貨幣陳列館分八大功能區,分別為:古代貨幣一區、古代貨幣二區、近代貨幣區、人民幣區、有價證券區、外國貨幣區、反假幣區及貨幣研究所。中國貨幣展品包括自先秦至中華人民共和國的歷代貨幣;民國時期及國民黨時期的各種紙幣;抗日戰爭時期、解放戰爭時期的根據地貨幣;中華人民共和國成立以業的五套人民幣;近二十年來中國人民銀行發行的紀念幣和銀幣;各商業銀行發行的各種類型的電子貨幣。博物館中的外國貨幣涉及了五大洲包括亞洲、歐洲、美洲、非洲、大洋洲的大部分國家的紙幣和硬幣。館藏品楚國、南宋、金牌、銀元寶、外國金幣、及反假幣展區等為本館的五大亮點。
建館以來,學院組織了多次貨幣研討會,就中國不同時期的貨幣思想進行了廣泛而深入的探討。我院多位教授長期以來一直至力於中國貨幣及外國貨幣的研究,並取得了豐碩的研究成果。中國錢幣學會副會長葉世昌教授,為南京審計學院貨幣陳列館資深顧問,著有《中國貨幣理論史》;南京審計學院金融學院院長汪祖傑教授,著有《當代中國貨幣理論的歷程軌跡》;南京審計學院張友直教授著有《<官子>貨幣思想考釋》,他編寫的《中國歷史上的實物貨幣》(60萬字)已出版。這些專家以金融研究所及中國貨幣思想史研究中心為平台,與中國人民銀行南京分行合作,在中國古代貨幣思想家考釋、中國貨幣思想編年史、中國實物貨幣史等方面展開研究,以便填補中國貨幣思想史研究空白。