為保護地球而擋下流星雨。後陷入長眠。 |  阿爾宙斯 |
電影音樂
| 類別 | 曲名 | 作詞 | 作曲 | 編曲 | 演唱 |
| 片頭曲 | 擊掌！2009 | 戶田昭吾 | たなかひろかず | 松本梨香&豐口惠 | |
| 片尾曲 | 心的天線（細野春臣版原曲） | 松本隆 | 細野春臣 | 中川翔子 | |
| 音軌 | 曲目譯名 | 曲目原名 | 藝術家 |
| 1 | 擊掌！2009（電影版） | ハイタッチ! 2009 (映畫サイズ) | 松本梨香、豊口めぐみ |
| 2 | 先鋒組曲1 | アバン組曲1 | 宮崎慎二 |
| 3 | 先鋒組曲2 | アバン組曲2 | 宮崎慎二 |
| 4 | 覺醒 | 覚醒 | 宮崎慎二 |
| 5 | 標題主題曲2009 | タイトルテーマ2009 | 宮崎慎二 |
| 6 | 旅行～心的天線～ | 旅～心のアンテナ～ | 宮崎慎二 |
| 7 | 大家在河邊遊玩 | みんなで川游び | 宮崎慎二 |
| 8 | 米季納的湖 | ミチーナの湖 | 宮崎慎二 |
| 9 | 帝牙盧卡 | ディアルガ | 宮崎慎二 |
| 10 | 騎拉帝納 | ギラティナ | 宮崎慎二 |
| 11 | 帕路奇犽 | パルキア | 宮崎慎二 |
| 12 | 傳說（光之繪） | 伝說 (ひかり絵) | 宮崎慎二 |
| 13 | 守護者希娜 | 守り人シーナ | 宮崎慎二 |
| 14 | 眾神的戰鬥 | 神々の戦い | 宮崎慎二 |
| 15 | 超越時空 | 時空を超えて | 宮崎慎二 |
| 16 | 日食之日 | 日蝕の日 | 宮崎慎二 |
| 17 | 阿爾宙斯的憤怒 | アルセウスの怒り | 宮崎慎二 |
| 18 | 刺刺耳皮丘加油！ | ギザみみピチューにつづけ! | 宮崎慎二 |
| 19 | 阿爾宙斯光臨 | アルセウス光臨 | 宮崎慎二 |
| 20 | 16個令牌 | 16のプレート | 宮崎慎二 |
| 21 | 生命之玉 | 命の寶玉 | 宮崎慎二 |
| 22 | 剛剛發芽的生命 | 芽吹いた命 | 宮崎慎二 |
| 23 | 刺刺耳皮丘的大功勞 | お手柄ギザみみピチュー | 宮崎慎二 |
| 24 | 小智對抗奇辛 | サトシVSギシン | 宮崎慎二 |
| 25 | 超克吧！時空的定律！ | 超克せよ!時空のさだめを! | 宮崎慎二 |
| 26 | 復活 | 復活 | 宮崎慎二 |
| 27 | 再見，未來的孩子們 | さらば未來の子供たち | 宮崎慎二 |
| 28 | 再生 | 再生 | 宮崎慎二 |
| 29 | 前往未來 | 未來へ | 宮崎慎二 |
| 30 | 心的天線（細野春臣版原曲） | 心のアンテナ(Haruomi Hosono Original Mix) | 中川翔子 |
電影製作
《阿爾宙斯 超克的時空》的導演湯山邦彥稱電影中的阿爾宙斯象徵著大自然，而生命寶玉象徵著太陽，電影的最終目的是讓人們關注自然世界對於所有生命的生存的重要性。
影片評價
動畫精湛 觀點無害
夕陽西下影片帶給人的全然的美感會讓即使眼力最好的神奇寶貝迷們都感到驚訝。被有著藝術美感的古老遺蹟和美麗的綠色遠景環繞，有著搖曳的玉米地、晶瑩剔透的河流的米季納是田園的聖地。相片般真實的電腦動畫賦予了鄉下美景以生命力，而與此同時隨意勾勒的背景則賦予了畫面寬度和美感。
米納季被復原時空的泡沫和一束束火焰的四處揮灑以塑造阿爾宙斯的形象。CG製作的水龍捲直衝天空，紫羅蘭色的空洞自現實世界張開；伴隨著無暇的塵土瓦礫的爆炸，神奇寶貝的技能將遺蹟夷為平地；歪斜著傾瀉的銀水瀑布被賦予了帶有紋理的CG表層；生命寶玉被賦予了深邃而富有變化的顏色；希娜的心靈溝通也被變幻的扭動、多彩的光環所點綴。《阿爾宙斯 超克的時空》是無害的，用人類的力量造福世界的觀點也是值得讚美的。單純從技術層面來說，它是迄今為止最好的一部神奇寶貝劇場版。與廉價的TV版相比，他們的差距可以用光年計。
故事老套
玉米地憑藉阿爾宙斯，神奇寶貝系列終於來到了神性的領域。這部電影並不黑暗。誠然，這部電影的構架是溫和的，然而是以不可接受的合作、和平以及包容的信息為內涵的。它是無害的、有娛樂性的，但確實是容易被忘記的。簡言之，自前一個世紀的暮色中，神奇寶貝劇場版就已經開始如此這般地量產。你可以對小智一行人不斷結識新的、正處於大麻煩中的朋友並憑藉勇敢、團隊合作和——通常來說——十萬伏特幫助他們走出困境的故事心懷期待。訴諸武力的能量的碰撞和場面富麗的破壞，沒有人會死，一切都會在電影結束時恢復原狀。一塵不染的道德高於一切，小智一行人會再次奔赴下個冒險。
兒童化的情節與成人化的內涵格格不入
這還不是最大的問題。電影的目標觀眾們不會為一個他們從神奇寶貝系列中期待已久的形象——阿爾宙斯——所困擾。他們只是會對比平時更多的唯美畫面感到高興。火箭隊扮演的悲劇的、被刪節的（無意義的）角色才是癥結。所有的空間穿梭、連續不斷的時空的混亂也是毫無意義的。對於年長和科幻導向的觀眾來說，這是稀鬆平常的、無知的；對於年幼的觀眾來說，這種場景會直接被他們忽視掉，更有甚者，還有可能讓他們被一些自己無法理解的觀念所衝擊。電影的情節中走走停停的、短暫的平和以及這一框架試圖賦予小觀眾們的、他們所不能理解的深刻內涵的構想是折磨人的。
發行信息
在公映的首個周末，《阿爾宙斯 超克的時空》在日本國內票房榜以$6,969,601的收入位列第二。 公映結束時，憑藉在日本國內$48,687,041的票房收入（2009年9月13日 ）和在韓國國內$1,919,874的票房收入（2010年2月7日 ）， 《阿爾宙斯 超克的時空》在全球票房達到$50,673,078， 在2011年日本國內票房榜上排名第7。
