電影劇情
故事背景設定在美麗的綠地鎮。小鎮的居民之一，神奇寶貝博士秀力正在進行變幻莫測的神奇寶貝未知圖騰的研究。他和他的助理髮現了一座以及，但秀力被吸入了異次元。他的消失使得女兒小美——她的母親在早先失蹤——感到孤獨。小美發現了一盒含有未知圖騰畫像的石板並開始擺弄，召喚出了未知圖騰。未知圖騰運用他們的能力使得小美的願望成真，把她的莊園變成了一個水晶宮殿，並不斷向外擴展，使得小美與世隔絕；還創造出了炎帝扮作小美的父親。包括大木博士和花子在內的許多人來到並試圖驅除未知圖騰們。
成年的小美與此同時，小智一行邂逅了小凌並與小凌結成朋友。他們來到了綠地鎮並在途中決定參與救援並救出小美。但是炎帝遵從小美想要媽媽的要求而綁架了小智的媽媽花子。為了救出小智的媽媽花子，小智、小霞、小剛還有他們的神奇寶貝在小凌給予的神奇寶貝裝置的幫助下，一邊向大木保持聯繫，一邊向著大宅進發。火箭隊嘗試著調查宅邸，被炎帝擊飛掉入了宅邸深處。小美在電視裡看到小智一行人並進入了夢鄉，想像著她成為了一名神奇寶貝訓練家。在電視中看到小智，花子不被炎帝注意到地從恍惚中擺脫了出來。隨後炎帝在夢境中製造了成年的小美並帶她同小智一行人對戰。她與小剛進行了第一場戰鬥，但她夢想的神奇寶貝們遠勝小剛；其後她又與小霞進行了水下友誼賽，但勝負未決。小智設法找到了小美和花子，但小美拒絕同他離開結晶塔。炎帝試圖阻止小智同花子離開，並同小智進行了對戰。緊接著，炎帝試圖將小智和皮卡丘打下懸崖，但二人被小智的噴火龍救起。噴火龍隨後背負小智同炎帝展開戰鬥，後被炎帝從空中擊落。炎帝近乎殺死了噴火龍，但小美命令前者助手並懇求其停止戰鬥。小智和他的朋友們說服小美同他們一道離開，炎帝隨即坦白，它是由未知圖騰製造出來扮演小美父親的。
家人重逢未知圖騰們突然失去控制，並試圖將一行人封鎖在宅邸里。小智、皮卡丘、噴火龍、小霞、小剛、花子、小美和火箭隊逃到了未知圖騰所在的大廳。皮卡丘和噴火龍嘗試著打破保護著未知圖騰們的力場，但最終失敗——後炎帝加入，在小美的幫助下齊心協力地擊破了護罩。炎帝自我犧牲，未知圖騰們隨即回到了異次元並這回了對於現實世界的所有影響，把秀力博士送回了最初他失蹤的遺蹟。
一行人冒險來到了外面，見到了大木博士和小凌等人。在片尾中，噴火龍和小凌離開了小智三人；小美得到了一隻熊寶寶並與父親重逢——其後，又與母親重逢。
演職員表
演員表
| 角色 | 演員 | 備註 |
| 松本梨香 | 小智 | 配音 Veronica Taylor |
| 大谷育江 | 皮卡丘 | 配音 大谷育江 |
| Masami Toyoshima | 花子 | 配音 Veronica Taylor |
| 飯冢雅弓 | 小霞 | 配音 Rachael Lillis |
| 上田祐司 | 小剛 | 配音 Eric Stuart |
| 林原惠 | 武藏 | 配音 Rachael Lillis |
| 三木真一郎 | 小次郎 | 配音 Eric Stuart |
| 犬山イヌコ | 喵喵 | 配音 Addie Blaustein |
| 矢島晶子 | 小美 | 配音 Amy Birnbaum |
| 加藤愛 | 小凌 | 配音 Lisa Ortiz |
| 石冢運升 | 大木博士 | 配音 Stan Hart |
| 竹中直人 | 秀力博士 | 配音 Dan Green |
| 竹中直人 | 炎帝 | 配音 Dan Green |
| 關智一 | 小建 | 配音 Ted Lewis |
職員表
•原案：田尻智
•腳本：首藤剛志、園田英樹
•分鏡：湯山邦彥、毛利和昭、辻初樹
•演出：日高政光、須藤典彥
•人物設定：一石小百合、松原徳弘、香川久
•作畫監督：香川久
•色彩設計：吉野記通、佐藤美由紀
•特效：太田憲之
•美術監督：金森勝義
•攝影影監督：白井久男
•音樂：宮崎慎二
•音響監督：三間雅文
•製作：國小館プロダクション
•監督：湯山邦彥
•製作：河井常吉、富山乾太郎、坂本健、宮川礦一、福田年秀、八木正男、ピカチュウプロジェクト2000
角色介紹
| 小智 主角，10歲。是個熱血、朝氣蓬勃，熱愛神奇寶貝的少年，性格熱血、衝動，在愛情方面反應遲鈍，不按常理出牌是他的一貫作風。以神奇寶貝大師為目標持續旅行的他，雖然技術還不是很成熟，不過也有逐漸在進步。 |  小智 |
| 皮卡丘 是小智作為神奇寶貝訓練家獲得的第一隻神奇寶貝。雖然警戒心很強，不輕易相信陌生人，但在總體上對神奇寶貝訓練家和神奇寶貝們十分友好。對小智十分忠誠。 |  皮卡丘 |
| 小霞 主要人物之一，年齡約10歲，自稱是世界級美少女、俏皮的美人魚、華藍美女四姐妹之一，現任華藍道館訓練家。最喜歡水系神奇寶貝，立志成為水系神奇寶貝大師。討厭蟲系神奇寶貝，但不討厭巴大蝴和芭瓢蟲之類的可愛型神奇寶貝。 |  小霞（右一） |
| 小美 主要人物之一，家住綠地鎮的小女孩。父母都是神奇寶貝研究者。父親失蹤後召喚出未知圖騰而引起混亂，後同小智一起撥亂反正。由於能夠影響未知圖騰的意志，她在冒險中起到了舉足輕重的作用。 |  小美 |
| 小剛 主要人物之一，原本是關都地區尼比道館的道館訓練家，後來為了成為神奇寶貝飼育家而和小智等人長期一起旅行。他的夢想是成為世界上最偉大的神奇寶貝飼育家。 | 小剛（左一） |
| 火箭隊（武藏、小次郎、喵喵） 以華麗姿態出場，擅長製造奇怪的機器的三人組。影片中，他們試圖偷窺大宅，但與炎帝遭遇，後被困於宅邸中。其間協助小智一行渡過難關。 |  火箭隊 |
| 大木博士 非常有威望的神奇寶貝研究專家，也是神奇寶貝圖鑑的主要製作者之一，大木年輕的時候也是個實力強大的訓練家，老了之後開始從事精靈研究。 |  大木博士 |
電影音樂
| 類別 | 曲名 | 作詞 | 作曲 | 演唱 |
| 片頭曲 | OK！2000 | 戸田昭吾 | 田中宏和 | 松本梨香 |
| 片尾曲 | 虹がうまれた日 | 戸田昭吾 | 田中宏和 | 松本梨香 |
| 音軌 | 曲目譯名 | 曲目原名 | 藝術家 |
| 1 | 號角聲 | ファンファーレ | 宮崎慎二 |
| 2 | 皮丘皮卡盪鞦韆 | ピチュピカ♪スウィング | 新★神奇 |
| 3 | 秘密基地的主題曲 | ひみつ基地のテーマ | 宮崎慎二 |
| 4 | 朋友紀念日 | ともだち記念日 | 酒井法子,竹中直人 |
| 5 | OK！2000 | OK!2000 | 松本梨香 |
| 6 | 未知圖騰的主題曲 | アンノーンのテーマ | 宮崎慎二 |
| 7 | 炎帝的主題曲 | エンテイのテーマ | 宮崎慎二 |
| 8 | 小美的主題曲～美麗的街市 | ミーのテーマ～美しき街 | 宮崎慎二 |
| 9 | 彩虹誕生的日子 | 虹がうまれた日 | 森公美子 |
| 10 | 皮丘皮卡盪鞦韆（原音效卡拉OK） | ピチュピカ♪スウィング （オリジナルカラオケ） | |
| 11 | 朋友紀念日（原音效卡拉OK） | ともだち記念日（オリジナルカラオケ） | |
| 12 | 彩虹誕生的日子（原音效卡拉OK） | 虹がうまれた日（オリジナルカラオケ） |
影片段預告絮
•影片中小智噴火龍的突然登場這一情節被嚴格保密，就連英文版製片人在第一次觀看電影時也感到驚訝。
•花子在看過新聞後，從冰櫃上揭下了一些照片，其中一幅是GB系列神奇寶貝的遊戲截圖。
•喬伊小姐和君莎小姐在影片中沒有說話的原因是她們的聲優Megan Hollingshead沒有參與該作的製作過程。
•肖恩·康納利拒絕了為秀麗博士（小美父親）配音的邀請。
影片評價
情節構思新穎
未知圖騰相比前作，《結晶塔的帝王》表現得與眾不同。顯然，對於覆蓋範圍更大的觀眾人群，製作團隊做出了比以往更好的應對——湯山邦彥雖沒有做出更大突破，但小的進步仍令人滿意。
小智新的冒險包括了冰之水晶和飛翔的、雙螺旋的外星符號未知圖騰——《結晶塔的帝王》的跨度令人耳目一新：宅邸內小智一行遭遇成人後的小美，並同其發生戰鬥，這部分劇情使得令人疲乏的節奏得以暫緩，而這種構思帶來的劇情的暫時停滯使得電影更加渾然一體；噴火龍的突然登場以及與之緊密相關的空中對戰將影片帶入高潮。
創作手段保守
結晶塔IMDb給出了5.2分的評分，而在中國的豆瓣網站得分為7.5分，在時光網得分為7.2分。觀眾們的投票結果指出了這樣的問題：日本的電影製作團隊走入了死胡同。這具體表現在神奇寶貝系列對不同神奇寶貝和冒險的探索在這裡達到了一個令人不可理喻的高度——難以理解的未知圖騰完全沒有先前神奇寶貝們擁有的的任何生物特徵；冰晶場地的設定儘管模仿了葛飾北齋的畫風（包括仙人掌般的中心場景的設定），但沒有營造出緊張的氛圍；噴火龍——一隻長期離隊的神奇寶貝突然決定同小智一道對抗小美——隨意的、突兀的登場也暴露出了團隊在創作方面的這一問題。
圓滿結局裡小美和父母團聚的美好情感被將其在擁擠不堪的片尾演職員表中穿插放映的錯誤決定而白白浪費。動畫在製作時並沒有展現高科技的的電影動畫手段——這本可以彌補未完全發展的故事情節，此外，配音和嘴部動作的一致性也有待加強。
播出發行
上映日期
| 國家和地區 | 上映日期 | 國家和地區 | 上映日期 |
| 日本 | 2000年7月8日 | 澳大利亞 | 2001年7月21日 |
| 美國 | 2001年4月6日 | 英國 | 2001年7月13日 |
| 加拿大 | 2001年4月6日 | 中國 | 2002年3月28日 |
票房收入
《結晶塔的帝王》在2000年7月8日在日本影院上映。2001年4月6日在美國上映時，首周在2,675家影院收益$8,240,752，位居第4。該作在票房上略遜於前作。在10周內，憑藉在全球範圍內獲得的$68,411,275的票房收益，《結晶塔的帝王》獲得了引人注目的收益。
歷年劇場
| 世代 | 劇場版 | 中文標題 | 首映日期 |
| 無印 | M01 | 超夢的逆襲 | 1998年7月18日 |
| M02 | 夢幻之神奇寶貝洛奇亞爆誕 | 1999年7月17日 | |
| M03 | 結晶塔的帝王 | 2000年7月8日 | |
| M04 | 雪拉比穿梭時空的相遇 | 2001年7月7日 | |
| M05 | 水都的守護神拉帝亞斯和拉帝歐斯 | 2002年7月13日 | |
| 超世代 | M06 | 七夜的許願星基拉祈 | 2003年7月19日 |
| M07 | 裂空的訪問者代歐奇希斯 | 2004年7月17日 | |
| M08 | 夢幻與波導的勇者路卡利歐 | 2005年7月16日 | |
| M09 | 神奇寶貝保育家與蒼海的王子瑪納霏 | 2006年7月15日 | |
| 鑽石&珍珠 | M10 | 決戰時空之塔帝牙盧卡VS帕路奇犽VS達克萊伊 | 2007年7月14日 |
| M11 | 騎拉帝納與冰空的花束潔咪 | 2008年7月19日 | |
| M12 | 阿爾宙斯超克的時空 | 2009年7月18日 | |
| M13 | 幻影的霸者索羅亞克 | 2010年7月10日 | |
| 超級願望 | M14 | 比克提尼與黑英雄捷克羅姆 | 2011年7月16日 |
| 比克提尼與白英雄雷希拉姆 | |||
| M15 | 酋雷姆VS聖劍士凱路迪歐 | 2012年7月14日 | |
| M16 | 神速的蓋諾賽克特超夢覺醒 | 2013年7月13日 | |
| XY | M17 | 破壞之繭與蒂安希 | 2014年7月19日 |
| Ⅰ由於內鏈原因，有關M17，請移步：神奇寶貝：破壞之繭與蒂安希 Ⅱ因百度百科漢語詞條名不得帶有空格，為添加內鏈，上述劇場版譯名均不帶空格。即上表中大部分劇場版標準譯名（除M01，M03和M17外）應加空格。 |
