循環閾值

循環閾值（Cycle threshold，Ct值）的含義為：每個反應管內的螢光信號到達設定閾值時所經歷的循環數。 循環閾值是實時螢光定量多聚核苷酸鏈式反應（Real-time Quantitative polymerase chain reaction）中的一個重要參數，由它可以繪製出標準曲線，進而檢測待測樣品中模板的起始拷貝數。

螢光閾值（threshold）的設定

PCR反應的前15個循環的螢光信號作為螢光本底信號，螢光閾值的（默認）設定是3-15個循環的螢光信號的標準偏差的10倍，即：threshold = 10*SDcycle 3-15

Ct值與起始模板的關係

每個模板的Ct值與該模板的起始拷貝數的對數存線上性關係，公式如下。

Ct=-1/lg(1+Ex)*lgX0+lgN/lg(1+Ex)

n為擴增反應的循環次數，X0為初始模板量，Ex為擴增效率，N為螢光擴增信號達到閾值強度時擴增產物的量。

起始拷貝數越多，Ct值越小。利用已知起始拷貝數的標準品可作出標準曲線，其中橫坐標代表起始拷貝數的對數，縱坐標代Ct值。因此，只要獲得未知樣品的Ct值，即可從標準曲線上計算出該樣品的起始拷貝數。