民國26年夏秋，孫篤生在共產黨的幫助和籌劃下，賣掉汽車公司，購買槍枝彈藥，以公司的地下黨員為骨幹，招募一些進步青年，於民國28年3月組織一支實際由共產黨控制的抗日武裝，灌雲縣縣長吳春科迫於國共合作、共同抗日的大勢，承認了這支武裝，定名為灌雲縣第三區抗日基幹隊，並委任孫篤生為大隊長。這支武裝後來發展到200多人，活躍在鹽河兩岸，在相當長的時間裡，使張店鎮建不了偽政權。
民國29年，八路軍挺進蘇北建立抗日民主政權，孫篤生出任灌雲縣縣長，他執行共產黨的路線，團結抗戰、嚴懲賣國投敵分子，還將家中百餘畝地全部獻給政府。民國33年底，孫調任淮海區副專員兼工商局長。民國34年3月，加入中國共產黨。同年8月，被委任辦連雲市市長（未到任）。
民國34年9月，孫篤生出任淮北鹽務管理局局長。不久，兩淮鹽務總局成立，孫任副局長兼淮北鹽務局局長，他克服重重困難，在內戰爆發前搶運原鹽1000萬擔，支援解放戰爭。民國36年，中共兩淮鹽特委成立。孫篤生主動要求留下，協助杜李工作。在長達3年的解放戰爭中，他和鹽特委其他人員一直在鹽場一帶堅持鬥爭。民國38年4月，孫篤生調揚州任兩淮鹽務總局第一副局長。建國後，任華東鹽務局副局長，輕工業部鹽務總局產銷處處長。
1951年，孫篤生調北京任全國鹽業工會主席。1953年，孫受到錯誤處理，調任輕工業部駐天津辦事處主任。1958年，調回江蘇任省政協委員、副秘書長。“文化大革命”中，他拒絕提供任何偽證，保護不了不少老幹部。1969年5月離休。1981年5月9日，中華全國總工會機關委員會撤銷了1953年對他的處分，恢復原來級別（行政11級）。1990年4月3日逝世於南京，終年92歲。
