解放初期,林建宇在福建人民革命大學學習結業後,任南平地委黨校政治指導員、生活隊長等職務。1953年4月調沙縣任縣委辦公室主任期間,在《福建日報》發表過數十篇文章,其中《八戶農民》入選於上海人民出版社出版的《毛主席住過的地方》一書。1956年調北京六O研究所工作,後轉山西大同六一六廠任團委常委、主任等職。所寫《工業戰線一雄師》被選入《全國先進民兵師彙編》,《打響晉南第一炮》發表于山西出版社出版的《紅旗飄飄》一書。1960年4月調至國防科技部門所屬的廣西桂林機械專科學校工作,先後任教務科副科長、教工黨支部書記、辦公室主任、政治部副主任等職,併兼教政治理論課。1980年8月該校易名為桂林電子工業學院(現桂林電子科技大學),林建宇任校黨委組織部負責人、學生工作處處長。1984年8月後任處級調研員。
林建宇自1956年之後都在國防科技部門工作,長達30餘年,為國防工業現代化建設作出貢獻,被中華人民共和國國防科工委授予“獻身國防科技事業”榮譽證書和榮譽證章。1984年6月,當醫院確診他患鼻咽癌時,仍堅持把84屆畢業生分配工作完成後才去住院治療。1989年3月離休後仍積極對學院工作提出意見和建議。1990年,他寫下親身經驗《征癌記》一文以供世人參考,《桂林日報》記者曾多次向他採訪,準備採用該稿,但不幸於1990年7月18日在他回鄉探親期間,溘然病逝於杉洋村,終年61歲。