梁子湖建站以來，承擔著生命科學學院植物學、動物學、生態學專業的碩士、博士研究生的培養工作，並作為武漢大學生物學博士後流動站的研究基地之一。已培養博士畢業生18名，碩士畢業生8名；其中3人晉升教授，9人晉升為副教授，9人做博士後研究；1人出國做訪問學者，在讀博士生4名，在讀碩士生7名，2010年新增研究生8名。
梁子湖生態站與中科院水生所東湖生態站在科研和研究生培養等方面長期合作。與中科院植物研究所、動物研究所、水生生物研究所、華南植物所、武漢植物所、昆明植物所、生態環境研究中心、北京大學、清華大學、北京師範大學、南京大學、浙江大學、南開大學、四川大學、東北林業大學、東北師範大學、華東師範大學等單位有密切的科研合作關係。與斯洛維尼亞開展了“水位變化對水生植物生長與分布格局的影響”國際合作項目，Olga教授和Alenca副教授在島進行為期一個月的合作研究；巴黎十一大校長、美國大自然保護協會、澳大利亞南威爾斯大學等專家也來島考察。
