雍正十二年（1734年），置寧海縣，治所在金州，隸奉天府尹。碧流河屬寧海縣。
道光二十三年（1843年），寧海縣升為金州廳。其轄區與寧海縣同。廳內設金州同知衙門（又稱民衙門）和金州協領衙門（又稱旗衙門），同轄一地，各管其民。同知衙門管區為“五社一島”，即堆金社、積金社、雨金社、南金社、旅安社和1個島區。五社的區域是：畢栗河（今碧流河）西岸至沙河（大沙河）東岸為堆金社；沙河西岸至石河驛為積金社；石河驛至西海（渤海）為雨金社；老黑山（今大黑山）東為南金社；治城（金州城）西南為旅安社（今旅順、大連）。社下設保，保下設甲。島區除包括今長海縣的大長山島、小長山島、廣鹿島、獐子島、海洋島等為其所屬島嶼外，尚含今新金縣的平島、馬牙島，金縣的黑島，計16島，島區治所在廣鹿島。碧流河屬堆金社。
1899年8月，沙俄把旅大租借改為關東州，按俄制，劃為4個市5個行政區。五行政區（行政區又稱“撫民府”或“民務所”。下設聯合村團（又稱鄉）、村團下設村會，村會下設村屯。）：金州行政區、貔子窩行政區、亮甲店行政區、島嶼行政區、旅順行政區。四市：大連特別市、旅順市、金州市、貔子窩市。碧流河鄉屬貔子窩市。
日本統治大連40年間碧流河屬貔子窩管區、金州民政署貔子窩民政署出張所、貔子窩民政署。
中華民國大連政區，金州廳改稱金縣（時為日“關東州”租借地）。因被日本侵占，未能行使主權。直至1945年8月日本投降，金縣方回歸祖國。
解放戰爭時期，1945年9月25日，分復縣東部與金縣北部地區新建新金縣民主政府。縣政府先後隸屬安東省、遼南行政公署、遼寧省和遼東省，直到1959年1月劃歸旅大市。碧流河屬新金縣城子疃區。
1948年3月，撤銷貔子窩、普蘭店、城子疃、夾心子4個行政區，新設碧流河、太平兩個行政區和貔子窩、普蘭店、城子疃3個鎮。
中華人民共和國成立後，1949年10月至1954年7月，新金縣隸屬遼東省；1954年8月隸屬遼寧省；1956年2月改隸遼陽專區；1959年1月劃歸旅大市；1966年6月，改歸遼南專區；1968年12月，隸屬旅大市。
1949年12月7日，經遼東省政府批准，將21個行政區、3個鎮，合併為17個行政區、1個鎮，原貔子窩、城子疃兩個鎮改為區，撤銷碧流河、鄭家窯、長山寺、騎河、墨盤、白山等6個行政區。
1991年末，新金縣（當年11月30日更名為普蘭店市）轄17個鎮、9個鄉（其中民族鄉1個）：皮口、城子坦、唐家房、雙塔、安波、瓦窩、元台子、蓮山、大劉家、楊樹房、大田、大譚、徐大屯、星台、沙包、四平、夾河廟鎮；太平、泡子、花子山、贊子河、碧流河、墨盤、樂甲（民族鄉）、同益、儉湯鄉。
經遼寧省政府1999年6月28日批覆同意，撤銷普蘭店市碧流河鄉，將其所轄區域併入城子坦鎮。
