復旦大學上海市高校智庫宗教與中國國家安全研究中心成立於2013年9月，是上海市教委決定在全市高校中建立具有全國乃至具有國際影響的首批在建智庫之一。
本中心的定位是：立足上海，面向全國，輻射國際的實體性、跨學科、流動式、專業型、國際化的對策研究、學術研究和人才培訓智庫。中心的主要研究內容將包括以下四大板塊：（1）宗教與中國國家安全研究；（2）宗教與當前中外關係和中國對外戰略；（3）宗教與中國社會安全和國家建設；（4）當前國內外各種宗教運動和現象。為開展這些研究，本中心下設四個研究中心（或項目），分別為：宗教與國際關係研究中心、美國宗教研究中心、宗教與中國社會和國家建設研究中心、梵蒂岡暨中梵關係研究中心。
本中心的現有成果包括：“宗教與中國國家安全：挑戰、趨勢與對策”專報系列、《宗教與國家安全研究通訊》、《宗教與中國國家安全資料彙編》，以及宗教與中國國家安全研究出版系列[包括四套叢刊：即《宗教與美國社會》（CSSCI來源集刊）、《基督教學術》（CSSCI來源集刊）、《宗教與當代國際關係論叢》、《宗教與中國國家安全和對外戰略》]等。
