機構領導
局長：馮先民
副局長：周仁孟
副局長：羅時新
副調研員：夏紀敏
調研員、機關黨委書記：舒貴龍
領導分工
楊成軒局長 主持全面工作，分管人事、財務工作 。
周仁孟副局長 分管監察支隊、環科所（科環公司）、環境信息監控中心。負責環境信訪、環境安全、招商引資、環境信息化等工作。
羅時新副局長 分管總量控制科（污防科）、監測站、核與輻射環境監督站、機動車污染管理辦公室、環境科學學會。負責節能減排、環境統計、環境規劃編制及項目申報等工作。
夏紀敏紀檢組長 主持紀檢監察工作，分管自然生態科、黨建工作，協助分管人事工作。負責市生態辦、機關效能、政行風建設等工作。
舒貴龍調研員 主持機關黨委工作。分管工會、共青團、婦女兒童、老齡、計畫生育、精神文明建設及聯鄉包村扶貧工作。
內設機構
辦公室（宣教法規科） 主要職責:
協助處理局機關日常工作；負責綜合性、規範性檔案的起草、重要會議的組織、文秘、保密、檔案、機關財務等工作；負責機關基建、物資保管、車輛管理、治安保衛、計畫生育、老幹部等各項行政後勤工作。 負責局機關及直屬單位人事管理工作，全市環保系統專業技術人員管理工作。 負責環境法制工作，組織環境保護行政處罰、行政複議和應訴工作；組織開展環保宣傳教育及“綠色創建”工作；負責政府信息公開工作和人大、政協定案、提案辦理及信訪處理工作。
環境影響評價科（行政審批服務科） 主要職責:
擬定並組織實施建設項目環境影響評價、“三同時”等各項環境管理制度和措施；按有關規定承辦建設項目的環境影響評價檔案的審批工作；組織辦理各項行政審批工作和政務服務中心視窗工作。
污染物排放總量控制科（污防科） 主要職責:
承擔全市主要污染物減排日常工作；擬訂主要污染物排放總量控制和減排工作計畫、對策建議；檢查、督促和考核縣、區和有關單位環境保護目標責任制和污染減排工作情況。
擬定並組織實施全市環境保護規劃；組織擬定和實施重點水域、區域污染防治規劃；負責環境保護統計工作；負責污染治理項目的申報工作；監督管理市級環境保護能力建設投資和環境保護污染治理投資項目的實施情況；組織實施大氣、土壤、噪聲、固體廢物、有毒化學品以及機動車等污染防治政策和規定；污染源限期治理、有毒化學品進出口登記、行政代執行等環境管理制度；組織編制環境功能區劃；負責城市環境質量綜合整治工作。
自然生態保護科 主要職責:
負責鄉（鎮）、村自辦、聯辦以及在鄉（鎮）、村範圍內從事個體私營企業的建設項目及自然資源開發項目的環境影響報告書（表）的審批；組織編制全市生態保護規劃；組織實施生物多樣性保護和農村生態環境保護工作；監督自然資源開發活動中的環境保護工作；指導和監督生態破壞恢復整治，濕地環境保護工作；調查處理重大生態破壞事件；指導全市生態示範和生態農業建設，監督管理鄉鎮企業環境保護；提出新建國家級、省級自然保護區的申報建議和新建各類市級自然保護區的審批建議；監督管理各類自然保護區；開展全市生態狀況評估。
負責六安生態市建設領導小組辦公室日常工作。
機關黨委主要職責：
負責機關及直屬事業單位的黨群工作。
直屬事業單位
環境監測中心站
職責：參與制定全市的環境監測計畫；負責環境要素的常規監測、污染源監督監測和污染事件的調查；編寫全市環境質量報告書；開展環境監測技術研究；參加制定和修訂環境標準和技術規定，負責全市環境監測質量保證工作；對各區、縣環境監測站進行業務、技術指導和負責全市環境監測網業務上的組織協調；承擔全市綜合性環境調查和環境污染糾紛的技術仲裁等。
環境監察支隊
職責：主要負責"三查兩調一收費"即查污染源排放情況、查環保設施的運行、查"三同時"項目執行情況；事故調查、民眾矛盾調查；徵收排污費。負責指導本市各區、縣環境監察部門的業務工作。負責環保應急熱線日常運行和管理。
環境科學研究所
職責：圍繞六安社會、經濟發展、環境保護和城市建設的中心任務，開展前瞻性、套用性環境課題研究，為環境管理提供決策諮詢和技術支持；開展環境影響平價，環境工程設計、施工為企業環境保護服務，組織推廣清潔生產和環境標準論證。
機動車污染管理辦公室
職責：：負責全市機動車污染的行業管理；負責全市機動車污染監測儀器的管理、校正、鑑定工作負責全市機動車污染的監測工作；負責全市機動車污染監測合格證的印製、發放，管理工作；負責全市機動車生產、維修單位出廠機動車污染管理、監測工作；負責全市機動車污染管理裝置、設備的監製、鑑定、調試、安裝工作；負責編制全市機動車污染狀況報告；承辦市環保局交辦的其他工作。現階段以抓好全市機動車污染監測管理、達標辦證為重點開展管理工作。
環境產業中心
職責：圍繞六安社會、經濟發展、環境保護和城市建設的中心任務，開展前瞻性、套用性環境課題研究，為環境管理提供決策諮詢和技術支持；開展環境影響平價，環境工程設計、施工為企業環境保護服務，組織推廣清潔生產和環境標準論證。
環境信息監控中心
職責：1、組織制訂本市環境信息化建設管理規劃，開展環境信息化管理建設工作。2、負責全局業務信息、技術信息、環境數據的歸口集中管理、共享以及發布，組織開展環境信息資源的開發研究和綜合利用工作，對各類環境信息進行收集、加工和整理，建立和完善環境基礎資料庫，及時向上級環境信息部門提供環境信息。3、負責環境保護政府網站的建設、維護、更新和改版工作，對發布的環境信息進行備案和審查。4、負責全局辦公自動化及電子政務的普及、培訓、推進工作，對局系統內部計算機硬體設備更新和套用軟體開發進行統一管理，保證網路設備正常運行，保證網路系統的安全和暢通。
