天主教愛沙尼亞宗座署理區(拉丁語:AdministratioApostolicaEstoniensis)是愛沙尼亞一個羅馬天主教宗座署理區,直屬教廷。
範圍包括愛沙尼亞全境,教座位於塔林。2008年有教友5,745人(估轄區人口0.4%)、九個堂區、十四名司鐸。現任宗座署理為菲利普‧若爾丹。
天主教在1227年傳入愛沙尼亞,1561年由於宗教改革,公開彌撒被禁止至1786年。1924年11月1日建立宗座署理區。[1]1942年至1992年,由於蘇聯占領關係,署理一職懸空。
天主教愛沙尼亞宗座署理區 Apostolica sis)是愛沙尼亞一個羅馬天主教宗座署理區,直屬教廷。