審核程式
收到經營出口產品企業的書面退稅申請後，稅務機關應按照出口退稅的有關政策規定和要求，圍繞出口退稅申請的內容進行審核，審核無誤後，才能予以退稅。
審核一般包括初審、複審和批准退庫三個步驟。先由分管該企業的稅務專管員進行初審，再由本科(股、所)負責人和會計人員複審，送市、縣以上稅務機關負責人再予審核，並簽字批准稅款退付。最後，由專管員或會計人員據以填開收入退還書等法定稅款退還憑證，送邊所在地金庫，所在地金庫根據金庫管理條例進行審核後，據以辦理稅款退庫。
規定
負責審核出口退稅的機關接到企業退稅申報表後，必須嚴格按照出口貨物退稅規定認真審核。經審核無誤，逐級報請負責審批出口退稅的稅務機關審查批准後，填寫《收入退回書》，交當地銀行(國庫)辦理退庫手續。企業提出的申報手續完備、內容真實，主管出口退稅的稅務機關在接到申請之日一個月內應辦完有關退(免)手續。
企業在年度終了三個月內，須對上年出口退稅情況進行全面清算，並將結果上報主管退稅的稅務機關，經審核，多退收回，少退補足。企業年終清算後，主管退稅的稅務機關不再受理企業提出的上年度出口退稅申請。
注意事項
出口退稅的稅務機關必須嚴格按照出口退稅的規定認真審核，經審核無誤後，方可填寫“收入退還書”，交當地銀行辦理退庫手續。在出口退稅審核時，應注意以下事項：
(1)審批時限。主管出口退稅的稅務機關，應自接到申請之日起，1個月內辦理完有關退(免)稅手續。
(2)退關、退貨等的處理。對於企業出口的貨物辦理退(免)稅後，發生退關、國外退貨或轉為內銷的，企業應及時向所在地主管出口退稅的稅務機關辦理申報手續，補繳已退(免)稅的稅款。補繳稅款全部繳入中央金庫。
(3)核對、檢查權。主管出口退稅的稅務機關在審核退稅過程中，應到企業調查核對有關退稅憑證和賬物，並在必要時可對出口貨物的經營情況進行全面檢查。
(4)年終清算。企業年度終了後3個月內，須對上年度的出口退稅情況進行全面清算，並將結果報主管出口退稅的稅務機關。稅務機關對企業的清算報告進行審核，多退少補。企業清算後，稅務機關不再受理企業提出的上年度出口退稅申請。
另外，對外商投資企業申報退(免)稅的，涉外稅收管理機關接到企業退(免)稅申報表後，必須認真審核，並在15日內審核完畢。經審核無誤後，報上級涉外稅收管理機關審核，在15日內審核完畢，並送當地進出口稅收管理部門審核並辦理退庫手續。進出口稅收管理部門必須在接到有關材料後，30日內辦理完有關退稅手續。
外貿企業出口
出口退稅審核一般分為預審、單證對審、計算機審核等三個環節。
1．預審
退稅機關在受理外貿企業的正式申報前，應對申報數據在“退稅申m/退稅申報預處渺退稅申報預審”中進行預審。預審發現疑點，應按規定進行調整或進行出口貨物稅收情況函調。
2．單證對審
稅務機關受理出口商出口貨物退(免)稅申報後，應在規定的時間內，對申報憑證、資料的合法性、準確性進行審查，並核實申報數據之間的邏輯對應關係。
3．計算機審核
稅務機關應當使用出口貨物退(免)稅電子化管理系統進行計算機審核，審核、核對的重點內容包括：
(1)出口報關單電子信息。出口報關單的海關編號、出口日期、商品代碼、出口數量及離岸價等項目是否與電子信息核對相符。
(2)代理出口證明電子信息。代理出口證明的編號、商品代碼、出口日期、出口離岸價等項目是否與電子信息核對相符。
(3)出口收匯核銷單電子信息。出口收匯核銷單號碼等項目是否與電子信息核對相符。
(4)出口退稅率文庫。出口商申報出口退(免)稅的貨物是否屬於可退稅貨物，申報的退稅率與出口退稅率文庫中的退稅率是否一致。
(5)增值稅專用發票電子信息。增值稅專用發票的開票日期、金額、稅額、購貨方及銷售方的納稅人識別號、發票代碼、發票號碼是否與增值稅專用發票電子信息核對相符。在核對增值稅專用發票時應使用增值稅專用發票稽核、協查信息。暫未收到增值稅專用發票稽核、協查信息的，稅務機關可先使用增值稅專用發票認證信息，但必須及時用相關稽核、協查信息進行覆核；對覆核有誤的，要及時追回已退(免)稅款。
(6)消費稅稅收(出口貨物專用)繳款書電子信息。消費稅稅收(出口貨物專用)繳款書的號碼、購貨企業海關代碼、計稅金額、實繳稅額、稅率(額)等項目是否與電子信息核對相符。
