建設歷史
特級風險
1號線軍博站於1971年開設，當時由於採用明挖法以及未對之後捷運做出合理規劃，並未考慮到諸多地質因素以及換乘問題，使得軍博站成為了北京捷運地質問題與結構問題最為複雜的車站。
地質結構
玉淵潭東湖至軍事博物館整片區域的地質情況也非常複雜，含有顆粒較大的礫岩層和顆粒細微的砂卵石地層，施工時需用較大動力盾構機，而盾構機也很容易出現被大塊鵝卵石卡殼的情況，開挖工作十分複雜。[32]
南北走向的9號線軍博站位於長安街羊坊店路口正下方，與東西走向的1號線十字交叉。新建捷運站下穿運營中的捷運1號線，而位於老舊捷運站下方開挖新隧道，在世界捷運施工技術中屬於特一級危險工程，易出現塌方、滲漏、地下水污染等問題。
]白堆子至軍事博物館站區間要下穿玉淵潭公園湖區，公園東湖從2009年末起將水抽乾半年，以便盾構機在卵石含量高的地下掘進。除此之外，軍事博物館地區受到玉淵潭下滲作用，埋深8米就是富含水層，而捷運1號線即位於含水層之上，原定修建方式為抽乾水層建設，抽水進行了兩個月，但卻因為玉淵潭不斷下滲而始終不能抽乾，人工暗挖超大洞體因突水事故而坍塌的風險極高。經過30多次專家論證、商討，9號線軍博站最終決定將站位下調，車站底部從27米下探至35米，將含水層夾在兩條線路之間，成為北京最深的捷運站之一。
新建車站同時又與舊車站之間的結構不斷衝突，頂部與1號線結構底部之間，僅隔著2米厚的覆土，施工隊伍經受了長期高強度的安全壓力考驗。為了不影響1號線運營，最終軍博站由原定的機械施工改為了豎井式的人工挖掘，施工期間沉降控制必須精確到3毫米以內，否則會影響鐵路正常運營，施工人員採取了智慧型化自動監測系統，200多個監測點的沉降信息24小時上傳，每半小時更新一次，自動補償注漿系統根據需要隨時向1號線結構底板注漿加固。施工期緩慢，也就造成了9號線北段遲遲不能通車。
換乘困難
9號線軍博站共設5個出入口，但是因為同時地處舊站、地質複雜、管線密集的三重問題之下，軍博站的換乘通道的距離非常長，長長的樓梯一眼望不到頭，好在有雙向自動扶梯方便乘客進出站。為了避開無法拆移的管線，自動扶梯和樓梯被分設成為三段。而直通央視大樓的出入口，受管線影響還特意設計成了“八字形”，步梯和自動扶梯各走一個通道。另外，站廳層與站台層的連線，也全面採用了雙向扶梯的人性化設計。
客流壓力
軍博站與1號線的換乘問題受到市民關注，據捷運運營公司數據顯示，1號線軍博站2011年日均客流9萬多，是全市客流量最大的捷運站之一，其中大部分是去往或來自西客站的客流。而軍博站遲遲未與西客站貫通則導致來自除去房山豐臺方向的旅客全部積壓於此。
9號線北段開通後，按計畫實行5分鐘間隔運行，全程35分鐘跑完。全天預計客流量為16萬人，與2011年的的4萬人相比將大大增多，高峰小時運力將達到1.5萬人。
南北貫通後，9號線是否將人滿為患，對此，市交通委表示在最大客流下，9號線滿載率也將控制在85%—86%，處較為舒適的狀態。
同時，9號線北段開通後將在國家圖書館站實現與4號線的換乘，勢必會增加4號線北段壓力。但市交通委表示，2011年4號線已實現2分鐘間隔，即便面對9號線的客流衝擊，4號線北段滿載率也將控制在70%以下。
開通
2013年12月21日起，9號線軍事博物館站有望實現換乘，乘客既可實現與1號線換乘，也方便去北京西站。位置
該站位於北京市海淀區中國人民革命軍事博物館南側。1號線車站沿復興路呈東西向布置，9號線車站在1號線車站西端，斜跨復興路與軍博西路–羊坊店路路口，大致呈南北向布置，兩線車站呈“T”形交叉。
換乘方案
與1號線換乘
於2012年底通車的9號線北段中，與捷運1號線實現換乘的軍事博物館站車站主體已經於2012年8月15日完工。該座車站因地理位置特殊、地質穩定性差，被評為全線唯一的“特級風險源”。
2012年底，9號線北段通車試運營，為此該站將新建南北兩個換乘大廳和兩條換乘通道，以銜接1號線。
9號線與1號線換乘的新建南北換乘通道2012年底並不投入使用，這主要是受與1號線4個出入口接駁施工影響，屆時將在軍博站與1號線實現地面換乘。全部改造完工預計得到2013年6月，屆時換乘將回到地下，通過兩條換乘通道進行。
雖然9號線年底南北貫通，但與1號線暫時無法換乘，要到2013年10月份才能實現。主要原因在於地下換乘通道還只打通一條，無法承受雙向大客流的衝擊。因此，年底開通後，軍博站暫時不能開通。在9號線軍博站站廳，一條通往1號線站廳的換乘通道已經完成。這是靠長安街南側的換乘通道，長約200多米，一眼望不到頭。與它對應的長安街北側換乘通道則受多重因素制約工期滯後。受軍博站預留條件差、客流過於密集影響，即便2013年9號線與1號線實現換乘，行走距離也會比所有已運營的捷運換乘站更長。[9]
根據換乘方案，9號線換乘1號線相對簡單，從換乘通道西端的地下換乘廳直接上扶梯進入1號線站廳，再下到站台層，總步行距離200米左右。但1號線換乘9號線則非常遙遠，必須繞到站台層最東端進入換乘通道往西走，然後經西端換乘廳進入9號線站台，相當於在地下兜一圈，總步行距離400米左右。預計2013年6月地下換乘實現後，很多旅客將會選擇出站再買票的方式節省換乘時間。
1號線和9號線換乘時，乘客由9號線站台至換乘廳，通過換乘通道進入1號線站台；由1號線站台從站廳進入9號線換乘廳，再下至9號線站台。預計尖峰時段將通過加設導向標誌使南、北兩條換乘通道形成單向環形換乘模式。 9號線軍博站共設5個出入口，但是因為同時地處舊站、地質複雜、管線密集的三重問題之下，軍博站的換乘通道的距離非常長，長長的樓梯一眼望不到頭，好在有雙向自動扶梯方便乘客進出站。為了避開無法拆移的管線，自動扶梯和樓梯被分設成為三段。而直通央視大樓的出入口，受管線影響還特意設計成了“八字形”，步梯和自動扶梯各走一個通道。另外，站廳層與站台層的連線，也全面採用了雙向扶梯的人性化設計。
軍事博物館9號線車站主體下穿既有1號線，1號線車站的西端靠近9號線車站的中間位置，為避開1號線線路採用分離式站廳，1號線車站為地下二層車站，其站台層位於地下二層；9號線車站為地下三層車站，其站台層位於地下三層；換乘廳位於地下一層，兩線車站採用換乘廳+換乘通道的換乘方式，通過從9號線兩端站廳引出的南、北兩條換乘通道連線，每條換乘通道有兩個接口，分別連線1號線車站東西兩側的站廳。限於1號線軍博站建成時未預留換乘條件，需另建設換乘通道，1號線與9號線的換乘距離仍較遠。
2015年4月18日8時50分，一名乘客在軍事博物館站進入運營軌道，列車緊急制動，墜軌者被確認死亡。9時02分，運營秩序逐步恢復。
2015年8月7日8時12分，1號線軍事博物館站上行（開往四惠東方向）一名乘客進入運營軌道正線，列車緊急制動，8時13分車站工作人員採取接觸軌停電措施進行處理。8時16分該乘客被帶上站台，接觸軌恢復送電，運營秩序逐步恢復。
裝飾
9號線軍事博物館站的站廳牆上裝飾有《孫子兵法》中的經典語句，契合軍事博物館的站名。
出入口
軍事博物館站共有9個出入口，E1/E2、A、B出入口位於復興路北側，H、D、C1/C2出入口位於復興路南側，G出入口位於羊坊店路東側。
首末車時間
1號線
開往四惠東：5:17-23:18
開往蘋果園：5:16-23:47
9號線
開往郭公莊：6:07-23:27
開往國家圖書館：5:43-23:03
公交換乘
A口：21 78 388 205夜
B口：1 21 52 68 78 94 99 308 337 特18 夜1 夜8
C口：1 21 65 68 78 99 308
D口：337 特18
E口：337 99 1 308 特18
G口：21 99 414 388 夜212
H口：1 89 52 68
臨近車站
| 下行 | 線路 | 上行 |
| 開往蘋果園站 （下一站：公主墳站） 距離1172米 | 1號線 | 開往四惠東站 （下一站：木樨地站） 距離1166米 |
| 開往郭公莊站 （下一站：北京西站） 距離1398米 | 9號線 | 開往國家圖書館站 （下一站：白堆子站） 距離1912米 |
