少年時期在登高讀完初小,即在家務農。民國32年(1943)到建寧縣簡易師範學校讀書,於民國36年畢業後分配到邵武金石中心國小任教。1949年12月,經組織調配到邵武縣人民政府小教訓練班學習,後在邵武縣人民政府財政科工作。1951年至1970年,先後在建陽專署人民監察處、計畫統計科、支前辦公室、中共南平地委農村工作部工作。1956年4月加入中國共產黨。1970年至1975年在中共邵武縣委辦公室工作並任主任,1975年11月調任建陽地區農機管理局局長、農業局局長等職。1980年12月,邵武縣第八屆人民代表大會第一次會議上,徐祺當選人民政府縣長。1984年1月,邵武市第八屆人民代表大會第四次會議上,徐祺當選為市人大常委會主任。同年11月,邵武市第九屆人民代表大會第一次會議上,徐祺又當選為人大常委會主任。