院系設定
學院下設2個系，3個實驗教學中心，12個教研室。分別是藥學系、生物工程（再生醫學）系、藥學實驗中心、藥理實驗中心、生物工程實驗中心、藥物化學教研室、天然藥物化學教研室、藥物分析學教研室、生藥學教研室、微生物與生化藥學教研室、藥理學教研室、實驗病理與毒理學教研室、藥劑學教研室、生物化學與分子生物學教研室、基因工程教研室、組織工程教研室、工程生物教研室。
學位授權點
多年來，藥學院在學科建設方面取得了較好的成績，目前學院共有5個博士學位授權點（藥理學、微生物與生化藥學、生物化學與他子生物學、病理學與病理生理學、醫學生物工程學），7個碩士學位授權點（藥理學、藥物化學、藥物分析學、微生物與生化藥學、生物化學與分子生物學、病理學與病理生理學、醫學生物工程學），有2個博士後流動站（基礎醫學、生物學）。學院現有國家中醫藥科技中藥化學三級重點實驗室、吉林省衛生廳再生醫學重點實驗室、吉林省衛生廳藥物研發重點實驗室、吉林省中醫局中藥藥理重點實驗室、吉林省中醫藥科技中藥藥理二級實驗室、吉林省中醫藥科技中藥藥劑二級實驗室、吉林省中醫藥科技生物工程二級實驗等7個重點實驗室。
師資力量
藥學院現在職工113人，其中教授20人、副教授20人，講師21人，高級實驗師7人，實驗師13人，工程師2人。90%的教師具有博士或碩士學位，現有博士生指導教師13人，碩士生指導教師23人。藥學院培養人才的層次較多，有大學本科生、碩士研究生、博士研究生、成人教育本科生及專科生等，同時招收在職攻讀學位各類研究生，包括以研究生畢業同等學力在職申請碩士學位、生物工程專業學位研究生、製藥工程專業學位研究生、高校教師培訓計畫等。截止2005年在校研究生221人，本科生385人，成人教育本科生121人。學院擁有一批優秀的學科帶頭人和科研骨幹，他們在各自學科領域中都取得了可喜的成果。學院共完成國家“八五”科技攻關、國家“863”項目、國家自然科學基金重點及面上項目、高等院校博士點專項科研基金項目以及省級科研項目等總計60餘項，其它橫向聯合項目30餘項。獲得省部級科技獎勵的科研成果共20餘項。發表學術論文1080餘篇，其中核心期刊860篇，SCI收錄文章40餘篇。
藥學科學是一門綜合性科學，它與生命科學、醫學、環境科學及化學有著密切的聯繫，藥學的發展史是人類文明史的一個重要組成部分，藥學的發展將會給人類提供便多防病、治病的新藥，也將為生命科學等學簡報發展提供新的概念、理論、方法和技術。吉林大學藥學院是一所以藥學及生物工程（再生醫學）為特色，理、醫、工等多學科協調發展，傳統研究與現代研究並舉的研究型學院。學院設備先進，環境優越、學術氛圍濃厚，有嚴謹的學風，已經培育出一批又一批的高層次人才。如今，藥學院全體教職員工同心同德，勵精圖治，以勃發的生機，闊步前進，為早日躋身於世界一流的藥學學科而不懈奮鬥。
藥學實驗中心
吉林大學藥學院藥學實驗中心2005年7月成立,現有學生實驗室4個，儀器室1個，總面積900平方米.中心主任楊曉虹(兼)，副主任陳滴,實驗技術人員3名。其中高級實驗師1名，中級實驗師3名。中心主要工作是承擔藥學專業本科生、專科生、研究生實驗課教學任務。主要課程有：藥物化學實驗、藥物分析實驗、生化分析實驗、天然藥物實驗、藥劑學實驗、生物藥劑學實驗、藥用植物學實驗、生藥學實驗。儀器設備總資產約300萬，有高效液相色譜儀、氣相色譜儀、原子吸收分光光度計等精密儀器，保證了教學、科研工作需要。
陳滴：藥學實驗中心副主任，高級實驗師，長春市職工醫科大學藥學專業畢業。1981年起從事藥學專業工作。在原白求恩醫科大學基礎醫學部藥物研究室。主要從事藥物研究與開發，參加了前列腺素E1E2研究，γ-月見草油研究，EPA、DHA研究，大豆皂苷、異黃酮研究，甲基烯丙基硫化物研究等國家基金、省級課題二十多項，發表學術論文20多篇，現在從事藥學專業實驗課教學與新藥研究開發工作。
實驗中心
吉林大學藥學院生物工程實驗中心（以下簡稱“中心”）始建於2005年7月, 為校院兩級管理的教學單位。中心以培養學生實踐能力、創新能力和提高教學質量為宗旨，以實驗教學改革為核心，以高質量實驗教學隊伍和較完備的實驗條件為保障，建立科學管理體制，全面提高實驗教學水平和實驗室使用效益。中心設主任1名，副主任1名。實驗中心現有教授1名，專職實驗技術人員3名，其中高級工程師1名，工程師1名，助理工程師1名。
中心任務
實驗中心主要承擔藥學院的生物工程專業和藥學專業本科生的實驗教學任務，同時還承擔研究生、成教生、專科生等相關的實驗教學任務。本科生教學實驗課程有：《基因工程學》、《細胞工程學》、《組織工程學》、《發酵工程學》、《生物製藥學》，總計34個實驗，年實驗學生數266人，學時數416學時。在保障實驗課教學工作的基礎上，實驗中心面向院內開放，為科研服務，學院承擔的各類項目均可充分利用中心的儀器、設施等條件。實驗中心現有學生實驗室3個，包括綜合性教學實驗室、儀器室、實驗準備室，總面積300平方米。中心的儀器、設備總值近100萬元。除了生物工程常規實驗儀器以外，還有低溫高速冷凍離心機、酶標儀、PCR儀、凝膠成像分析儀等大型儀器設備，能夠保證目前教學實驗及科研工作的需要。
負責人
主任：周余來 ，男，1965年出生，中共黨員。1988年畢業於吉林大學化學系（獲理學學士學位）；1993年研究生畢業於白求恩醫科大學（獲醫學碩士學位）；2001年畢業於吉林大學（獲理學博士學位）。現任吉林大學教授、碩士研究生導師，吉林大學藥學院生物工程（綜合）教研室主任、兼吉林大學藥學院生物工程實驗中心主任，吉林省再生醫學重點實驗室副主任。1998年至今，從事醫學生物工程學研究，研究方向為組織工程學和細胞工程學。目前開展的組織工程學研究項目有：組織工程皮膚、組織工程軟骨、組織工程角膜、組織工程尿道、組織工程膀胱、組織工程肝臟等。在幹細胞和組織工程學研究領域，2003年以來承擔吉林省科技廳項目2項；吉林省衛生廳課題2項；吉林大學創新工程課題2項。作為項目組成員參加國家高技術研究展計畫（863計畫）項目2項，以及國家自然科學基金課題、部（省）級科研課題等共15項課題的研究工作。作為項目組成員獲國家教委科技進步三等獎1項（1996）、吉林省科技進步一等獎1項（2006）、吉林省科技進步三等獎1項（2007）。完成教育部鑑定成果1項、申報專利2項。發表研究論文50餘篇。主編專著1部。2003年以來，承擔7門次生物工程（醫學）專業本科生的主幹課程、10門次生物工程專業碩士研究生（包括工程碩士和研究生班）學位課的教學工作；獨立指導碩士研究生17人，協助本學科教授指導碩士研究生14名、博士研究生6名的學位論文實驗工作。
