主要職責
北京市懷柔區衛生局機構職能：
(一)貫徹執行黨的路線方針政策和衛生方面的法律、法規及規章；對全區衛生資源配置進行巨觀調控，使其發揮最大效能。
(二)負責本區傳染病、慢性非傳染性疾病,口腔疾病及精神疾病等的防治工作；指導、監督母嬰保健專項技術和計畫生育技術的實施。負責全區健康教育和宣傳工作。
(三)負責醫療衛生全行業管理。負責醫療機構資格的許可和管理工作，負責大型活動的醫療保障、醫療事故處理工作；負責衛生系統的行風建設工作，規範本區的醫療秩序。
(四)落實市衛生局制定的農村衛生和初級衛生保健工作規劃和政策措施，負責全區社區衛生服務工作；負責本區村級衛生室和鄉村醫生隊伍的建設。
(五)擬定並實施本區醫學科技、教育發展規劃；負責組織專業技術人員和管理人員崗位(專業)培訓和繼續教育的行政管理
工作。
(六)負責對醫療機構大型醫療設備配置、套用質量和人員的監督管理；負責組織、監督醫療機構對藥品的集中招標採購工作。
(七)組織調度全區的衛生技術力量，對重大突發疫情、病情實施緊急處置；預防和控制疫情、疾病的發生、蔓延；負責醫療急救體系的建設及組織全區重大搶救工作。
(八)貫徹中西醫並重的方針，推進中醫藥的繼承、創新與合作。
(九)負責本系統黨的組織、宣傳、紀檢、監察、統戰工作，加強本系統領導班子建設；負責本系統工會(職代會)、共青團、婦聯等組織的領導工作。
(十)制定並實施本系統衛生人才培養和發展規劃；負責系統內專業技術人員的聘任工作；負責本系統人才引進和學科帶頭人的選拔和培養工作。
(十一)研究擬定建立健全衛生事業的補償機制，拓寬籌資渠道並組織實施；對本系統事業單位執行醫院財務制度、物價標準等情況進行監督、檢查與指導，負責事業單位的財務審計工作。
(十二)承擔愛國衛生運動方面的有關工作；負責組織動員全區公民無償獻血工作；負責區紅十字會的協調工作；負責全區農民大病醫療統籌工作。
內設機構
北京市懷柔區衛生局機構設定：
辦公室
負責全局政務工作，負責組織擬定衛生事業改革與發展規劃和年度計畫；協助主管領導做好機關管理工作等。
政工科
負責向上級組織報告工作的貫徹落實情況。圍繞黨的中心工作，提出貫徹和落實具體意見；責本系統宣傳、精神文明、計畫生育、統戰工作；負責本系統工會、共青團、婦聯工作。
監察科
負責開展反腐倡廉宣傳教育，督促檢查落實黨風廉政建設責任制，查處基層單位黨員、領導幹部違紀違法案件及信訪舉報、申訴案件和監察對象違反行政紀律的行為；開展機關效能建設。
醫政科
負責擬定本區醫療機構設定規劃並組織實施；負責全區大型活動的醫療保障工作組織工作；負責組織開展社區衛生服務管理工作；負責全區醫學研究、醫學繼續教育工作；負責對醫療機構大型醫療設備配置、套用質量和人員實行監督管理；負責醫療機構製劑、藥品（包括毒麻藥品）的具體管理；負責醫療機構對藥品的集中招標採購工作；負責醫學會、基層衛生工作協會的管理工作。
人事科
制定並實施本系統衛生人才培養和發展規劃；負責系統內專業技術人員的聘任工作；負責本系統人才引進和學科帶頭人的選拔工作；負責本系統機構編制、人員調整、工資福利、工作人員年度考核，離退休人員及人事檔案的日常管理工作，對各單位執行養老、失業保障制度進行監督和檢查。
公共衛生科
負責衛生法律法規規章的執法監督管理工作。負責本區傳染病、慢性非傳染性疾病，口腔及精神疾病等的防治工作；監督管理食品、環境、放射、學校、幼稚園衛生；指導、監督母嬰保健專項技術和計畫生育技術的實施。負責全區健康教育和宣傳工作。
計財科
負責機關及本系統的財務工作。負責本系統財政預算、決算工作；負責本系統內部審計工作；負責本系統醫療收費工作；監督、指導本系統事業單位《醫院財務制度》、《事業單位會計制度》及有關財政政策、法律法規的執行。
法制科
負責對衛生方面的法律、法規、規章的執行情況進行監督；制定本區衛生系統法制宣傳教育工作規劃並組織檢查、考核、驗收。
