江南大學無錫市生物計算工程技術研究中心

無錫市生物計算工程技術研究中心(簡稱“中心”)以江南大學理學院生物信息學研究方向為基礎,依託江南大學工業生物技術教育部重點實驗室,中國高校工業微生物資源平台,發酵技術國家工程中心和分子計算方面的研究團隊,由無錫市科技局於2012年6月批准建設。本中心是以數學建模和大數據處理為工具來進行生物大分子計算、結構模擬及生物信息處理,將數學、生命科學、計算科學等學科進行交叉運用,它的良好運行將起到示範作用。

中心聘請了在生物信息學研究領域的著名專家,中國科學院上海生命科學研究院研究員,中國科學院系統生物學重點實驗室執行主任,博士生導師陳洛南研究員和北京師範大學生命科學學院博士生導師林魁教授擔任顧問。中心現有3個研究方向,20餘名研發人員,其中高級職稱12名,博士研究生16名。目前辦公面積300平方米,實驗室面積500平方米,試驗檢測面積600餘平方米,試驗檢測設備價值達350餘萬元。近三年承擔國家、省部級項目20餘項,總經費700餘萬元,已在國內外著名刊物IEEE Transactions on Fuzzy Systems,Mathematics and Computers in Simulation,International Journal of Biomathematics,Applied Mathematics and Computation, Neurocomputing等SCI雜誌上發表論文40餘篇,其中單篇論文影響因子最高達5.484。

一、 研究方向

建立疾病控制與藥物療效系統分析平台

主要建立分子結構基礎上的基因調控作用的數學模型,利用生物組織分子內在的多層次關聯的數學模型來詮釋其蛋白質的結構,對多種觀測與實驗數據進行重構與分析,用以尋找和發現疾病基因的作用範圍和突變區域,引入功能基因組與重要性狀相關基因的研究;通過對基因組資料庫的建立和套用,開展分散式生物資料庫體系構建、實驗數據與分析相關分子生物學數據整合及系基因組資料庫系統技術研究建立多因素基因調控網路、表觀遺傳網路、信號轉導通路和生化代謝途徑的預測、分析、重構、建模技術和軟體開發。這將在化學水平上解釋遺傳因子在各種疾病,如癌症等一些嚴重危害人類健康的疾病中的作用。

建立環境生態治理與生態評價平台

主要在研究藍藻生物鐘的基礎上,瞄準國際生物鐘研究的前沿,期望促進生物鐘理論模型的基礎研究,在套用上可以為其他模式生物的生物鐘研究提供思路和有效經驗,建立和完善環境生態治理與生態評價平台。為太湖藍藻污染的治理提供理論依據和套用指導,逐步建立藍藻生物治理技術產業。

建立生物發酵過程控制平台

針對生物發酵過程的具體特點,對發酵過程的現場數據進行採集、處理及完成控制功能;並通過高速、可靠而開放的系統分析,實現與上層信息管理系統的實時連線;實現生物發酵過程的最佳化控制和安全操作,生成友好的人機界面;實時、安全、可靠地對生物發酵過程實行監督、控制和最佳化,逐步建立生物發酵過程控制平台。

二、 部分項目

《基於粒計算理論的生物網路結構建模、分析與算法研究》國家自然科學基金面上項目(編號:11371174),2014.1-2017.12,62萬,主持人:唐旭清,在研;

《地下水動力學模型分析和模擬與仿真試驗研究》科技部國際科技合作重點項目“地下大型空間建造與周邊環境監測和控制技術及裝備引進(編號:2011DFR70500)子課題,2012.1-2016.12,105萬,主持人:唐旭清,在研;

《p53抑癌基因分子調控機制的數學建模及其算法研究》國家自然科學基金面上項目(編號:11271163),2013.1-2016.12,68萬,主持人:朱平,在研;

《藍藻生物鐘的數學建模及模擬》國家自然科學基金青年項目(編號:10901073),2010.1-2012.12,17萬,主持人:胡滿峰,已結題;

《基因調控網路的數學建模理論、方法與套用》中央高校基本科研業務費專項(編號:JUSRP51317B),2013.1-2015.12,80萬,主持人:胡滿峰,在研;

《面向特殊蛋白信號肽序列的模糊智慧型新算法研究》國家自然科學基金青年項目(編號:61402202),2015.1-2017.12,25萬,主持人:高翠芳,在研;

《隨機動力系統的混沌同步研究》國家自然科學基金青年項目(編號:11202084),2013.1-2015.12,23萬,主持人:胡愛花,在研;

《CAD中混合擬Bézier曲線的整體幾何特徵分析及套用研究》國家自然科學基金青年項目(編號:61402201),2015.1-2017.12,26萬,主持人:沈莞薔,在研;

《CAD中擬Bernstein-Bézier三角曲面的理論及套用研究》江蘇省自然科學基金青年項目(編號:BK20130117),2013.7-2016.6,20萬,主持人:沈莞薔,在研;

《CAD中變次數B 樣條升階性質及套用研究》國家自然科學基金天元項目(編號:11326243),2014.1-2014.12,3萬,主持人:沈莞薔,已結題;

《幾類不適定問題的正則化理論及算法》江蘇省自然科學基金青年項目?(編號:BK20130118),2013.7-2016.6,20萬,主持人:程浩,在研;

《分數階擴散方程反向問題的正則化理論與算法研究》國家自然科學基金天元項目(編號:11426117),2015.1-2015.12,3萬,主持人:程浩,在研;

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