線路歷史
上世紀90年代，45路開通投入運營（金尚車站←→廈大站）。
2007年02月15日起，金尚路主幹道將於實行禁直行、左轉措施。
2007年05月26日起，呂嶺路原“線務局曙光門診站”更名為“ 線務局站”。同時，蓮花南路原“幼稚園站”更名為“蓮花幼稚園站”；蓮花南路原“農行大廈站”更名為“蓮花南路站”；湖濱南路原“蓮坂國貿站”更名為“蓮坂站”；湖濱南路原“綠泉站”更名為“湖東路東站”；湖濱南路原“湖東綠泉站”更名為“湖東路西站”；湖濱南路原“電子城站”更名為“濱南長途汽車站”；湖濱南路原“湖濱長途汽車站”更名為“濱南斗西路口站”；湖濱南路原“建行站”更名為“角濱路口站”；湖濱西路原“太平洋保險站”更名為“思北路口站”；思明南路原“博物館希爾福站”更名為“博物館站”。
廈門45路2007年10月08日起，45路（金尚車站←→廈大站）取消在縣黃路與呂嶺路交叉口掉頭，並調整下行部分線路走向。
1、線路走向：上行:保持不變。下行:廈大始發，行至呂嶺路龍山中路路口，改經龍山中路、誼愛路、金尚路、金盛路、金泰路接原線路運行。
2、沿途站點：上行:金尚車站→後坑→南洋學院→忠侖→公路征費中心→泰和花園→蓮花三村→蓮花二村→蓮花中學→蓮花幼稚園→蓮花南路→新華書店→蓮坂國貿→湖東路西→新村→閩南大廈→中山醫院→非礦→濱南長途車站→濱南斗西路口→角濱路口→思北路口→中山路→鎮海路→大生理→博物館→理工學院→廈大。下行:廈大→博物館→大生理→鎮海路→中山路→思北路口→角濱路口→濱南斗西路口→濱南長途車站→非礦→中山醫院→新村→湖東路西→蓮坂→新華書店→蓮花南路→蓮花幼稚園→蓮花中學→蓮花二村→蓮花三村→泰和花園→ 龍昌里→龍盛里→誼愛路→中孚花園→南洋學院→金尚小區→金尚車站。
3、增減停站點：增停:龍昌里站（下行）、龍盛里站（下行）、誼愛路站（下行）。減停:公路征費中心站（下行）、線務局站（下行）。
4、首末班時間：金尚車站首班06:15末班22:10，廈大首班06:15末班22:16。
2008年01月01日起，45路公交線路隨之進行調整。45路“廈大至金尚小區”上行增加站點為線務局、忠侖、上店。減少站點為龍昌里、龍盛里、誼愛路、中孚花園。下行增加站點為南洋學院（新）、忠侖、線務局曙光門診，減少站點為金尚小區、中孚花園、北大生物園、誼愛路、龍盛里、龍昌里。
2008年11月28日，蓮花南、北路由南往北方向恢復原線路運行，由北往南方向，行經呂嶺路蓮花北路口，改為直行呂嶺路，後左轉經嘉蓮路（台灣街路口至蓮花二村路段）、蓮花北路、蓮花南路銜接原線路運行。
2010年05月05日起，施工期間，原廈大一條街（南普陀西大門-廈大南校門路段）雙向封閉，禁止車輛通行。往廈大方向，行至思明南路演武路口後右轉演武路，經臨時通道至思明南路南側的南普陀站（終點）上下客，後經思明南路接原線路返回。
2010年11月19日起，因思明南路（壽山路—成功大道）路面工程改造施工，施工期間思明南路該路段改為單向通行，45路公交線路需改道繞行，具體如下：
第一階段：2010年11月23日至12月21日，東側施工道路封閉。
調整方案：線路由廈大往鎮海路方向行至思明南路成功大道路口，改為左轉成功大道，經民族路、鎮海路接原線路運行。返程運行不變。單向減停：大生里站；單向增停：婦幼保健院站和外貿宿舍站。
第二階段：2010年12月22日至2011年01月20日，西側施工道路封閉。
調整方案：線路由鎮海路往廈大方向行至思明南路壽山路口，改為右轉壽山路，經民族路、成功大道、思明南路接原線路運行。返程運行不變。單向減停：大生里、博物館站；單向增停：外貿宿舍站。
2011年05月04日起，因思明南路（成功大道—演武路）路面工程改造施工，施工期間思明南路該路段改為單向通行，第一階段封東側開始施工道路封閉。45路由廈大始發，改經演武路、民族路、成功大道、思明南路接原線路運行，減停：博物館站，增停：廈大西村、中華兒女美術館和冷凍廠站。返程運行不變。
思明南路（成功大道—演武路）路面工程改造施工，第一階段封閉施工至2011年06月05日結束，為保障高考考生的交通出行，6日至8日思明南路恢復雙向通行，9日起實施第二階段封閉施工：
第二階段：2011年06月09日至07月08日，西側施工道路封閉。
45路線路：往廈大方向行至思明南路成功大道路口，改經成功大道、民族路、演武路接原線路運行，增停：冷凍廠、中華兒女美術館和廈大西村站，減停：理工學院站。返程運行不變。
2011年第三屆海峽論壇2011年06月11日在我市開幕，為做好會議期間（6月10日至18日）的公交服務工作。中山路和原廈門工人文化宮前廣場將舉行“台灣特色廟會”活動，活動時間：2011年06月10日至16日，每日11：00～23：00。中山路周邊線路，尤其是途經“新華路口站”、“中山路站”和“思東站”的公交線路，需加密運營班次，並延長45路公交線路的末班服務時間：在廈大站的末班發車時間延長至22：50。
2011年11月25日起，廈大公交首末站正式啟用後，45路線路調整方案如下：往廈大方向調頭停靠廈大（南普陀）站後接原線路返回。增停：廈大（南普陀）站；減停：廈大站。
2011年12月23日起，金泰路原“南洋學院站”更名為“金尚中學站”。
2012年07月23日起，思明南路中華城段（往思北方向）恢復公交站點“中華城”站，調整45路線路停靠該站。對向的思明南路“中山路”站（定安廣場前）同時更名為“中華城”站。同期，因站點原因，45路調整至廈大站始發，減停廈大（南普陀）站。
2013年11月19日起，湖濱南路蓮坂外圖書城（北）站：原站點基礎上往西邊（輪渡方向）遷移200米停靠公車輛。同時，湖濱南路蓮坂外圖書城（南）站：原站點基礎上往北邊（輪渡方向）遷移200米停靠公車輛；湖濱南路湖東路東（北）站：原站點基礎上往東邊（蓮坂方向）遷移50米停靠公車輛；（候車亭未遷移）；湖濱南路湖東路東（南）站：原站點基礎上往東邊（蓮坂方向）遷移50米停靠公車輛；湖濱南路湖東路西（南）站：原站點基礎上往西邊（輪渡方向）遷移180米停靠公車輛。
2014年03月08日至4月底，思明南路上的鎮海路站將進行捷運施工，施工期間(每周六晚上20:00至周日早上10:00)該站點往廈大方向遷移100米。施工期間請途經公交線路在臨時站點停靠上下客，其餘時間按原站點停靠。
2014年03月15日19:00起，因捷運施工圍擋，現鎮海路站往廈大方向遷移約50米。請途經公交線路在新站點停靠上下客。
2015年05月16日起，因軌道1號線施工，湖濱東路福聯路口的東進口實行禁左措施，同時往蓮坂方向的湖東路東站和蓮坂外圖書城站實行分站停靠：分站停靠: 蓮坂外圖書城站（往蓮坂方向），停靠線路為湖濱南路直行和湖濱東路左轉湖濱南路的45路線路。
2016年04月16日起，為方便市民及遊客的出行，思明南路的“廈大站”首末站更名為“廈大南門（南普陀）站”（金尚車站←→廈大南門﹝南普陀﹞站）。同時，思明南路的“博物館站”更名為“華僑博物院站”；思明南路的“理工學院站（思明）”更名為“理工學院思明校區站”；思明南路的“鎮海路站”更名為“鎮海路口站”。
2016年04月23日起， 為方便後坑片區市民出行，啟用金昌路上新建的一個“後坑前社站”（單邊站點），同時調整該站周邊3處公交站點，具體如下：
1、增停站點：調整45路 往金尚路方向單向增停“後坑前社站”（金尚中學站 與金尚小區站之間）。
2、站點遷移：“金尚小區站” 往金尚路方向遷移約100米。
3、站點更名：
（1）仙岳路上的“金尚車站”更名為“金尚公交場站”（金尚公交場站←→廈大南門﹝南普陀﹞站）。
（2）金泰路上的“後坑路口站”更名為“後坑後社站” 。
2016年06月25日起，湖濱南路的“濱南長途汽車站”更名為“濱南美湖路口站”；湖濱南路的“中山醫院站”更名為“濱南中山醫院站”。
2017年01月21日起，湖濱南路的“湖東路東站”更名為“綠家園小區站”。同時，湖濱南路的“湖東路西站”更名為“湖濱四里站”；湖濱南路的“新村站”更名為“湖濱中學站”。
2017年10月28日起，思明南路的“廈大南門（南普陀）”首末站更名為“廈大（南普陀）站”【金尚公交場站←→廈大（南普陀）站】。
運行路段
45路（金尚公交場站←→廈大﹝南普陀﹞站）
線路走向：
上行：金尚公交場站始發，經仙岳路、金泰路、呂嶺路、蓮花北路、蓮花南路、嘉禾路、湖濱南路、湖濱西路、思明北路、思明南路、演武路、演武西路、思明南路至廈大南門﹝南普陀﹞站。
下行：廈大南門﹝南普陀﹞站始發，經思明南路、思明北路、湖濱西路、湖濱南路、嘉禾路、蓮花南路、蓮花北路、呂嶺路、金泰路、金昌路、金尚路、仙岳路至金尚公交場站。
沿途站點
45路 島內線路金尚公交場站[首班06:15 末班22:00]←→廈大﹝南普陀﹞站[首班06:15 末班22:16]
跨段站點：金尚公交場站——廈大﹝南普陀﹞
票價：上車1元，全程1元，E通卡8折優惠。
上行
金尚公交場站→後坑後社站→金尚中學站→忠侖站→公路征費中心站→泰和花園站→蓮花三村站→蓮花二村站→蓮花中學站→實驗幼稚園站→蓮花南路站→蓮坂北站→蓮坂外圖書城站→綠家園小區站→湖濱中學站→閩南大廈站→濱南中山醫院站→非礦站→濱南美湖路口站→濱南斗西路口站→角濱路口站→思北路口站→中華城站→鎮海路口站→大生里站→華僑博物院站→理工學院思明校區站→廈大﹝南普陀﹞站
下行
廈大﹝南普陀﹞站→華僑博物院站→大生里站→中華城站→中山路站→思北路口站→角濱路口站→濱南斗西路口站→濱南美湖路口站→非礦站→濱南中山醫院站→湖濱中學站→湖濱四里站→蓮坂外圖書城站→蓮坂北站→蓮花南路站→實驗幼稚園站→蓮花中學站→蓮花二村站→蓮花三村站→泰和花園站→公路征費中心站→線務局站→忠侖站→金尚中學→後坑前社站→金尚小區站→金尚公交場站
