歷史存在
731部隊
化學部隊在做實驗731部隊是舊日本軍（關東軍）防疫給水部本部的別名。該單位由石井四郎所領導，因此也稱之為“石井部隊”。731部隊也是在抗日戰爭（1937年－1945年）和第二次世界大戰期間，日本陸軍於日本以外領土從事生物戰細菌戰研究和人體試驗相關研究的秘密軍事醫療部隊的代稱，也是大日本帝國陸軍在占領滿洲期間（從1931年到第二次世界大戰結束的1945年）所做的研究之一。731部隊在官方文書上的偽裝為關東軍第659部隊（防疫給水部）下之第731防疫飲水淨化部隊，實際隸屬於日本陸軍軍醫學校防疫研究室，研究內容除了研究防治疾病與飲水淨化以外，更多時候是使用活體人類進行生物武器與化學武器的效果實驗。
516部隊
516部隊是抗日戰爭期間，日本陸軍從事化學作戰的部隊，設於中國東北齊齊哈爾。這支部隊當年極其隱蔽，打著科學研究的旗號，從事化學武器研究、試驗和製造，用中國老百姓活身體做試驗，犯下的罪行遺留到今天。由於516部隊藏匿較深，記載它的史料甚少。
當時，這支部隊共有250多人，下設5個課，主要從事化學武器研究、開發、教育訓練和化學戰的試驗。1945年8月15日，日本投降後，這支部隊的許多機密資料被帶回日本，而大部分裝備和毒劑彈遺留在了中國。
軍事行動
化學部隊2012年4月，朝鮮將發射“光明星3號”地球觀測衛星。離朝鮮發射衛星只剩幾天的時間，日本自衛隊應對這一次發射的攔截行動，除了在首都圈和朝鮮衛星將經過的沖繩南部部署7處愛國者飛彈攔截系統之外，陸上自衛隊還向沖繩諸島派出化學部隊。
化學部隊來自於陸上自衛隊的鹿兒島基地，進駐沖繩縣的石垣島和宮古島等處，化學部隊配備了防化裝甲車和戰備醫院，以防備朝鮮發射衛星的火箭殘骸落入這些島嶼，火箭燃料污染環境時作緊急應對。
