在尾張三本木村之戰中立功。是役中因為伊東長久沒有頭盔,只好帶編笠出戰,織田信長當場替他取了“編笠清藏”的外號(武家事紀)。永祿年間信長選拔赤母衣眾,伊東長久也被選入。在1570年的小谷城之戰中相當活躍,於是信讓他一字拜領自己的“長”字,把名字由“祐之”改為“長久”(小川榮一氏文書)。
在羽柴秀吉入主北近江後,伊東長久和兒子長實被派為與力協助,歷任腰母衣眾、旗奉行等職位,1584年4月,參加小牧長久手之戰(淺野家文書)。翌年8月,在攻打佐佐成政途中,伊東長久於金澤病故(武家事紀)。
後來其子伊東長實成為岡田藩主,明治維新後仍被列為華族。