信訪室: 負責辦理黨員、民眾來信、來訪和舉報事項；受理涉及黨風黨紀和政風政紀問題的檢舉、控告和申訴，並檢查督辦信訪舉報案件；調查了解、協調和解決民眾信訪舉報中反映的突出問題，搞好信訪舉報情況分析及信訪統計，綜合反映帶普遍性和傾向性的信訪舉報信息。
案件審理室:負責違紀案件的審理和申訴案件的複審覆核工作；對備案案件審理和重要疑難案件的諮詢工作；承擔旗監察局在行政訴訟中的應訴事宜。
檢查室：負責對各鄉鎮蘇木，旗直機關黨員幹部違法違紀案件和重要複雜案件的查處工作；綜合分析旗紀檢監察機關辦案情況；對主要案件進行跟蹤、督辦、檢查和反饋。
執法監察室：負責監督檢查各鄉鎮蘇木、各部門貫徹執行黨的路線、方針、政策和國家法律、法規、決定、命令的情況；組織開展全旗性或重要的執法監察活動，對發現的違法違紀典型案件進行查處；參與對嚴重官僚主義、失職瀆職行為造成的重大經濟損失和人身傷亡事故的查處。
宣傳教育室：負責宣傳黨的紀律檢查、行政監察工作的方針、政策，聯繫協調新聞單位對紀律檢查、監察工作情況和重大案件的宣傳報導；配合有關部門重點抓好黨風黨紀、政風政紀教育；制定紀檢、監察幹部培訓規劃並組織實施；對全旗紀檢監察機關的宣傳教育工作進行業務指導。
黨風廉政建設室（糾風辦）：負責監督檢查、綜合分析全旗黨風廉政建設情況；組織全旗性或重要專題的黨風廉政建設檢查活動；指導各鄉鎮蘇木及各部門、各行業的黨風廉政建設工作，協助抓好領導幹部廉潔自律各項工作的落實；負責黨風廉政監督員聯絡協調工作。組織協調糾風專項治理；督促指導各鄉鎮蘇木和旗直單位重點部門的糾風工作和行風建設，負責特邀監察員聯絡協調工作。負責全旗經濟環境治理工作，對全旗破壞經濟環境案件進行查處，負責“樹創”工作。
效能監察室：負責督促檢查各鄉鎮蘇木黨委、政府及旗直各部門執行旗委、政府各項指示、政令情況，確保政令暢通；調查糾正黨政機關在管理活動中存在的官僚主義和失職瀆職行為，提高機關工作效能； 督促檢查我旗發展經濟、最佳化環境政策、措施和規定的落實情況；利用輿論監督作用，快速處理民眾對機關行政效能和影響經濟發展環境的投訴。
派駐紀檢組：監督檢查駐在部門及所屬系統執行黨的路線、方針、政策和決議，遵守國家法律、法規和執行國務院決定、命令的情況；貫徹落實旗委、旗政府的決定和命令的情況；上級紀檢監察機關加強黨的紀律檢查工作和行政監察工作的指示、決定及重要部署情況。監督檢查駐在部門黨組織和行政領導班子及其成員維護黨的政治紀律，貫徹執行民主集中制，選拔任用領導幹部，貫徹落實黨風廉政建設責任制和廉政勤政的情況。受理對駐在部門及管轄範圍內的黨組織、黨員和行政監察對象的控告、檢舉；受理駐在部門黨員和行政監察對象不服處分的申訴。經批准初步核實駐在部門黨組織和行政領導班子及其成員違反黨紀政紀的問題；參與調查駐在部門黨組織和行政領導班子及其成員違反黨紀政紀的案件；調查駐在部門股級幹部及其以下幹部違反黨紀政紀的案件及其它重要案件。協助駐在部門黨組織和行政領導班子組織協調駐在部門及所屬系統的黨風廉政建設和反腐敗工作。承辦旗紀委監察局交辦的有關事項。
