線路歷史
上世紀80年代，509路開通投入運營（前埔站←→輪渡站）。
1、線路走向：上行:前埔站始發經前埔東路、蓮前東路、蓮前西路、湖濱南路、湖濱中路、禾祥西路、湖濱西路、廈禾路、鷺江道至輪渡站。下行:輪渡站始發經鷺江道、廈禾路、湖濱西路、禾祥西路、湖濱中路、湖濱南路、蓮前西路、蓮前東路、前埔東路到前埔站。
2、沿途站點：上行:前埔→國貿新城→華林→潘宅→洪文→瑞景新村→東芳山莊→金雞亭→移動公司→龍山橋→蓮前→蓮坂國貿→綠泉→新村→閩南大廈→人民保險→禾祥登特口腔→開元區政府→太湖新城→嘉禾飯店→嘉美花園→西堤→太平洋保險→大同國小→開禾路口→輪渡（郵局）。下行:輪渡（郵局）→開禾路口→大同國小→太平洋保險→西堤→嘉美花園→嘉禾飯店→太湖新城→開元區政府→禾祥登特口腔→湖中友好婦科門診→新村→湖東綠泉→綠泉→蓮坂國貿→蓮前→龍山橋→移動公司→金雞亭→東芳山莊→瑞景新村→洪文→潘宅→華林→國貿新城→前埔。
廈門126路3、首末班時間：前埔首班06:00末班20:40，輪渡首班06:25末班21:30。
2007年05月26日起，蓮前東路原“潘宅站”更名為“瑞景城潘宅站”。同時，蓮前東路原“洪文站”更名為“瑞景商業廣場站”；蓮前西路原“移動公司站”更名為“臥龍西路口站”；蓮前西路原“蓮前水務集團站”更名為“蓮前站”；湖濱南路原“蓮坂國貿站”更名為“蓮坂站”；湖濱南路原“綠泉站”更名為“湖東路東站”；湖濱南路原“湖東綠泉站”更名為“湖東路西站”；湖濱中路原“人民保險站”更名為“湖濱中路站”；禾祥西路原“禾祥登特口腔站”更名為“湖中路口站”；禾祥西路原“嘉禾飯店站”更名為“豆仔尾路口站”；禾祥西路原“西堤站”更名為“禾祥西站”；湖濱西路原“太平洋保險站”更名為“思北路口站”。
2007年10月08日起，中巴509路不再停靠蓮坂東站。
2008年08月15日起，509路調整部分線路走向。
1、 上行由前埔停車場始發經前埔東路、文興東路、環島幹道、蓮前東路接原線路運行；下行由輪渡始發行至禾祥西路後濱路口，改經後濱路、湖濱南路接原線路運行。
2、沿途站點：上行 :前埔停車場→前埔醫院→店上西里→明發新城→前埔村→國貿新城→華林→瑞景城潘宅→瑞景商業廣場→瑞景新村→東芳山莊→臥龍曉城→臥龍西路口→龍山橋→蓮前→蓮坂外圖書城→湖東→新村→閩南大廈→湖濱中路→湖中路口→開元街道辦→太湖新城→豆仔尾路口→嘉美花園→思北路口→開禾路口→鷺江道→輪渡→海濱大廈→輪渡（郵局）。下行:輪渡（郵局）→開禾路口→思北路口→嘉美花園→豆仔尾路口→太湖新城→開元街道辦→中山醫院→新村→湖東→湖東路西→蓮坂外圖書城→蓮前→龍山橋→臥龍西路口→臥龍曉城→東芳山莊→瑞景新村→瑞景商業廣場→瑞景城潘宅→華林→國貿新城→前埔停車場。
3、增減停站點：增停:前埔醫院（上行）、店上西里（上行）、明發新城（上行）、前埔村（上行）、中山醫院（下行）；減停:湖濱中路站（下行）、湖中路口站（下行）。
4、首末班時間：前埔首班06:00末班22:40，輪渡首班06:25末班23:30。
2009年08月27日起，509路調整延伸至醫高專始發（醫高專站←→輪渡站）。
1、線路走向：上行:醫高專站始發經岩前路、前埔南路、文興東路、前埔東路、蓮前東路、蓮前西路、湖濱南路、湖濱中路、禾祥西路、湖濱西路、廈禾路、鷺江道至輪渡站。下行:輪渡站始發，經鷺江道、廈禾路、湖濱西路、禾祥西路、後濱路、湖濱南路、蓮前西路、蓮前東路、前埔東路、文興東路、前埔南路、岩前路至醫高專站。
2、沿途站點：上行:醫高專→前埔舊貨城→城市職業學院→南區一里→前埔南區→國貿新城→華林→瑞景城潘宅→瑞景商業廣場→瑞景新村→東芳山莊→臥龍曉城→臥龍西路口→龍山橋→蓮前→蓮坂外圖書城→湖東→新村→閩南大廈→湖濱中路→湖中路口→開元街道辦→太湖新城→豆仔尾路口→嘉美花園→思北路口→開禾路口→鷺江道→輪渡→海濱大廈→輪渡（郵局）。下行:輪渡（郵局）→開禾路口→思北路口→嘉美花園→豆仔尾路口→太湖新城→開元街道辦→中山醫院→新村→湖東→湖東路西→蓮坂外圖書城→蓮前→龍山橋→臥龍西路口→臥龍曉城→東芳山莊→瑞景新村→瑞景商業廣場→瑞景城潘宅→華林→國貿新城→前埔南區→南區一里→城市職業學院→前埔舊貨城→醫高專。
3、增減停站點：增停:醫高專站、前埔舊貨城站、城市職業學院站、南區一里站、前埔南區站；減停:前埔停車場站、前埔醫院站（上行）、店上西里站（上行）、明發新城站（上行）、前埔村站（上行）。
4、首末班時間：醫高專首班06:00末班22:40，輪渡首班06:25末班23:30。
2010年08月23日起，隨著中巴逐步退市，806B路接替509路運行（醫高專站←→輪渡站）。
1、線路走向：上行:醫高專站始發經岩前路、前埔南路、文興東路、前埔東路、蓮前東路、蓮前西路、湖濱南路、湖濱中路、禾祥西路、湖濱西路、廈禾路、鷺江道至輪渡站。下行:輪渡站始發，經鷺江道、廈禾路、湖濱西路、禾祥西路、後濱路、湖濱南路、蓮前西路、蓮前東路、前埔東路、文興東路、前埔南路、岩前路至醫高專站。
2、沿途站點：上行:醫高專→前埔舊貨城→城市職業學院→南區一里→前埔南區→國貿新城→華林→瑞景城潘宅→瑞景商業廣場→瑞景新村→東芳山莊→臥龍曉城→臥龍西路口→龍山橋→蓮前→蓮坂外圖書城→湖東→新村→閩南大廈→湖濱中路→禾祥商城站→開元街道辦→太湖新城→豆仔尾路口→嘉美花園→思北路口→開禾路口→鷺江道→輪渡→海濱大廈→輪渡（郵局）。下行:輪渡（郵局）→開禾路口→思北路口→嘉美花園→豆仔尾路口→太湖新城→開元街道辦→中山醫院→新村→湖東→湖東路西→蓮坂外圖書城→蓮前→龍山橋→臥龍西路口→臥龍曉城→東芳山莊→瑞景新村→瑞景商業廣場→瑞景城潘宅→華林→國貿新城→前埔南區→南區一里→城市職業學院→前埔舊貨城→醫高專。
3、首末班時間：醫高專首班06:00末班22:40，輪渡首班06:25末班23:30。
2010年10月01日起，廈門公交線路編號調整，廈門公交集團海滄公司806B路更名為126路。同時，調整線路（醫高專站←→湖裡公園站）。沿途站點：上行： 醫高專→前埔舊貨城→城市職業學院→前埔中學→南區一里→前埔南區→前埔國貿新 城→華林→瑞景城潘宅→洪文(瑞景商業廣場)→瑞景新村→東芳山莊→西林雲頂→西林→ 禹州花園→北大生物園→中孚花園→太薇花園→中醫院→中醫院分院→白果山→武警支隊 →仙岳花園→松柏長途車站→松柏(蓮岳路)→篔簹街道(蓮岳路口)→體育東村→體育中心→ 體育中心西→人才中心→中心國小→湖裡公園下行： 湖裡公園→中心國小→人才中心→體育中心西→體育中心→體育東村→篔 簹街道(蓮岳路口)→松柏(蓮岳路)→松柏長途車站→仙岳花園→武警支隊→富環大廈→白果 山→中醫院分院→中醫院→太薇花園→祥店(上店)→中孚花園→北大生物園→禹州花園→ 西林→西林雲頂→東芳山莊→瑞景新村→洪文(瑞景商業廣場)→瑞景城潘宅→華林→前埔 國貿新城→前埔南區→南區一里→前埔中學→城市職業學院→醫高專。
2011年07月12日至2011年09月20日，根據仙岳路改造工程建設指揮部通知，因仙岳路改造工程建設需要，仙岳路的湖濱東路口至嘉禾路口路段由西往東單向實施道路交通管制措施，仙岳路封閉施工涉及的公交線路126路調整方案如下：將126路公交線路調整至湖濱北路運行。由體育中心往SM城市廣場方向，行至湖濱北路蓮岳路口，改為直行湖濱北路，經嘉禾路、仙岳路接原線路運行，返程不變。單向增停：長青路口、呂厝北及仙岳路口站；單向減停：松柏、松柏長途車站、仙岳花園及武警支隊站。
2011年10月10日起，仙岳路恢復通車，126路公交線路站點的調整方案：往醫高專方向恢復停靠松柏、松柏長途車站、仙岳花園及武警支隊站，減停：長青路口、呂厝北及仙岳路口站。
2011年11月01日起，仙岳路原“松柏長途汽車站”更名為“蓮岳路北站”。
2012年10月01日起，廈門的中巴就只剩下8輛530路還在繼續行駛。
2012年12月26日，還在服役期的兩部530中巴車，一輛明年到期，一輛2014年6月份到期。屆時，中巴車將完全退出廈門。
2013年04月28日起，530路為廈門公交系統唯一剩下的中巴。隨著中巴逐步退市，126路替代530路（醫高專站←→湖裡建行站）。12台126路公車由原本10.5米長變成了12.7米長（12台12.7米長的車輛是現已換下來的BRT舊車，前天晚上剛改裝完畢，便立刻投用於地面公交。）。而原本的12台10.5米長車輛則將會調整到其他客流量大的線路。該批次車輛共有15台，現已先替換了12台，等廈門僅剩的2台530路中巴公交退市後，剩餘的3台車輛也將投入使用，屆時將增加126路車輛的運行班次。
2014年02月13日起, 因蓮岳隧道施工圍擋，南山公寓站（雙向）需遷移，途經的126路公交線路將進行調整，具體方案如下：途經的126路公交線路，往華泰路方向單向減停南山公寓站；返程改經海天路、華嘉路、南山路接原線路運行，單向減停仙鷺站，增停新的南山公寓站。
2014年06月22日至2015年01月15日（交通管制時間），因仙岳路與成功大道立交改造工程施工圍擋，中醫院站（翔安進島方向）往前遷移約50米，中醫院分院站（翔安進島方向）臨時調整，在仙岳路（往前過禾山路口處）和台灣街上分設2個臨時公交站點，126路路經停中醫院分院的線路調整停靠：沿仙岳路直行的126路公交線路，改停仙岳路（過禾山路口）處的臨時公交站點 （站名：中醫院分院（仙岳路）站）。
2014年06月25日起，因仙岳路立交改造工程需要，出島方向中醫院站臨時取消，途經126路公交線路往翔安隧道方向，均停靠太薇花園站，單向減停中醫院站
2014年08月09日起，往仙岳山隧道方向的人才中心站實行分站停靠，新站點設定在行人過街天橋附近，直行及右轉的126路在新站點停靠，其餘左轉岳陽小區線路仍在原站點停靠。
2014年08月14日起，126路運行區間調整為（醫高專站←→湖裡﹝南山西路﹞站）。
1、線路走向：上行:醫高專站始發，經岩前路、前埔南路、文興東路、前埔東路、蓮前東路、蓮前西路、金尚路、仙岳路、蓮岳路、湖濱北路、湖濱東路、仙岳山隧道、南山路、華泰路、海天路、華昌路、南山西路至湖裡﹝南山西路﹞站。下行:湖裡﹝南山西路﹞站始發，經支一路、海天路、華嘉路、南山路、仙岳山隧道、湖濱東路、湖濱北路、蓮岳路、仙岳路、金尚路、蓮前西路、蓮前東路、前埔東路、文興東路、前埔南路、岩前路至醫高專站。
2、沿途站點：上行:醫高專站→前埔舊貨城站→前埔中學站→南區一里站→前埔南區站→國貿新城站→華林站→瑞景城潘宅站→瑞景商業廣場站→瑞景新村站→東芳山莊站→西林雲頂站→西林站→禹洲花園站→北大生物園站→中孚花園站→太薇花園站→中醫院站→中醫院分院（仙岳路）站→白果山站→武警支隊站→仙岳花園站→蓮岳路北站→松柏站→篔簹街道站→體育東村站→體育中心站→體育中心西站→人才中心站→南山公寓站→湖裡中心國小站→仙鷺站→特區房地產站→湖裡﹝南山西路﹞站；下行:湖裡﹝南山西路﹞站→湖裡建行站→百樂園站→佳麗花園站→南山公寓站→人才中心站→體育中心西站→體育中心站→體育東村站→篔簹街道站→松柏站→蓮岳路北站→仙岳花園站→武警支隊站→富環大廈站→白果山站→中醫院分院站→太薇花園站→祥店站→中孚花園站→北大生物園站→禹洲花園站→西林站→西林雲頂站→東芳山莊站→瑞景新村站→瑞景商業廣場站→瑞景城潘宅站→華林站→國貿新城站→前埔南區站→南區一里站→前埔中學站→城市職業學院站→前埔舊貨城站→醫高專站。
3、首末班時間：醫高專首班06:00末班22:40，湖裡﹝南山西路﹞首班06:25末班23:30。
2015年06月13日起，126路線路恢復停靠往翔安隧道方向的“中醫院站”。
2015年10月31日起，前埔南路的“前埔中學站”更名為“大同中學前埔校區站”；前埔南路的“前埔舊貨城站”更名為“岩前路口站”。
2016年04月09日起，根據前埔污水處理廠段（前埔南路）雨水箱涵施工期間階段實施交通組織方案，126路途經線路及停靠站點需臨時調整，具體方案如下：第一階段：前埔南路城市職業學院站（東側）周邊道路圍擋施工。
1、調整時間：2016年04月09日—2016年06月15日
2、調整內容：城市職業學院站（東側，即往文興東路方向）臨時取消。
2016年04月16日起，為方便市民及遊客的出行，蓮前東路的“瑞景城潘宅站”更名為“潘宅站”。
2016年06月09日起，調整延伸126路至寨上公交場站始發（寨上公交場站←→醫高專站），避開湖濱北路捷運施工路段，同時加強保稅片區公交出行保障，強化線路現場管理。
1、線路走向：上行:寨上公交場站始發，經長浩路、長岸路（在長岸路調頭）、海天路、華嘉路、南山路、仙岳山隧道、仙岳路（在岳陽小區附近調頭區調頭後直行仙岳路）至仙岳花園站接原線路往醫高專。下行:醫高專始發，按原線路行駛至仙岳花園後，改直行仙岳路、仙岳山隧道、南山路、華泰路、海天路、長岸路、長浩路至寨上公交場站。
2、增減停站點：增停:寨上公交場站、保稅區站、國際航運中心站、公交場站、海天路口站、湖裡建行站（ 往寨上）、文化宮站、文化藝術中心站。減停:南山西路站、人才中心站、體育中心西站、體育中心站、體育東村站、篔簹街道站、松柏站、蓮岳路北站。
3、首末班時間：寨上公交場站首班06:15末班22:30，醫高專首班06:30末班22:30 。
2016年07月23日起，因前埔污水處理廠段（前埔南路）雨水箱涵施工第一階段前埔南路“城市職業學院站”（東側）周邊道路施工結束，現圍擋已拆除，途經的126路公交線路恢復停靠“城市職業學院站”（東側，即 往文興東路方向）。
2016年12月24日起，為進一步方便乘客出行識別公交站點，規範過時的公交站名。岩前路的“醫高專站”首末站更名為“城市職業學院南站”（寨上公交場站←→城市職業學院南站）。同時，蓮前東路的“瑞景新村站”更名為“外國語學校瑞景分校站”；文興東路的“南區一里站”更名為“古樓路口站” 。
2017年02月26日起，配合我市2017年開展“交通整治年”活動，“百樂園站”與“佳麗花園站”採取分站停靠措施（不同方向的線路停靠不同點位）， 緩解海天路的“公交列車化停靠”現象。湖裡建行 直行海天路的126路公交線路停靠“佳麗花園站”，減停“百樂園站”。
2017年05月20日起，為消除在“中醫院分院站” 臨時站點無站台區域候車的安全隱患，調整126路公交線路 往SM城市廣場方向 單向 減停仙岳路的“中醫院分院站”，減停該站客流可 由與該站相距150米的“白果山站”分流。
運行路段
126路（寨上公交場站←→城市職業學院南站）
線路 走向 ：
上行 ：寨上公交場站始發，經長浩路、長岸路（在長岸路調頭）、海天路、華嘉路、南山路、仙岳山隧道、仙岳路（在岳陽小區附近調頭區調頭後直行仙岳路）、仙岳路、金尚路、蓮前西路、蓮前東路、前埔東路、文興東路、前埔南路、岩前路至城市職業學院南站。
下行 ：城市職業學院南站始發，經岩前路、前埔南路、文興東路、前埔東路、蓮前東路、蓮前西路、金尚路、仙岳路、仙岳山隧道、南山路、華泰路、海天路、長岸路、長浩路至寨上公交場站。
沿途站點
126路 島內線路寨上公交場站[首班06:15末班22:30]←→城市職業學院南站[首班06:30末班22:30]
跨段站點：寨上公交場站——城市職業學院南
票價：上車1元，全程1元，E通卡8折優惠。
上行
寨上公交場站→象嶼保稅區站→國際航運中心站→湖裡竹坑站→海天長岸路口站→湖裡建行站→海天華嘉路口站→南山公寓站→文化藝術中心站→文化宮站→仙岳花園站→武警支隊站→富環大廈站→白果山站→中醫院分院站→中醫院站→太薇花園站→祥店站→中孚花園站→北大生物園站→禹洲花園站→西林站→西林雲頂站→東芳山莊站→外國語學校瑞景分校站→瑞景商業廣場站→潘宅站→華林站→國貿新城站→前埔南區站→古樓路口站→大同中學前埔校區站→城市職業學院站→岩前路口站→城市職業學院南站
下行
城市職業學院南站→岩前路口站→城市職業學院站→大同中學前埔校區站→古樓路口站→前埔南區站→國貿新城站→華林站→潘宅站→瑞景商業廣場站→外國語學校瑞景分校站→東芳山莊站→西林雲頂站→西林站→禹洲花園站→北大生物園站→中孚花園站→太薇花園站→中醫院站→白果山站→武警支隊站→仙岳花園站→文化宮站→文化藝術中心站→湖裡中心國小站→佳麗花園站→南山小區站→湖裡建行站→海天長岸路口站→湖裡竹坑站→國際航運中心站→象嶼保稅區站→寨上公交場站
