教育及工作情況
1993年-1997年,內蒙古大學,物理系,套用物理專業,本科;
1997年-2000年,內蒙古大學,物理系,生物物理專業,碩士,導師羅遼復教授;
2000年-2003年,北京工業大學,生命科學與生物工程學院,計算分子生物學與生物信息學,博士,導師王存新教授;
2003年-至今,北京工業大學,生命科學與生物工程學院,從事教學科研工作;
2012年8-9月,Yang Zhang Lab,Department of Computational Medicine & Bioinformatics , The University of Michigan, 短期訪問。
2015年4月-2016年5月,Yang Zhang Lab,Department of Computational Medicine & Bioinformatics , The University of Michigan, 訪問學者
主要研究領域
計算分子生物學與生物信息學,具體方向:
u蛋白質-蛋白質/DNA/RNA相互作用與識別;
u蛋白質功能性變構;
u分子設計。
科研項目
u基於多尺度分子動力學模擬和網路模型的ABC轉運蛋白變構機制的研究,國家自然科學基金(11474013)
u基於RNA分子柔性分析的蛋白質-RNA分子對接方法研究,國家自然科學基金(31171267)
u蛋白質功能位點預測方法的研究,國家自然科學基金(20773006);
u蛋白質與蛋白質相互作用及對接方法研究,國家自然科學基金(30400087);
u蛋白質-RNA特異性識別預測及在抗HIV環肽研究中的套用,北京市自然科學基金(4152011)
u基於蛋白拓撲結構及動力學信息的結合位點預測方法研究,北京市自然科學基金(4102006);
u北京市科技新星計畫項目;
u北京市優秀人才培養項目;
u北京工業大學京華人才項目.
獲獎情況
u2013年指導本科生獲得校畢設特優獎;
u2012年指導碩士生獲得校優秀碩士學位論文獎;
u2010年被評為北京工業大學第九屆“十佳青年”;
u2008年作為指導教師,帶領團隊在IBM杯並行計算大賽中獲得第一名;
u2007年獲北京工業大學優秀學術成果三等獎;
u2006年博士畢業論文被評為“全國百篇優秀博士學位論文提名獎”。
發表論文情況
[1] X. L. Xie, C. H. Li*, Y. X. Yang, L. Jin, J. J. Tan, X. Y. Zhang, J. G. Su, C. X. Wang. Allosteric transitions of ATP-binding cassette transporter MsbA studied by the adaptive anisotropic network model. Proteins 2015 doi: 10.1002/prot.24850
[2] C. H. Li*, L. B. Cao, J. G. Su, Y. X. Yang, C. X. Wang*. A new residue-nucleotide propensity potential with the structural information considered for discriminating protein-RNA docking decoys. Proteins 2012;80(1):14-24.
[3] X. Q. Gong, P. W. Wang, F. Yang, S. Chang, B. Liu, H. Q. He, L. B. Cao, X. J. Xu, C. H. Li*, W. Z. Chen, C. X. Wang*. Protein-protein docking with binding site patch prediction and network-based terms enhanced combinatorial scoring. Proteins 2010;78(15):3150-3155.
[4] C. H. Li, Y. X. Yang, J. G. Su, B. Liu, J. J. Tan, X. Y. Zhang*, C. X. Wang*. Allosteric transitions of the maltose transporter studied by an elastic network model. Biopolymers 2014;101(7):758-768.
[5] C. H. Li*, Z. C. Zuo, J. G. Su, X. J. Xu, C. X. Wang*. The interactions and recognition of cyclic peptide mimetics of Tat with HIV-1 TAR RNA: a molecular dynamics simulation study. J. Biomolcular Structure & Dynamics 2013;31(3):276-287.
[6] H. G. C. Zhang, C. H. Li*, F. Yang, J. G. Su, J. J. Tan, X. Y. Zhang, C. X. Wang*. Cation-pi interactions at non-redundant protein-RNA interfaces. Biochemistry (Moscow) 2014;79(7):643-652.