1908年6月16日清晨的《國民新聞》報導，“以艷麗的筆觸、清新的思想馳名文壇的小說家川上眉山氏於15日晨4時30分左右，在東京牛込區天神町67號寓所，自殺身亡”，時年39歲。說是因為次日要搬家搬到一所寺院的一間斗室，夫人整理東西到凌晨2時才休息。此時眉山已經在書房睡熟。到凌晨5時，夫人無意拉開書房門一看，不由魂飛魄散----小小書房已經成一片血海！川上眉山用刮臉的剃刀切斷了頸動脈，傷口極深，白色的浴衣、被子都被鮮血染紅，其狀慘不忍睹。
他本來是和尾崎紅葉、山田美妙等一起參加了硯友社的創建，但性格的孤獨使他後來到紅葉的《金色夜叉》大紅大紫時，已經和紅葉形同陌路。當聲勢浩大的自然主義文學浪潮席捲日本全國後，這些過渡時期的作家既沒有成什麼大的氣候，又擔心被自然主義淘汰，產生了一種莫名的煩惱。川上眉山寫的東西漸漸不受讀者歡迎了，以賣文為生的作家在文壇失勢，必然帶來生計上的困窘。當時，大多數作家在報章雜誌社兼職，而川上眉山則不然。川上眉山父親死後留下一屁股的債，為了養家餬口，他不得不借高利貸，而驢打滾兒的利更讓他難以承受。所以，他到了30歲還是獨身。眉山本來作品就不多，身體又不好；朋友介紹他到一家報社，但他不想上班；坪內逍遙介紹他到早稻田大學當講師，他也謝絕。他每天搞搞茶道，栽花弄草，逍遙自在。
日本文人川上眉山的自殺，無疑是因為經濟拮据，次日就要搬到寺院一間斗室，淪為寄人籬下者，強烈的文人自尊使他再無生趣了。大原健士郎氏將眉山的自殺結論為“價值喪失的自殺”，大原寫道：“從社會學角度看，他經濟拮据而不得不搬家，這些原因錯綜複雜，已經形成了他的自殺準備狀態，使他下自殺決心的可以看做是因為他社會作用意識的喪失，……自殺的導火索就是搬家。”
