釋義
生物淨化是地表水自淨作用中最重要和最活躍的過程 。在江河、湖泊、水庫等各種自然的水體中，生活著大量的細菌、真菌、藻類、浮游生物、水生植物、各種魚貝類等生物和微生物，通過它們的代謝作用可以使水體中的有機污染物逐步被分解成CO、水、硝酸鹽等穩定、無害的物質，使原來的污染物濃度逐漸降低或消失。
水生生物的作用
促進有機質礦質化
在水中氧氣充足的條件下，好氣性細菌及其他微生物 ，通過其生命活動對有機質進行礦化分解，使複雜的有機物轉變為簡單的無機物質，減少了水中有機質的含量。水中異養性生物越多，其代謝水平越高，有機質被生物氧化的數量也越多，因而水的自淨過程也進行得越迅速。對礦質化起最大作用的是好氣性細菌和原生動物。所以豐富的氧氣是保證自淨過程能夠進行的前提，此外，水溫適當的升高和水的流動都能促進礦質化的過程。
生物沉澱和水的澄清
水中懸浮的污染物，在在很大程度上是通過生物作用使之沉澱水底的。這個生物沉澱過程主要糞塊的形式下沉水底，另一部分不能作食物的懸浮物黏結成假糞塊的形式，排出體外，沉入水底。有毒物質存於土壤後危險性就減少了，其中有些物質(短生活期的放射物質，不穩定的有機質)不會再轉回水中，在天然水體中通過甲殼動物、軟體動物、一些昆蟲幼蟲和其他一些動物的濾食和沉食，進行著大規模的水質澄清過程。此外，水生生物死後，許多毒物和污染物黏附在生物屍體上一同下沉水底，也是一個巨大的生物沉澱過程。
生物解毒作用
所有水生生物在某種程度上都能分解和消除有毒物質，通過把毒物作為食物或供氧體或與食物同時進入水生生物體內後失掉活性，從而降低了水中毒物的數量和濃度。
淨化過程
水體(尤其是流動的水體)有一個自然淨化的過程，污水流入水體後首先發生的是混合稀釋與固體物質的沉澱，沉澱在水底的有機物(污泥)發生消化而分解 。除了污染物的直接氧化(與水中的溶解氧化合)作用外，任何一個自然水體的淨化過程都要在水生生物的直接參與下才能完成，微生物把污染物作為營養源，通過氧化還原，分解、吸收等過程，將複雜的化合物轉化為簡單的化合物，最後產生無機物、水和二氧化碳。同時各類水生動物攝食較大的固體食物或其他生物，例如細菌、植物和其他動物。此外，在水體的自然淨化過程中，光合作用是不可忽略的，藻類和其他綠色植物在光合作用下，吸收二氧化碳產生氧，這個過程既補充了水體污染消耗的氧，而且去除過多的二氧化碳，達到清潔水體的作用。
影響因素
影響水體生物淨化作用的主要因素是水中的溶解氧含量，溫度和營養物質的碳氮比例 。水中溶解氧是維持水生生物生存和淨化能力的基本條件。因此，它是衡量水體自淨能力的主要指標。
