研究所在區域水環境治理研究領域取得了多項重大研究成果,尤其是在舉世矚目的上海市蘇州河水環境綜合整治工程中,提出了蘇州河整治的最佳化技術方案,使蘇州河2000年基本消除黑臭,主要指標達到景觀水標準,並節省工程投資17億元。研究所先後獲國家科技進步二等獎一項,省部級科技進步一等獎一項、二等獎3項;出版220萬字的學術專著2部。
研究所與有關單位密切合作,致力於以下研究:地表水及水生態處理工程的數學及物理過程模擬研究,農業生產與農村生活污染的生態環境工程技術研究,區域環境規劃、環境標準與環境政策研究。研究所目前主持多項國家和省市重大項目,如上海市重點項目“蘇州河環境綜合整治三期實用技術研究”、中意國際合作項目“崇明島生態建設與環境保護規劃研究”等。
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