內部設定淄川區衛生監測檢驗中心、淄川區健康教育所;免疫預防 科、傳染病防制科、地方病慢性病防制科、結核病防制科、愛滋病、皮膚病防制科、消毒媒介生物防制科、健康監測科、公共衛生檢測科、職業衛生與中毒控制科、衛生檢驗與質量管理科、健康教育科、生物製品科、辦公室、總務科、財務科共17個科室,承擔著全區疾病預防與控制、衛生檢驗監測、突發公共衛生事件應急處置、疫情報告及健康相關因素信息管理、健康危害因素監測與干預、實驗室檢測分析與評價、健康教育與健康促進、技術管理與套用研究指導工作任務。
淄博市淄川區疾病預防控制中心通過了省級計量認證,先後獲得全國健康教育工作先進集體、省疾病預防控制工作先進集體等省級以上榮譽六十餘項,被市政府記集體二等功七次。