主要職責
一是協助畜牧行政主管部門擬定畜牧業有關法律、法規和政策建議，受委託承擔全國畜牧業管理的具體工作，提出行業重大技術進步措施建議。
二是研究提出全國畜牧業技術推廣規劃和體系建設規劃，指導全國畜牧業技術推廣體系建設及推廣機構、飼料工業協會的業務工作，組織開展全國畜牧業技術推廣和專業技術人員培訓，負責全國畜牧業職業技能鑑定工作。
三是承擔畜禽、牧草、飼料品種資源的調查、保護與管理工作；組織實施相關品種的審定、登記、引進、繁育、推廣工作。
四是承擔畜牧業產品質量安全管理和認證及相關標準和技術規範的擬訂工作；推廣畜禽健康飼養方式，承擔養殖環境監測與監督管理工作。
五是承擔畜牧業統計和經濟運行分析工作；承擔畜牧業市場體系建設和畜產品加工業務指導工作；組織開展畜牧業技術合作與交流；開展畜牧業國際貿易相關政策、法規研究，參與協調國際貿易爭端。
六是承擔畜牧業行政許可事項及國家級畜禽遺傳資源保護場、保護區和基因庫的審核工作；承擔畜牧業項目的相關管理工作。
七是組織實施草場改良和草原病蟲鼠害防治工作；承擔草原監測的技術支持與服務工作。
八是承擔中國飼料工業協會的日常工作；組織開展飼料行業自律性管理和行業評價，指導企業改革與管理；承擔畜牧業相關技術委員會的日常工作，指導掛靠社團的業務工作等。
內設機構
下設15個處室和3箇中心，即辦公室、人事處（黨委辦公室）、財務處、項目與資產管理處、行業統計分析處、國際合作處、體系建設與推廣處、質量標準與認證處（無公害畜產品認證中心）、牧業發展處、草業處、飼料行業指導處、奶業與畜產品加工處、協會工作處、飼料評審處、畜禽資源處、信息中心、農業部全國草產品質量監督檢驗測試中心、農業部種畜品質監督檢驗測試中心（畜禽牧草種質資源保存利用中心）。
