主要職責
根據《中共重慶市委辦公廳重慶市人民政府辦公廳關於巫溪縣人民政府機構改革方案的通知》（渝委辦〔2009〕183號）和《中共巫溪縣委巫溪縣人民政府關於巫溪縣政府機構改革的實施意見》（巫溪委發〔2009〕32號）。設立巫溪縣衛生局，為縣政府工作部門。一、職責調整
(一) 劃入原由縣食品藥品監督局承擔的綜合協調食品安全、組織查處食品安全重大事故的職責。
(二) 將食品衛生許可，餐飲業、食堂等餐飲服務環節（以下簡稱餐飲服務環節）食品安全監管和保健食品化妝品衛生監督管理的職責，劃給縣食品藥品監督管理局。
（三）將新型農村合作醫療行政管理職能劃入縣人力資源和社會保障局。
二、主要職責
（一）貫徹執行黨和國家的衛生工作方針、政策。對全縣衛生工作進行調查研究，為縣人民政府制定衛生事業發展規劃提供科學依據。組織實施縣人民政府制定的全縣衛生事業發展規劃；堅持公共醫療衛生的公益性質，堅持預防為主、以農村為重點、中西醫並重的方針，堅持為人民健康服務的方向。
(二)推進全縣醫藥衛生體制改革。協同相關職能部門擬定全縣衛生體制改革方案；按照重慶市有關衛生、食品安全、藥品、醫療器械的法規、規章，依法制定有關標準和技術規範。
（三）負責實施全縣國家基本藥物制度。
（四）承擔食品安全綜合協調、組織查處食品安全重大安全事故的責任，負責食品及相關產品的安全風險評估和預警工作，統一發布重大食品安全信息。
（五）指導全縣衛生規劃工作，制定衛生資源配置標準，統籌規劃與協調全縣衛生資源配置；制定社區衛生服務發展規劃和服務標準；協同有關部門監督管理衛生行業的收費標準。
(六)按照上級衛生行政主管部門的要求，結合我縣實際，研究制定農村衛生、社區衛生、婦幼保健和健康教育規劃、服務標準並組織實施。
(七)貫徹“預防為主”的方針，開展全民健康教育；制定重大疾病防治規劃；負責疾病預防控制工作，管理和加強傳染病防治，組織對重大疾病的綜合防治，組織衛生技術力量防止和控制疾病的發生、蔓延；協調有關部門對重大疾病實施防控與干預，發布法定報告傳染病疫情信息；負責縣防治愛滋病工作領導小組的具體工作；協調有關部門做好全縣狂防工作。
(八)承擔指導規範衛生行政執法工作，按照職責分工負責職業衛生、放射衛生、環境衛生和學校衛生的監督管理，負責公共場所和飲用水的衛生安全監督管理。
(九) 承擔全縣醫療機構和醫療服務行業的監督管理工作。承擔組織實施醫療機構、醫療執業人員、醫療服務技術及大型醫療設備的審核報批工作，監督醫療服務質量。依法監督採血、供血渠道及臨床用血質量。
(十)制定全縣衛生科技發展規劃，組織實施成人醫學教育和繼續醫學教育工作；對全縣的醫學教育培訓中心的醫教工作進行指導和管理。
(十一)制定我縣衛生人才發展規劃，擬訂醫療衛生職業道德規範，組織實施衛生技術人員資格認定和職業道德規範培訓工作。
(十二)加強衛生工作的交流與合作，組織參與國際國內倡導的衛生宣傳活動。
(十三)推進中醫的繼承與創新。制定全縣中醫、中西醫結合醫療發展規劃，指導全縣中醫工作；協調有關部門共同發展全縣中醫事業。
（十四）按有關規定負責全縣幹部保健和管理工作。
（十五）負責衛生應急工作，擬定衛生應急預案和應急措施，負責突發公共衛生事件監測預警和風險評估，指導實施突發公共衛生事件預防控制與應急處置，發布突發公共衛生事件應急處置信息。
（十六）擬訂愛國衛生標準並組織開展愛國衛生活動和衛生創建，負責農村環境衛生綜合整治及衛生村鎮創建工作。
（十七）承辦縣政府交辦的其他事項。
內設機構
根據上述職能，巫溪縣衛生局設7個內設機構：(一)辦公室
負責會議組織、文電處理、秘書事務、行政公務、新聞宣傳、期刊管理、衛生系統信息化建設；負責人大議案、政協提案辦理、信訪等工作；負責機關資產、房產、後勤服務和安全保衛工作。
（二）人事科教科
負責醫療衛生單位幹部職工的職業道德教育；制定全縣衛生人才發展規劃和衛生人員職業道德規範；組織實施衛生專業技術人員職稱評定工作、職工年度考核、事業單位年檢；負責在崗幹部、職工管理；負責人員編制、工資以及離退休幹部的管理和服務、人事檔案管理工作；負責繼續醫學教育並組織實施；負責下屬單位領導幹部考核和鄉鎮(含中心)衛生院領導的考核工作。組織實施全縣預防和控制“四害”工作，組織實施農村村組改水和衛生廁所建設；組織實施農村飲用水水質衛生監測及衛生學評價。
(三)疾病控制和法制監督科
負責重大疾病的預防和控制，制定重大疾病防治規劃；管理傳染病、地方病、慢性非傳染性疾病及寄生蟲病的防治；組織或指導對不明原因疾病、新發疾病的調查；依法組織調度全縣的衛生技術力量，協助縣人民政府對重大疫情實施緊急處置，防止疫情的蔓延，協調有關部門做好全縣狂防工作；負責巫溪縣預防醫學會工作；負責衛生行政執法的監督管理和衛生行政複議、行政應訴工作。
(四)農村衛生科（婦幼保健和社區衛生科）
負責全縣鄉鎮(含中心)衛生院、合作醫療、鄉村一體化、鄉村醫生的管理工作；研究制定農村衛生、社區衛生、婦幼保健和健康教育計畫、服務標準，並組織實施；制定初級衛生保健規劃並組織實施。
(五)醫政科
負責制訂全縣醫療事業的發展規劃、醫療機構設定規劃和機構資質審批、執業登記等工作；組織成人醫學教育；組織執業醫師、執業護士的考試、考核和註冊登記工作；依法監督管理採血、供血渠道及臨床用血質量；負責醫療質量管理和組織協調醫療事故的技術鑑定、醫療糾紛的處理，負責監督管理醫療機構內部藥事工作；負責醫療急救和重大突發性事件人員傷亡的緊急醫療救護組織指揮工作，負責衛生下鄉的組織工作。協同有關部門做好醫保工作。負責醫學會工作。制訂中醫、中西醫結合發展規劃和年度計畫；負責中醫、中西醫結合醫療機構的規劃、機構資質審批；負責中醫、中西醫藥結合醫療機構專科建設工作；組織對傳統中醫藥理論、醫術、藥物的發展、整理、總結、提高和推廣。負責紅十字會相關工作。
(六)規劃財務科
指導縣域衛生規劃工作；統籌規劃與協調全縣衛生資源配置；加強醫療衛生單位的財務監管；負責衛生事業費的預、決算和財務會計制度的實施，引進和利用國內外建設項目資金，加強專項資金的管理；負責衛生統計信息、內部財務審計工作；負責大型醫療儀器設備的配置和醫療機構基建項目及國有資產的監督管理；負責項目經費監管工作；負責局機關財務工作。
(七)衛生應急辦公室
擬定全縣衛生應急和緊急醫學救援規劃、制度、預案和措施；指導突發公共衛生事件的預防準備、監測預警、處置救援、分析評估等衛生應急活動；負責對突發公共衛生事件和其他突發事件實施預防控制以及緊急醫學救援；組織實施對突發急性傳染病防控和應急措施；負責對重大災害、恐怖、中毒事件及其他事故等組織實施緊急醫學救援；發布突發公共衛生事件應急處置信息。
