1632年三月，曹文詔與變民軍大戰於西濠，斬首千級，生擒杜三、楊老柴。接著又擊斬紅軍友。變民首領可天飛、劉道江等包圍合水城，曹文詔前往救援。變民軍將精銳埋伏起來，以千騎挑戰，將明軍誘到南原，伏兵大起。城上人說曹將軍已經戰死。曹文詔持矛左右突擊，匹馬出入萬眾之中。守軍看見後，出兵夾擊，變民軍大敗。曹文詔在陝西大小數十戰，功勞最多，但洪承疇不幫他敘功。
變民軍見陝西明軍勢大，都流入山西。朝廷命令陝西、山西諸將都受曹文詔節制。他多次擊敗變民軍。1634年7月，清兵西侵，攻圍懷仁縣及井坪堡、應州。曹文詔駐紮在懷仁固守。八月，圍解，曹文詔移駐鎮城，出戰失利。不久清兵撤走。十一月，曹文詔被論罪充軍邊衛，山西巡撫吳甡知道曹文詔知兵善戰，推薦他為援剿總兵官，立功自贖。當時，河南變民勢大，朝廷命令曹文詔前往征討。吳甡上書請求讓曹先平山西，後入河南，朝廷不批准。曹文詔因為吳甡對自己有恩，竟取道太原，為吳甡所留。曹文詔整兵南行，1635年3月，於信陽與總督洪承疇相會。洪承疇大喜，令他出戰，他於隨州破敵，斬首380餘級。四月，洪承疇因為變民軍盡數退入關中，於是命令曹文詔入關，然後由閿鄉取山路至雒南、商州，直搗變民軍根據地，再從山陽、鎮安、洵陽入漢中。5月5日，曹文詔抵達商州。變民軍離城三十里安營，營火滿山。曹文詔率其侄參將曹變蛟等夜襲，獲勝，直追至金嶺川。變民軍據險以千騎迎戰，曹變蛟大呼陷陣，變民軍敗走。曹變蛟勇冠三軍，變民軍聽到大小曹將軍的名字，無不驚懼。
李自成率眾二十萬進攻鳳翔。曹文詔向洪承疇請求出戰，獲準後率三千人自寧州進軍。途中遇敵，曹變蛟先登陷陣，斬首五百，追擊三十里，曹文詔率步兵緊隨。李自成軍的伏兵數萬騎合圍，箭如雨下。本來變民軍並不知道圍困的是曹文詔，但他部下小卒被擒，大呼：“將軍救我！”變民軍中有人認出了他，說：“這是曹總兵。”於是圍困更緊。曹文詔左右衝突，手殺數十人，轉斗數里。最後力盡，拔刀自刎。洪承疇聽到訊息後大哭，崇禎帝朱由檢也很悲傷，下令建祠祭祀。曹文詔忠勇冠於當時，他死後，變民軍都互相慶賀。
其弟文耀，從兄征討，數有功。河曲之戰，斬獲多。後擊賊忻州，戰死城下。詔予贈恤。從子變蛟，自有傳。
