歷史影響
水陸寺在當地影響很大,曾多次“授戒”。最後一次“放戒”是在清宣統三年。水陸寺也舉辦了許多慈善事業,在其東南設定京江義冢,占地10多畝,為無地貧民提供葬身之地。每年發放棺木20具,給無錢殯葬的死者家屬。從當年冬至至次年清明,向當地施粥廠提供大米106石(一石為172市斤)。還邀請當地知名中醫為貧民治病,診金、藥費全由水陸寺結算。
損毀重建
1937年,抗日戰爭爆發。因揚州淪陷,私立揚州中學曾一度遷至水陸寺。1938年冬江蘇省保全第三旅教導大隊進駐該寺。1940年農曆九月初一,日寇經三垛向樊川進犯,連續炮擊水陸寺,寺廟精華部分盡毀。1942年春,偽軍強拆餘下建築,取木料修碉堡,一座千年古剎破壞得面目全非。1944年冬樊川鎮解放,道永大師主動將2株千年銀杏獻給新四軍榴彈廠,到1946年,水陸寺不復存在。
2004年,樊川古水陸寺重建工作啟動。目前初具規模,占地30畝,新建天王殿、西廊房、東廊房。大雄寶殿已列入建設計畫,水陸寺昔日規模有待重視。