民國15年,潘指行任嘉定縣教育局局長。民國17年在嘉定率先推行中心國小區制,全縣劃分11箇中心國小區,由中心校管轄學區內所屬國小,中心校在教學上起示範指導作用。未及2年,全縣教育行政管理與教育質量蔚然改觀,為全國不少地方所仿效,其基本形式延續至今。是年,為改變師資異地借材之窘,乃與崑山、青浦兩縣教育局長商定,於安亭藍塘村(今安亭師範地址)合辦昆嘉青三縣鄉村師範學校,培養三縣所需國小師資。
民國20年,主持江蘇省農民銀行總務處工作。是年秋,任嘉定分行經理。民國26年抗戰爆發,江蘇省農民銀行於上海租界設蘇南、蘇北兩辦事處,潘任蘇南辦事處主任。民國30年12月之後,以中華琺瑯廠董事長身份駐廠辦公,併兼任該廠附屬裕華公司經理。抗戰勝利後,潘指行任農民銀行南京分行經理。為不願由此陷入國民黨CC系,退回委任書,並辭去嘉定分行經理。民國36年,受任中央合作金庫嘉定分理處主任,被舉為嘉定商會理事長、嘉定復興委員會副主任和嘉定縣臨時參議會議員暨副議長。
潘指行熱心家鄉公益事業。抗戰後期,於嘉定城區籌設私立勤業初級中學,任董事長。在婁塘贊助籌設私立中光初級中學(今婁塘中學),任常務董事。抗戰勝利後,支持嘉定縣立中學復校,並將勤業中學與縣立簡易師範併入縣立中學。同時,繼續擔任私立普通國小、企雲國小(今匯龍中學)、高義國小(今疁西國小)和承德國小(今承德中學)等校董事長。解放後,潘指行本其熱心教育事業的初衷,每學期仍為普通國小、企雲國小、高義國小和中光中學等校籌措經費。還集資創辦承德中學、人民中學。民國35年,應留美醫學博士葛成慧之請,與顧吉生一起籌建普濟醫院(今嘉定中心醫院)。潘指行曾參與民國《嘉定縣續志》的編纂工作。
嘉定解放前夕,潘指行按中共地下黨的指示,籌集糧米2000石(1石約合78公斤,下同)。解放後又發動工商界獻糧2000石、麻袋3000隻、棉紗20件,送交縣人民政府支援前線。1950年,潘指行任縣工商業聯合會主任委員。同年11月,又任縣抗美援朝分會主任,於短期內發動工商界捐獻戰鬥機1架,認購勝利折實公債8萬份,獲蘇南人民行政公署表揚。
解放後,潘指行歷任嘉定縣各界人民代表會議駐會委員、副主席、蘇南行政區各界人民代表會議代表。1952年,參加中國民主建國會,為嘉定小組負責人。1954年起,被選為歷屆縣人民代表大會常委會副主任、縣政協副主席、江蘇省人民代表大會代表、省政協委員、全國和省工商聯委員。1956年起,任嘉定縣副縣長。1958年,病逝於上海。