司法鑑定中心
昆明法醫院司法鑑定中心秉承以醫助法的理念，憑藉全面的檢測手段（包括CT、X片、B超、神經電生理等）以及各醫療科室專家的配合（包括外科、眼科、放射科、口腔科等），能夠在最短的時間內為傷者及辦案部門提供最快捷、優質的鑑定服務。
法醫臨床室
：主要進行活體損傷的傷情鑑定、傷殘鑑定、後期醫療費評估鑑定、勞動能力喪失程度鑑定、誤工損失日評定、三期評定、護理依賴鑑定等：包括交通損傷的鑑定，家庭暴力受傷害者損傷的鑑定，工傷、意外、故意傷害等損傷的鑑定；還可進行保險賠償的傷殘鑑定及醫療糾紛鑑定；
附：昆明法醫院各項法醫臨床鑑定的司法解釋及維權意義：法醫臨床司法鑑定:是指運用法醫臨床學的理論和技術，結合法醫學的理論和技術，對涉及與法律有關的醫學問題進行鑒 定和評定。主要內容包括:
人身損傷程度鑑定（傷情鑑定）：是指鑑定人對因故意傷害或意外傷害致人機體損傷及損傷引起的併發症和後遺症，全面分析，並依據有關標準，評定其損傷的嚴重程度。根據損傷的嚴重程度分為重傷、輕傷和輕微傷。維權意義：損傷程度鑑定直接關係到定罪與量刑，民事賠償和治安行政處罰。
道路交通事故受傷人員傷殘程度評定（傷殘鑑定）：在道路交通事故中遭受各種暴力致傷的人員，醫療終結後，評定人根據檢驗結果，按照《道路交通事故受傷人員傷殘評定》標準，運用專門知識進行分析，綜合判斷後得到的傷殘級別。維權意義：傷殘鑑定是對受檢人殘疾等級（一至十級）的鑑定，是傷者追索殘疾賠償金的依據。
人身損害受傷人員傷殘程度評定（傷殘鑑定）：是指對遭受各種人為暴力致傷或意外致傷的人員，醫療終結後，評定人根據檢驗結果，按照雲南省高級人民法院《人身損害致殘程度鑑定標準》，運用專門知識進行分析，綜合判斷後得到的傷殘級別。維權意義：傷殘鑑定是對受檢人殘疾等級（一至十級）的鑑定，是傷者追索殘疾賠償金的依據。
職工工傷與職業病致殘程度評定（傷殘鑑定）：是指在職業活動中因公負傷或患職業病後的勞動者，醫療終結後，評定人根據檢驗結果，按照《勞動能力鑑定——職工工傷與職業病致殘等級》之規定，運用專門知識進行分析，綜合判斷後得到的傷殘級別。維權意義：傷殘鑑定是對受檢人殘疾等級（一至十級）的鑑定，是傷者追索殘疾賠償金的依據。
護理依賴鑑定：是指對各種損傷致殘者在診療期間及診療後因生活不能自理需依賴他人護理的，根據相關標準對護理依賴級別、人員數量及時間進行評定。維權意義：護理依賴鑑定是對受檢人護理級別（一至三級）、人員數量及時間的鑑定，是傷者追索護理人員相關費用的依據。
勞動能力鑑定 ：是指對各種損傷致殘者，按照《勞動能力鑑定——職工工傷與職業病致殘等級》之規定，對其勞動功能障礙程度和生活自理障礙程度等級的鑑定。維權意義：勞動能力鑑定結果分為完全喪失勞動能力、大部分喪失勞動能力、部分喪失勞動能力，是對傷者受傷致殘後喪失勞動能力給予補償的依據。
後期治療費評估：是指對傷者臨床治癒後必要的後期治療費用以及對殘疾者必要的傷殘用具等費用作出評估。維權意義：後期治療費評估鑑定是傷者追討鑑定以後因繼續治療而產生的必要的後續治療費用的依據。
誤工損失日評定：是指人體損傷後經過診斷、治療達到臨床醫學一般原則所承認的治癒（即臨床症狀和體徵消失）或體徵固定所需要的時間的評定。維權意義：誤工損失日評定是傷者追討誤工費用的依據，根據此鑑定結果即可計算出受檢人損傷後產生的誤工費。
休息期、營養期、護理期評定（三期評定）：是指人體損傷後受傷人員所需休息、營養、和護理時間，分別稱為休息期、營養期、護理期。休息期（亦稱誤工期、醫療休息期），是指人體損傷後，接受醫療及功能康復，不能參加一般工作、學習、活動的時間；營養期（亦稱營養補償期），是指人體損傷後，需要補充必需的營養物質，以提高治療質量或者加速損傷康復的時間；護理期（亦稱護理陪護期），是指人體損傷後，在醫療或者功能康復期間生活不能自理，需要他人幫助的時間。與誤工損失日評定不同的是本鑑定還對營養期、護理期進行評定。維權意義：三期評定是傷者追討受傷後產生的誤工費、營養費、護理費的依據。
醫療糾紛司法鑑定：對醫療機構及其醫務人員在醫療活動中是否存在醫療過錯（過失）行為，此過錯（過失）與被鑑定人人身損害後果之間有無因果關係進行鑑定。維權意義：在醫療糾紛的維權過程中，此項鑑定是除醫療事故鑑定以外法院判斷醫方是否有過錯，過錯與損害後果是否存在因果關係的主要依據。
法醫病理室
：由昆明資深法醫病理學教授趙以誠帶領一批來自中山大學醫學院、西安交大醫學院、昆明醫學院畢業的國家司法鑑定人成立，病理實驗室擁有進口山頓系列病理試驗設備，包括脫水機、包埋機、切片機、染色機等，為各種因醫療糾紛死亡或不明原因猝死的屍體進行法醫病理學鑑定；
法醫毒化
：如血液中乙醇含量測定（酒精測試）及其它毒物檢測。
親子鑑定中心
採用美國ABI生產的遺傳檢測儀進行親子鑑定，包括父系鑑定、母系鑑定、胎兒鑑定（小孩出生前親子鑑定）、性別鑑定、家庭親緣鑑定、動物親緣鑑定；可以對精斑、血痕、唾液、毛髮、組織切片等進行個體識別：能夠進行無名屍的基因檔案建立及永久保存。
監測治療中心
針對被司法機關監管在押人員、被管制人員所實施的一項專門的檢測及治療，設有特殊的病房，24小時設有專職保衛及監護，為辦案機關減輕看守壓力，提供優良的執法環境。
創傷急救中心
針對各種原因造成的損傷進行急救及治療，配合司法鑑定中心取得第一手病情資料，快速對其損傷進行傷情傷殘鑑定，為傷者進一步實施的司法活動提供強有力的證據。
昆明法醫院司法鑑定中心檢查機構及實驗室於2009年10月26日獲得中國合格評定國家認可委員會（CNAS）頒發的認可證書。
